Seurat最初于2015年首次发布,并且在之后的版本中经过持续的更新和改进。这个工具在单细胞生物学研究中得到了广泛的应用,为科学家们提供了强大的工具来深入了解单个细胞的基因表达和细胞群体的异质性。目前,Seurat已经发布到V5版本。
更新到Seurat5后用起来感觉很不习惯,还是重装回Seurat4版本。
if (!requireNamespace("remotes", quietly = TRUE)) {
install.packages("remotes")
}
remotes::install_version("SeuratObject", "4.1.4", repos = c("https://satijalab.r-universe.dev", getOption("repos")))
remotes::install_version("Seurat", "4.4.0", repos = c("https://satijalab.r-universe.dev", getOption("repos")))
微信公众号:生信大杂烩