BioRunYiXue的博客

原创 【伯远严选】考马斯亮蓝快速蛋白染色液

原创 一文讲清楚流式细胞术的应用及结果处理

流式细胞术（Flow Cytometry，FCM）是一种高效的用于单细胞分析/分选的生物学技术，其集细胞生物化学技术、单克隆抗体技术、激光技术、流体力学、电子技术、计算机技术、分子生物学、临床医学等理论于一体。FCM能够对大量的细胞或非细胞颗粒的物理、生理、生化、免疫、遗传、分子生物学性状及功能状态等进行定性或定量检测。

原创 【业务介绍】邻近标记技术

原创 【业务介绍】非靶数据库包括5W+物质，检出高达1500种

非靶向代谢组学（Untargeted metabolomics）是一种分析生物样本中所有可检测代谢物的方法。其中LC-MS非靶向代谢组学是一种利用液相色谱-质谱联用技术（LC-MS）无偏向性地检测生物体内所有小分子代谢物的动态变化的技术。由于环境对生物体的影响会最终体现为代谢物的变化，因此LC-MS非靶向代谢组学在动物生长发育、疾病生物标志物（Biomarker）筛选、药物研发等领域的应用越来越广泛。

原创 【文献速递】ASO35-58导致EZH2的外显子14跳跃从而抑制肝癌发生

ASO的一端可以识别并锁定目标RNA上的特定位点，另一端则可以引导细胞内的各种机制来改变RNA的命运。同时，ASO35-58的作用还导致了一种截短的EZH2Δ14（缺少外显子14的突变体）蛋白的产生。通过minigene实验，构建包含不同缺失区域的片段，并将其转染到细胞中，当外显子14中的特定序列（如29-42位置）缺失时，外显子14的跳跃显著增加。它通过与外显子14上的SRSF3结合位点相互作用，阻断了SRSF3与EZH2基因的结合，使得外显子14无法被正常识别和包含，从而实现了对外显子14的跳跃调控。

原创 【业务介绍】邻近标记的应用场景

原创 【限时特惠】非靶+DlA历史低价

原创 癌症爆发真相：90%风险来自环境，表观遗传才是关键钥匙！

DNA甲基化作为一种高度保守的表观遗传修饰机制，是在不发生DNA序列改变的前提下，通过对特定碱基位点的化学修饰（如胞嘧啶的C-5位、腺嘌呤的N-6位或鸟嘌呤的N-7位）来调控DNA片段活性并影响遗传表现的过程，这些修饰分别由特异性的甲基化酶催化，生成5-甲基胞嘧啶（5-mC）、N6-甲基腺嘌呤（N6-mA）和7-甲基鸟嘌呤（7-mG）等产物。在这场基因与环境的较量中，表观遗传学正成为预测和干预癌症风险的全新突破口，深入理解环境因素诱导的表观遗传改变及其分子机制，对于预防和缓解环境驱动的疾病具有重要意义。

原创 【业务介绍】minigene临床应用

原创 【业务介绍】血浆蛋白质组学

原创 从经典文献案例看中药入血的研究思路

文章中选取的两篇经典案例，无论是从研究方法、写作思路、结果展示等方面，都可以为从事中药入血成分研究的科研工作者提供很好的思路。首先，作者采用UPLC-Q-TOF-MS方法对大鼠血清样本中可吸收的YSH代谢物进行鉴定，结果鉴定出了25种化合物，包括没食子酸、己内酰胺、黄碱、苯甲酸、维采宁2、夏佛塔苷、异夏佛塔苷、维采宁3、阿魏酸、异槲皮苷、白前苷B、槲皮苷、槲皮素、3-O-甲基槲皮素、毛蕊异黄酮、汉黄芩素、熊果胆酸、紫铆因、脱氨基酪氨酸、甘松酮、熊果苷、单棕榈酸甘油、亚油酸、棕榈酸和豆甾醇等。

原创 【业务升级】Astral鉴定，极速交付

原创 Epigenetics ATAC-seq助力解析炎症性细胞因子IL-1刺激引起的动态染色质可及性变化

炎症性细胞因子，特别是白细胞介素-1（Interleukin-1, IL-1），在病原体和有害物质的宿主反应中发挥关键作用，针对IL-1相关细胞因子的抑制剂在临床治疗中具有重要价值，尤其是在自身炎症性疾病的治疗中（Palomo et al., 2015）。作者使用对IL-1刺激具有良好响应特性的软骨肉瘤细胞系SW1353作为实验材料，利用ATAC-seq技术，评估了细胞经IL-1处理后染色质可及性的变化，以及这些变化如何与基因表达调控相联系，进而为炎症性疾病的潜在治疗策略提供新的见解。

