【科研绘图系列】R语言绘制论文组合图形（mulitple plots）

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介绍

这篇文章详细介绍了如何使用R语言进行跨平台和跨仪器的蛋白质组学数据比较分析，并生成了多个补充图表（Supplementary Figures）。这些分析和图表为研究人员提供了深入理解不同蛋白质组学工作流性能的工具。以下是文章的主要内容和步骤：

文章首先介绍了如何从多个数据文件中读取蛋白质组学数据，并进行预处理。具体步骤包括：

1. 使用read.table和read_excel函数读取不同平台和仪器下的蛋白质组学数据。
2. 对数据进行筛选，去除某些指标值为零的行。
3. 根据不同的处理步骤（如矩阵类型、缺失值处理、归一化等），对数据进行分组和筛选。

文章接着展示了如何比较不同平台和仪器下的蛋白质组学数据。具体步骤包括：

1. 使用top1wf和top1wf_ens函数获取每个平台和仪器下的顶级工作流和集成方法的结果。
2. 计算