使用ITK库读取DICOM系列并生成3D图像

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本文介绍了如何利用ITK(医学图像处理工具包)库读取DICOM系列文件,并将其转换为3D图像。首先确保安装ITK库,然后导入所需模块,指定DICOM文件路径,读取系列并生成图像,最后保存3D图像为NIfTI格式。提供完整代码示例供参考。

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DICOM(数字图像与通信医疗)是医学图像的标准格式,常用于存储和传输医学图像数据。在本文中,我们将使用ITK(医学图像处理工具包)库来读取DICOM系列,并将其转换为3D图像。

首先,确保已经安装了ITK库。可以使用以下命令来安装ITK库:

pip install itk

在安装完成后,我们可以开始编写代码。首先,导入所需的ITK模块:

import itk

接下来,我们需要指定DICOM系列的路径。假设DICOM系列文件夹存储在名为dicom_series的文件夹中,可以使用以下代码指定路径:

dicom_series_path = 'dicom_series/'

然后,我们使用itk.ImageSeriesReader来读取DICOM系列。代码如下所示:

reader = itk.ImageSeriesReader
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