R shiny: 部署时遇到报错 Unable to determine package source for Bioconductor package XXX: Repository must be

遇到的问题

在部署shiny app时遇到报错：
Unable to determine package source for Bioconductor package XXX (通过Bioc下的) : Repository must be specified

解决方法

官方附上的原因是因为你的repos中没有Bionconductor：

1. (可能不是必要的)
   将你的R包和Bioc包都更新到最新版本。

• 更新R可以使用installr包中的updateR()函数
• 更新Bioc包可以看看别人的教程，我之前尝试的命令行太多了，忘记到底是哪个起的作用，不介意的话可以自己试一下。
  BiocManager::repositories(version="3.13")（3.13版本严格对应R 4.1.1版本）
  devtools::install_github("Bioconductor/BiocManager", ref="ghost-binary-repo")
devtools::install_github("Bioconductor/BiocManager")
install.packages("BiocManager")