replace_fasta.sh

#!/bin/bash

# 检查输入参数数量是否正确
if [ "$#" -ne 2 ]; then
    echo "用法: $0 输入文件 输出文件"
    exit 1
fi

# 输入文件和输出文件
input_file="$1"
output_file="$2"

# 将输入文件中的 * 替换为 - 并保存到输出文件
sed 's/\*/-/g' "$input_file" > "$output_file"

echo "已将 $input_file 中的 * 替换为 - 并保存到 $output_file"

shell脚本，把fasta文件中的*替换为-,输入输出都放在外面