dicom 文件转nii （坐标系转换）

1. NIfTI 坐标系与 DICOM 坐标系的差异

DICOM 坐标系：

• 使用 左手系：
  • X 轴：从患者左侧到右侧（L → R）。
  • Y 轴：从患者背部到前部（P → A）。
  • Z 轴：从患者脚部到头部（F → H）。

NIfTI 坐标系：

• 使用 右手系：
  • X 轴：从左到右。
  • Y 轴：从后到前。
  • Z 轴：从下到上。

由于这两个坐标系的手性不同，在从 DICOM 转换到 NIfTI 时，方向可能会发生翻转。这会影响 image_position_patient 的计算和显示。

如果不进行坐标系转换，代码如下

def dicom_to_nifti(dicom_path, output_nii_path):
    # 获取所有 DICOM 文件路径
    dicom_files = [os.path.join(dicom_path, f) for f in os.listdir(dicom_path) if f.endswith('.dcm')]

    # 加载 DICOM 数据并按 InstanceNumber 排序
    dicom_data = [pydicom.dcmread(f) for f in dicom_files]
    dicom_data.sort(key=lambda x: float(x.ImagePositionPatient[2