原创 【业务介绍】流式细胞检测一站式服务

原创 一文解析Minigene技术原理及应用

可以看到c.80+1G>A，c.132C>T,c.213-1G>A，c.670+1delG，c.670+16G>A，c.4185+1G>A，c.5075-1G>C，c.4676-20A>G产生了Pre-mRNA剪接的改变（可见凝胶电泳图），而突变型c.-19-22_19-21dupAT，c.302-15C>G，c.547+14delG，c.4987-21G>T，c.5278-14C>G未发生Pre-mRNA剪接变化。特定的剪接变体可以作为某些疾病的生物标志物，用于早期诊断或疾病进展的监测。

原创 【业务介绍】转录组测序+qPCR验证

原创 【业务介绍】外显子测序+minigene验证

原创 【文献速递】MUL1促进HSPA9的SUMO修饰来调控膀胱癌淋巴结转移

为了进一步明确SUMO修饰在HSPA9亚细胞定位中的作用，研究人员用不同浓度的SUMO修饰抑制剂ML792处理T24细胞，随后分离线粒体和细胞质部分，并通过WB检测HSPA9在线粒体和细胞质中的水平。这一发现表明ML792的加入抑制了HSPA9从线粒体向细胞质的转位，从而暗示MUL1介导的HSPA9转位是依赖于SUMO修饰的。通过这种方式，研究人员巧妙地利用药理学手段干预SUMO修饰过程，进一步证实了SUMO修饰在HSPA9亚细胞转位中的关键作用，也为研究MUL1对HSPA9调控机制提供了有力证据。

原创 【业务上新】外泌体蛋白质组学

原创 【业务上新】基因编辑细胞系

原创 深度剖析CUT & Tag技术，精准操控基因组的革命性工具

综上，作者通过CUT & Tag技术证实YY1 乳酸化通过上调炎性细胞因子分泌和促进细胞迁移和增殖来促进自身免疫性葡萄膜炎中的小胶质细胞功能障碍，靶向乳酸/p300/YY1 乳酸化/炎症基因轴，可以达到治疗自身免疫性葡萄膜炎的效果。Cut & Tag首先利用固定在刀豆蛋白A（ConA）磁珠上的抗体精准定位到基因组上的目的蛋白，然后将二级抗体作为Tn5转座酶的锚定物，在靶蛋白结合位点附近引导染色质DNA的切割的同时插入NGS测序接头，进而通过测序技术获取目的蛋白结合的DNA序列信息。

原创 【业务介绍】蛋白互作技术大全

原创 靠谱protocol网站，助你科研无忧

即使得到真的protocol，还需更加耗时耗力的进行各种优化，最终仍旧得到一堆错误的实验结果，劳心伤神。目前Current Protocols已经收录超过25000种实验技术和流程介绍，涉及分子生物学、生物化学、医学、生理学等领域，包含实验所需的所有信息（包括实验简介、材料清单和货号、详细的实验步骤和注释、试剂和溶液的配方、说明性图标和信息表格等），并且每篇文章都提供了关于数据分析和解释、背景信息、方法应用、重要假设、关键参数、时间因素以及帮助避免常见陷阱和排除实验故障的提示和问题讨论等。

原创 【业务上新】外泌体功能研究一站式服务平台

原创 【业务介绍】医学全业务介绍

原创 蛋白互作检测之FRET荧光共振能量转移：分子间距离的微妙舞者

其基本原理是，当两个荧光分子——供体（Donor）和受体（Acceptor）在1-10nm的空间距离时，供体分子被激发后，如果其发射光谱与受体分子的吸收光谱有重叠，供体可以通过非辐射的方式将能量传递给受体。绿色荧光蛋白类有CFP-YFP，BFP-GFP，BFP-YFP，CFP-YFP-mCherry等，染料类有Cy3-Cy5，FITC-Rhodamine等，并且这些荧光物质要能够标记在研究对象上。：供体分子在发射态下的偶极矩与受体分子在吸收态下的偶极矩，以及它们之间的相对向量方向，必须满足特定的条件。

