【文献速递】结合AI解析解毒三根汤对抗结直肠癌的生物活性成分

2025年4月21日,浙江省中医院阮善明教授团队在Phytomedicine(IF:6.7)上发表了题为“Bioactive components of Jiedu Sangen decoction against colorectal cancer: A novel and comprehensive research strategy for natural drug development”的研究性论文。

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 01 研究背景

解毒三根汤(JSD)因其良好的临床疗效,在中国南方被广泛用于治疗结直肠癌(CRC)患者,但其有效活性成分尚不清楚。

02 研究目的

本研究基于创新的综合性研究策略,全面探索了JSD的生物活性成分,通过层次分析法-自组织映射机器学习算法和分子动力学模拟系统筛选JSD中最具潜力的生物活性成分和关键靶点,为天然药物开发提供了新的视角。

03 研究方法

本研究通过UPLC-MS/MS筛选JSD及大鼠给药后血浆中的活性成分,结合网络药理学分析与机器学习筛选出核心药效物质;通过RNA-seq对比分析JSD干预SW620结直肠癌细胞前后的差异表达基因,并运用生物信息学分析,挖掘关键靶点的临床生物学意义。进而对候选活性成分与治疗靶点,通过分子对接、分子动力学模拟、功能验证实验进行验证。

04 研究结果

JSD在体外显著降低了CRC的增殖。UPLC-MS/MS从大鼠血浆中鉴定出18种JSD的原型成分和8种潜在代谢产物。网络药理学结合机器学习筛选出3种核心活性物质(染料木黄酮、阿福豆甙、白藜芦醇);RNA-seq结合生物信息学分析筛选出抗CRC的6个关键靶点。对3个核心活性成分与6个关键靶点进行分子对接分析,结果显示白藜芦醇-CA9、染料木素-NOTUM和荭草素-DPEP1这三组配对均表现出最低结合能。分子动力学模拟进一步证实,这三种小分子在对应蛋白结合位点均能保持稳定结合,且未引发明显的蛋白构象变化。体外功能实验表明,白藜芦醇通过靶向CA9激活PI3K/AKT信号通路,促进结CRC凋亡;而染料木黄酮则通过抑制NOTUM 表达,下调β-catenin信号通路抑制CRC增殖。

05 研究结论

本研究建立了一种全新的、全面的研究策略,以阐明JSD抗结直肠癌的活性成分和药理机制,并为天然药物的开发提供了支持。

图1 JSD作用机制示意图(Zheng et al., 2025)。

参考文献

[1]Xueer Zheng, Chao Shi, Ying Xie, et al. Bioactive components of Jiedu Sangen decoction against colorectal cancer: A novel and comprehensive research strategy for natural drug development[J].Phytomedicine, 2025, 142:156795.

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