【R语言】AUC值的检验(单样本t检验)

之前的推文中介绍了ROC曲线的本质以及两面性：这些现在都有成熟的R包可以帮我们搞定，不需要我们手动计算。不过这些包在计算AUC时，默认是计算阳性结果的AUC，这在实际情况中有时会遇到问题，大家在使用时最好手动指定，到底是计算谁的AUC，关于ROC的两面性，可以参考上面的推文。这里以我最常用的ROCR和pROC进行演示。

它衡量的是模型的预测结果在不同阈值下的真阳性率和假阳性率之间的面积。AUC的取值范围在0到1之间，数值越接近1表示模型性能越好。需要注意的是，上述示例中使用了随机生成的预测结果和真实标签作为示例数据。在实际应用中，您需要根据自己的数据和模型结果进行相应的替换。在R语言中，可以使用多个包来计算AUC指标，最常用的包包括。接下来，假设我们有一个二分类模型的预测结果。运行以上代码，将得到AUC指标的计算结果。通过以上步骤，您可以使用R语言中的。包为例，演示如何计算AUC指标。是模型预测的概率值。

AUC值是ROC曲线（Receiver Operating Characteristic Curve）下的面积，ROC曲线是以不同的分类阈值为基础，绘制出真阳性率（True Positive Rate）（也称为灵敏度）和假阳性率（False Positive Rate）之间的关系曲线。请注意，以上代码仅提供了使用pROC包计算AUC值的示例，实际上R语言中还有其他包和方法可用于计算AUC值，如ROCR包、caret包等。在实际应用中，AUC值可以帮助我们比较不同模型的性能，并选择最佳的模型。

样本量的大小直接影响到研究的效力和结果的可靠性。当我们想要确定所需的样本量时，一个重要的因素是效用值。在本文中，我们将使用R语言来计算在给定效用值的情况下所需的样本量。总结起来，本文介绍了如何使用R语言计算在给定效用值的情况下所需的样本量。通过计算所需的样本量，研究人员可以更好地设计他们的研究，以达到所需的效用值和统计功效。接下来，我们需要确定一些输入参数，包括所需的效用值、显著性水平、研究效果的大小和其他统计参数。你可以根据自己的研究设计和需求，调整输入参数来计算所需的样本量。参数表示所需的效用值，

R语言deLong's test：使用自定义函数检验两个ROC曲线的差异是否具有统计显著性、比较两个或多个相关ROC曲线的AUC的非参数检验

微信公众号：医学统计与R语言如果你觉得对你有帮助，欢迎转发输入1："rio")结果1：GenderRaceAgeIncomeCigarettesSmoking_status输入2：m3<-lrm(Smoking_status~.,x=T,y=T,data=bilog)newdata<-bilog[101:200,]pred.lg<-pre...

1.回归模型评估度量回归模型的表现度量方式： RMSE：均方误差平方根 校正R^2：对 原始R^2的改进 Cp：在训练集的RSS上加上惩罚 AIC和BIC:基于最大似然值，对参数进行惩罚2.分类模型评估度量分类是指对给定观测样本预测其所属类别，而且类别空间已知，它是有监督学习。> library(dplyr) > library(randomForest) > library(caret)

AUC(ROC)AUC()所属R语言包：ROCfunctionals of ROC curve函的ROC曲线译者：生物统计家园网 机器人LoveR描述----------Description----------various functionals of ROC (Receiver Operating Characteristic) curvesROC(受试者工作特征)曲线的各种函用法-----...

R语言使用pROC包绘制ROC曲线实战：roc函数计算AUC值、plot.roc函数绘制ROC曲线、添加置信区间、为回归模型中的每个因子绘制ROC曲线并在同一个图中显示出来 目录 R语言使用pROC包绘制ROC曲线实战：roc函数计算AUC值、plot.roc函数绘制ROC曲线、添加置信区间、为回归模型中的每个因子绘制ROC曲线并在同一个图中显示出来 #ROC曲线是什么？ #导入包和数据 #使用roc函数计算AUC值及其置信区间（基于bootstrap方法） #直接将roc函数嵌入plot.

本文首发于公众号：医学和生信笔记 “ 医学和生信笔记，专注R语言在临床医学中的使用，R语言数据分析和可视化。主要分享R语言做医学统计学、meta分析、网络药理学、临床预测模型、机器学习、生物信息学等。 R语言临床预测模型系列文章，目前已更新20+篇内容，持续更新中，欢迎订阅！ 今天说一说ROC(AUC)的比较。 二分类资料的ROC比较 可以通过pROC包实现的，使用其中roc.test()函数可实现两个ROC 的Delong检验。 使用pROC包的aSAH数据，其中outcome列是结果变量，1代表Goo

** R语言 ROC曲线 截断值、特异性、敏感性和曲线下面积AUC值的计算和显示 R语言绘制ROC曲线在临床医学中的应用 ** #计算体脂率对诊断妊娠期糖尿病的ROC曲线、截断值 sumExcel1.2018合4_列合并症<- read.csv(“C:\Users\Desktop\sumExcel1_2019071.csv”,sep = “,”,header = TRUE)#读取数据，exc...

K倍交叉验证配对t检验 比较两个模型性能的K倍配对t检验程序 from mlxtend.evaluate import paired_ttest_kfold_cv 概述 K-fold交叉验证配对t检验程序是比较两个模型（分类器或回归器）性能的常用方法，并解决了重采样t检验程序的一些缺点；然而，这种方法仍然存在训练集重叠的问题，不建议在实践中使用[1]，应该使用配对测试5x2cv等技术。 为了解释这种方法是如何工作的，让我们考虑估计量（例如，分类器）A和B。此外，我们有一个标记数据集D。在公共保持方法中，我们

在R语言中，可以使用pROC包来绘制和比较两条ROC曲线的AUC（Area Under the Curve）或偏AUC（Partial Area Under the Curve）的差异。要比较两条ROC曲线的AUC或偏AUC的差异，可以使用pROC包的roc.test()函数进行假设检验。需要注意的是，如果希望比较偏AUC的差异，可以在roc.test()函数中设置partial.auc参数为TRUE，并指定感兴趣的偏AUC的起始和终止阈值。绘制并比较两条ROC曲线的AUC或偏AUC差异。

一，AUC预备知识： 1. 常用来评价一个二分类器的优劣。 2. 很多学习器是为测试样本产生一个实值或概率预测，然后这个预测值与一个分类阈值进行比较，若大于阈值则为正类，否则为反类。 3. 实际上，根据这个实值或概率预测结果，可以将测试样本进行排序，"最可能"（实值或概率预测最大）是正例的排在最前面，“最不可能”是正例的排在最后面。这个，分类过程就相当于在这个排序中以某个“截断点”（即阈值）...