最近在做MRI脑部图像方向的东西,首先需要把拿到的MRI图像进行颅骨剥离,一开始说使用老师推荐的bet2,怎么调整参数效果都非常差,看了网上帖子,又尝试了CAT12,操作起来有点儿复杂,教程写的也看不懂,最后看到Deepbet的文章,一次尝试就成功了。
FSL-BET2
官方安装教程
参考了如下教程:Andy’s Brain Book
Windows需要WSL2,第一次安装WSL应该很轻松,如果之前安装过现在装不上可以留言一下,有需要我就再写一个教程。
效果展示
1、Flanker数据集
可以看出来效果非常不错,阈值我都没怎么调过
2、我的数据集上
不论怎么调-f -g 效果都很差,-R也没啥改善
SPM-CAT12
官方安装教程
Andy’s Brain Book
1、我的数据集上的结果
看着效果也不错,但是剥离后的结果和原来的颜色差别有点儿大
这个操作界面也挺复杂的,处理起来也挺慢
Deepbet
这简直是我的神了,我是从这篇zh帖子上看到的链接
官方安装教程
1、Flanker数据集结果
效果可以,参数为默认值
2、我的数据集结果
参数默认效果都很好
踩坑结束,总结而言,Deepbet处理速度、效果都是非常好的