计算机辅助药物设计的最新进展
在药物研发领域,计算机辅助药物设计(CADD)正发挥着越来越重要的作用。从核酸药物设计到先进的计算方法应用,再到药物重新定位,CADD为药物研发带来了新的机遇和挑战。
核酸药物设计
随着分子生物学在基因表达和调控方面的进展,核酸药物设计(NABDD)成为了一个热门领域。核酸药物可以通过改变核酸的组成成分,如五元糖、杂环碱基、核苷酸间连接以及核苷酸序列本身来开发。这些药物能够在基因水平上靶向疾病,抑制致病蛋白的表达。
核酸药物的靶点主要是RNA,其应用范围随着化学的发展不断扩大,包括靶向微小RNA、核酶、RNA干扰(RNAi)、短干扰RNA(siRNA)、基因编辑、非编码RNA和剪接调控、反义和适体等。
某些先天免疫受体,如RIG - 1、TLR - 3、7、8、炎症小体和STING,可以识别核酸模式并激活相应的免疫反应。因此,控制这些受体的影响具有广泛的治疗应用。
根据结构、靶点和作用机制,核酸药物可分为以下六类:
|序号|类别|靶点|结构|机制|
|----|----|----|----|----|
|1|适体|细胞外蛋白|单链RNA/DNA|抑制生理效应|
|2|CpG寡核苷酸|TLR9受体|单链DNA|佐剂|
|3|诱饵|转录因子|双链DNA|抑制转录|
|4|反义|mRNA、前mRNA、miRNA|单链DNA/RNA|切割mRNA、切割miRNA、外显子跳跃|
|5|miRNA|mRNA|双链RNA|RNA干扰(miRNA替代)|
|6|siRNA|mRNA|双链RNA|RNA干扰(mRNA切割)|
反义