原创 【业务上新】文库智选，筛出未来

原创 【业务介绍】外泌体研究应用场景

原创 什么是相分离？相分离在人类疾病中的应用

2009年，相分离被引入到生物学研究中，特指生物大分子在胞内凝聚的特殊状态，描述的是胞内不同成分间相互碰撞、融合形成液滴，从而使一些成分被包裹在液滴内，一些成分被阻隔在液滴外的现象，用以解释胞内通过分子相分离，组织调控内部环境，形成无膜细胞器（如：核仁、miRISC、中心体、PML小体、应激颗粒、P颗粒、异染色质及突触的细胞骨架等等）。细胞是生物体结构和功能的基本单位，在漫长的进化过程中，为实现胞内各组分有序执行相应的功能，在漫长的进化过程中，演变出了一系列无膜和有膜（又分为单膜、双膜）细胞器。

原创 【业务上新】FRET技术介绍

原创 【业务介绍】FRET应用场景

原创 Nature及子刊通过多组学揭秘生酮饮食抗癌和减肥机制

生酮饮食在脑肿瘤、乳腺癌、肺癌、消化系统肿瘤等不同类型肿瘤治疗中发挥着重要作用，其发挥作用的机制可能是多方面的，通常包括以下几点：（1）肿瘤细胞的代谢特点包括葡萄糖摄取增加、胆固醇合成增加、磷酸戊糖途径活跃、支链氨基酸摄取和代谢增加等（Seyfried et al., 2022）。首先用生酮饮食或普通饮食喂养小鼠，对这些小鼠的空腹血清进行靶向代谢组学分析，发现生酮饮食提高血清牛磺脱氧胆酸（TDCA）和牛磺熊去氧胆酸（TUDCA）的水平，降低体重和空腹的血糖水平。的表达，减少肠道脂质吸收来抵抗肥胖。

原创 【业务上新】邻近连接技术（PLA）介绍

原创 【业务介绍】minigene技术

原创 【业务上新】PLA应用场景

原创 一文读懂｜RNA Pull-down实验流程（值得收藏）

RNA Pull-down更倾向于通过目标RNA（已知的RNA）去找到相互作用的未知蛋白，而RIP技术则更多应用于通过目标蛋白（已知蛋白）去找到相互作用的未知RNA。为了方便RNA-蛋白的富集，需要在RNA 3'端进行生物素标记或者标签标记，然后与链霉亲和素磁珠结合，通过磁分离实现RNA-蛋白的富集。右图：体外转录标记RNA的电泳；伯远医学拥有一流的技术团队、丰富的项目经验，提供专业RNA Pull-down技术服务，适用于RNA与蛋白结合的领域研究，欢迎大家前来咨询RNA Pull-down实验。

原创 【业务升级】Astral鉴定，极速交付

原创 Minigene实验——RNA剪接事件检测利器

在RNA剪接过程中，mRNA前体内含子两端边界通常存在共同序列（5’-GU-----GA-3’）作为剪接识别信号，其中5'-GU为剪接供体信号，3'-AG为剪接受体信号，这种识别5'-GU---GA-3'序列的剪接模式被称为GU-AG法则或Chambon法则。经典剪接变异是发生在GU-AG区域的变异，非经典变异则通常指UTR区变异、外显子内部非剪接区变异、外显子同义突变以及外显子错义突变等，这些发生在不同区域的变异都可能导致RNA出现异常剪接，并通过minigene实验进行验证。

原创 【业务上新】RNA Pull-down

原创 NCBI保姆级使用教程（包含如何查找CDS、启动子、5‘UTR和3‘UTR、lncRNA序列）

另外，在基因相关信息页面，下拉找到“NCBI Reference Sequences(RefSeq)”条目，在“mRNA and Protein(s)”里可以看到有不同的转录本，其中mRNA一般是“NM”开头，非编码RNA一般以“NR”开头，还有一种“XM”开头是生物信息预测的转录本。在主页的search框中输入您感兴趣的关键词，例如疾病名称、基因名称或特定的生物化学物质等。进入NCBI网站，选择“Gene”，在search框中输入感兴趣的基因的名称、基因ID或相关的生物物种，以“P53”为例。