小提琴图绘制-Graph prism

在 GraphPad Prism 中为小提琴图添加显著性标记（如*P<0.05）的步骤如下：

步骤1：完成统计检验

1. 选择数据表：确保数据已按分组排列（如A列=Group1，B列=Group2）。
2. 执行统计检验：
   • 点击工具栏 Analyze → Column analyses → Mann-Whitney test（非参数检验，适用于非正态数据）
     或 t-test（若数据符合正态分布）。
   • 在弹出窗口中勾选 Two-tailed（双尾检验）→ 点击 OK。

步骤2：自动添加P值标记

1. 返回图形界面，Prism会自动在结果表中生成P值（如P=0.003）。
2. 手动转换为星号：
   • 双击图形上的P值文本框 → 删除默认的P值文本。
   • 点击工具栏 Text tool（T图标）→ 在合适位置添加文本：
     • * 表示 P<0.05
     • ** 表示 P<0.01
     • *** 表示 P<0.001
       （根据实际检验结果填写）

步骤3：添加显著性连线（可选）

1. 点击工具栏 Draw → Line，在两组之间绘制水平线。
2. 调整线条位置和长度，使其指向分组的中心。
3. 将星号文本移动到连线上方居中位置。

关键设置图示

1. 统计检验选择：
   
2. 星号标注示例：
   

注意事项

1. 检验方法选择：

   • 若数据符合正态分布（通过 Analyze → Column statistics → Normality test 检查），使用 非配对t检验（Unpaired t-test）。
   • 若数据非正态，使用 Mann-Whitney检验（非参数检验）。

2. 自动标注插件（Prism 9+）：

   • 安装 Significance Stars 插件（需Prism 9及以上版本）：
     Extensions → Add Extension → 搜索 Significance Stars → 安装后一键添加星号。

3. 图形导出：

   • 保存为PDF/TIFF格式（分辨率≥300 dpi）以确保印刷质量。

备选方案：R语言自动标注

如果Prism操作不便，可用R代码自动生成带星号的图形（需原始数据）：

library(ggpubr)
ggplot(data, aes(x=Group, y=Value)) +
  geom_violin() +
  stat_compare_means(method = "wilcox.test", 
                   label = "p.signif",  # 直接显示星号
                   comparisons = list(c("Group1", "Group2")))