Graph prism 风险表

是的,GraphPad Prism 可以完全通过界面操作绘制生存曲线和风险表。以下是详细的步骤指南:

第一部分:创建生存曲线(以 H-SCORE 82.5 组为例)

  1. 新建项目

    • 打开 Prism → 新建 → 选择 “Survival” 数据类型
    • 选择 “Enter survival data as time of events”
    • 创建 2 列数据集(低分组和高分组)
  2. 输入生存数据

    • 在数据表中:
      • 列 A:H-SCORE lower (<82.5) 组的事件时间
      • 列 B:H-SCORE higher (>82.5) 组的事件时间
    • 对于删失数据,在单元格中右键选择 “Censored”
  3. 绘制生存曲线

    • 转到 “Graphs” 标签 → 选择创建 “Survival” 图
    • 在图形窗口右键 → “Format Graph”:
      • 在 “Data Sets” 标签:
        • 为两组选择不同颜色
        • 勾选 “Show symbols at censored times”
      • 在 “Appearance” 标签:
        • 选择 “Step function” 样式
  4. 添加图例和标题

    • 右键图表 → “Insert Legend”
    • 双击图例修改组名:
      • “H-SCORE lower (<82.5)”
      • “H-SCORE higher (>82.5)”
    • 双击图表标题区添加标题

第二部分:添加风险表(No. at risk)

  1. 创建风险表数据

    • 新建数据表:
      • 文件 → 新建数据表 → 选择 “Grouped”
      • 数据表类型:选择 “Enter and plot values”
      • 设置:
        • 行数:10(对应时间点)
        • 列数:2(低分组和高分组)
        • 子列:1
  2. 输入风险数据

    • 行标题:时间点 (0, 12, 24, 36, 48, 60, 72, 84, 96, 108)
    • 数据列:
      • A列:H-SCORE lower 风险人数 (20, 18, 18, 17, 16, 16, 16, 16, 16, 16)
      • B列:H-SCORE higher 风险人数 (24, 13, 10, 10, 9, 9, 9, 9, 9, 9)
  3. 创建风险表图形

    • 选择该数据表 → 转到 “Graphs” 标签
    • 选择 “New Graph of Existing Data” → “Text table”
    • 在图形窗口:
      • 右键 → “Format Graph”
      • 在 “Appearance” 标签:
        • 取消勾选 “Grid lines”
        • 设置合适的字体大小
      • 在 “Titles & Fonts” 标签:
        • 添加标题:“No. at risk”
  4. 修改表格标签

    • 双击表格顶部的 “A” → 输入 “H-SCORE lower (<82.5)”
    • 双击表格顶部的 “B” → 输入 “H-SCORE higher (>82.5)”
    • 双击左侧行标题 → 输入时间点

第三部分:组合生存曲线和风险表

  1. 创建布局

    • 文件 → 新建布局
    • 选择 “Blank layout”
  2. 添加生存曲线

    • 菜单 → “Add Graph Frame”
    • 选择已创建的生存曲线图
    • 调整框架大小(约占上部 70%)
  3. 添加风险表

    • 菜单 → “Add Graph Frame”
    • 选择已创建的风险表
    • 放置在生存曲线下方(约占下部 30%)
    • 调整宽度与生存曲线对齐
  4. 添加 P 值

    • 在生存曲线图上:
      • 点击 “Add text” 工具
      • 输入 “P=0.003”
      • 放置在图表右上角

第四部分:设置第二组(H-SCORE 177.5)

  1. 重复上述步骤

    • 新建生存数据表:
      • 低分组:38 个时间点
      • 高分组:6 个时间点
    • 新建风险表数据:
      • 低分组风险:38, 36, 36, 36, 35, 35, 34, 33, 33, 33
      • 高分组风险:6, 3, 3, 2, 1, 1, 1, 1, 1, 1
  2. 添加到布局

    • 在现有布局中:
      • 添加第二个生存曲线图框架
      • 添加对应的风险表框架
    • 或创建新布局专门显示第二组

第五部分:美化图表

  1. 统一格式

    • 选择所有图表 → 右键 → “Apply Changes to All”
    • 统一:
      • 字体:Arial 10pt
      • 颜色方案(低分组蓝色,高分组红色)
      • 坐标轴标签
  2. 坐标轴设置

    • 双击 X 轴 → 标题:“Follow-up (months after initial resection)”
    • 双击 Y 轴 → 标题:“Survival Probability”
    • 设置范围:X轴 0-120月,Y轴 0-1.0
  3. 导出图像

    • 文件 → 导出 → 选择格式(TIFF/PDF)
    • 分辨率:300 DPI
    • 颜色模式:CMYK(用于印刷)

注意事项:

  1. 风险表时间点必须与生存曲线时间点一致
  2. 对于高分组只有 6 个样本的情况:
    • Prism 会自动处理小样本生存曲线
    • 风险表会显示为:6 → 3 → 3 → 2 → 1 → 1 → 1 → 1 → 1 → 1
  3. 如果风险表显示不完整:
    • 右键表格 → “Format Graph” → 调整行高/列宽
    • 减少字体大小

通过以上步骤,您可以在 GraphPad Prism 中完全通过界面操作创建包含生存曲线和风险表的专业图表,无需编写任何代码。整个过程直观且可视化,适合生物医学研究人员使用。

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