生信分析进阶9 - 基于SNP的亲权指数（PI）计算方法（亲缘关系）

1. 亲权指数 ( paternity index,PI )

父权指数，是亲子关系鉴定中判断遗传证据强度的指标。它是判断亲子关系所需的两个条件概率的似然比，即具有AF遗传表型的男子是孩子生物学父亲的概率（X）与随机男子是孩子生物学父亲的概率（Y）的比值。

选取的SNP标记，需遵循孟德尔遗传定律，联合应用可进行亲权鉴定，其累计非父排除概率大于0.9999。一般计算累计亲权指数需大于10000。

示例数据运行结果如下（R语言实现）：

2. 示例数据下载

https://github.com/LittleGlowRobot/Jackwu/blob/main/data/PI_SNP_DATA.rda

# linux下载，windows直接打开网页下载
wget https://g