伯远医学-CSDN博客

原创手把手教你如何使用KEGG数据库

代谢物常用的数据库包括KEGG、HMDB、MONA、METLIN、MassBank、mzCloud、GNPS、LipidBlast、Lipidmaps、NIST、Fiehn等。本期伯小医为大家着重介绍KEGG数据库。KEGG全称为京都基因和基因组百科全书（Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes），是整合了基因组、蛋白组、代谢组、化学和系统功能信息的综合数据库，由日本京都大学Kanehisa实验室于1995年推出。

2025-06-26 13:17:07 472

原创【文献速递】结合AI解析解毒三根汤对抗结直肠癌的生物活性成分

2025年4月21日，浙江省中医院阮善明教授团队在Phytomedicine（IF：6.7）上发表了题为“Bioactive components of Jiedu Sangen decoction against colorectal cancer: A novel and comprehensive research strategy for natural drug development”的研究性论文。解毒三根汤（JSD）因其良好的临床疗效，在中国南方被广泛用于治疗结直肠癌（CRC）患者，但其有效活

2025-06-26 10:30:21 326

原创【文献速递】MUL1促进HSPA9的SUMO修饰来调控膀胱癌淋巴结转移

为了进一步明确SUMO修饰在HSPA9亚细胞定位中的作用，研究人员用不同浓度的SUMO修饰抑制剂ML792处理T24细胞，随后分离线粒体和细胞质部分，并通过WB检测HSPA9在线粒体和细胞质中的水平。这一发现表明ML792的加入抑制了HSPA9从线粒体向细胞质的转位，从而暗示MUL1介导的HSPA9转位是依赖于SUMO修饰的。通过这种方式，研究人员巧妙地利用药理学手段干预SUMO修饰过程，进一步证实了SUMO修饰在HSPA9亚细胞转位中的关键作用，也为研究MUL1对HSPA9调控机制提供了有力证据。

2025-06-26 09:05:33 291

原创一文读懂启动子/增强子/沉默子的活性检测

在人体约30万亿个细胞中，每个细胞都携带着相同的DNA“说明书”，但为什么有的细胞变成皮肤细胞，有的却成为神经细胞？答案就藏在基因表达的精密调控中。在这场生命活动的“分子交响乐”里，启动子、增强子和沉默子如同三位指挥家，通过复杂的协作决定哪些基因该“奏响”、哪些该“沉默”。从受精卵到完整生命体，从健康细胞到疾病状态，启动子、增强子和沉默子构成的调控网络始终在演绎着精妙的分子芭蕾。图1 基因转录调控元件（Maston et al., 2006）。

2025-06-25 16:25:48 765

原创【文献速递】基于minigene技术探究SMN1无义突变触发的mRNA衰变机制（NMD）

脊髓性肌萎缩症（Spinal Muscular Atrophy,SMA）是一种常见的常染色体隐性神经肌肉疾病，由生存运动神经元1基因（SMN1）突变引起。SMN1基因突变中约40%为无义或移码突变，这类突变会引入提前终止密码子（Premature Termination Codon,PTC）。无义介导的mRNA衰变（Nonsense-Mediated mRNA Decay,NMD）是一种高度保守的真核质量控制途径，能够降解含有PTC的mRNA，防止潜在有毒蛋白的积累。

2025-06-25 14:08:01 697

原创【技术应用】利用CUT&Tag找组蛋白修饰调控基因研究思路

组蛋白修饰是表观遗传学的重要分支，它不改变DNA序列，却能通过修饰“开关”基因表达，影响细胞命运和疾病进程。染色质是由组蛋白八聚体和缠绕其上的DNA组成的复杂结构，其中核小体作为基本单元，由146 bp的DNA片段缠绕组蛋白八聚体约1.65圈构成，并连接着20-50 bp的linker DNA。

2025-06-24 10:20:14 778

原创 Phos-tag™实验操作指南

蛋白质磷酸化作为最关键的翻译后修饰之一，对磷酸化的检测是研究蛋白功能重要手段之一。传统磷酸化检测技术（如磷酸化抗体Western Blot）往往难以区分不同磷酸化状态下的蛋白质亚型，而Phos-tag™技术凭借其独特原理，实现了对磷酸化蛋白的高分辨率分离与检测，成为研究蛋白磷酸化动态的利器。

2025-06-24 08:54:04 985

原创深度剖析CUT & Tag技术，精准操控基因组的革命性工具

从ChIP-seq（染色质免疫沉淀测序）到CUT & RUN（靶向切割和标记），再到近年来闪耀登场的Cut & Tag（靶向切割和转座酶标记），科研人员操控和解析基因组特定区域的能力正经历着革命性的跃升。其中Cut & Tag以其独特的设计理念和卓越的性能，正迅速成为表观基因组学和基因调控研究领域的明星技术。

2025-06-23 15:30:59 876

原创【文献速递】ASO35-58导致EZH2的外显子14跳跃从而抑制肝癌发生

南京师范大学的研究团队于2025年2月19日发表在《Molecular Therapy》期刊上“Antisense-mediated Exon Skipping Targeting EZH2 Suppresses Tumor Growth in a Xenograft Mouse Model of Hepatocellular Carcinoma”。研究内容是EZH2基因在多种癌症中表达异常且与癌症发展相关，通过筛选ASO发现能高效沉默EZH2的ASO35-58，该ASO可用于治疗肝细胞癌等癌症。

2025-06-23 14:33:13 796

原创癌症爆发真相：90%风险来自环境，表观遗传才是关键钥匙！

既然环境暴露贡献了癌症风险的90%以上，其核心机制正是通过表观遗传途径实现的。表观遗传是一套在不改变DNA序列的前提下调控基因表达的生命编程语言，如果说DNA是生命的硬件，表观遗传则是动态更新的操作系统。即使遗传背景相同（如同卵双胞胎），不同的环境暴露会通过表观遗传重编程，导致基因表达模式的巨大差异，最终决定癌症是否发生。表观遗传揭示了环境、生活方式如何在不改变DNA序列的情况下，影响我们的健康、行为和疾病风险。

2025-06-20 13:40:37 1021