机器学习代谢组学分析全流程 高分文章“利器”!

代谢组学是对某一生物或细胞在一特定生理时期内所有代谢产物同时进行定性定量分析的学科,被广泛用于揭示小分子与生理病理效应间的关系。目前,代谢组学已经被应用于药物开发的各个阶段(如药物靶标识别、先导化合物发现、药物代谢分析、药物响应和耐药研究等)。基于代谢组学的高性价比特性,它被药学领域的研究者给予了厚望,有望加速新药开发的进程。然而,代谢组领域还面临着严重的信号处理与数据分析问题,对其在新药研发中的应用构成了巨大挑战。为了有效消除由环境、仪器和生物因素所引入的不良信号波动,就需要开发针对代谢组信号系统优化的新方法,为不同组学研究量身定制最优的数据分析策略。

目标:1.理解代谢生理功能和代谢疾病,熟悉技术及其应用。2.了解代谢组学实验流程、数据处理技巧,以及色谱、质谱和LC-MS技术。3.熟悉关键代谢通路和数据库,利用R软件进行分析和可视化。4.理解机器学习在代谢组学中的作用,掌握R语言进行分析。5.使用R语言进行数据清洗与分析,通过文献解读和复现增强研究创新能力

第一天

A1代谢物及代谢组学的发展与应用                            

(1) 代谢生理功能;

(2) 代谢疾病;

(3) 非靶向与靶向代谢组学;

(4) 空间代谢组学与质谱成像(MSI);

(5) 代谢流与机制研究;

(6) 代谢组学与药物和生物标志物。

A2代谢组学实验流程简介

A3色谱、质谱硬件原理

(1) 色谱分析原理;

(2) 色谱的气相、液相和固相;

(3) 色谱仪和色谱柱的选择;

(4) 质谱分析原理及动画演示;

(5) 正、负离子电离模式;

(6) 色谱质谱联用技术;

(7)LC-MS的液相系统

A4代谢物样本处理与抽提

(1)组织、

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