教程：TeachOpenCADD项目的安装与使用

教程：TeachOpenCADD项目的安装与使用

teachopencadd TeachOpenCADD: a teaching platform for computer-aided drug design (CADD) using open source packages and data 项目地址: https://gitcode.com/gh_mirrors/te/teachopencadd

1. 项目目录结构及介绍

TeachOpenCADD项目的目录结构如下：

teachopencadd/
├── .binder/
├── .github/
├── devtools/
├── docs/
├── teachopencadd/
│   ├── .gitattributes
│   ├── .gitignore
│   ├── README.md
│   ├── setup.cfg
│   ├── setup.py
│   └── versioneer.py
├──.gitattributes
├── .gitignore
├── README.md
├── LICENSE
├── MANIFEST.in
└── requirements.txt

• .binder/: 包含用于在线运行Jupyter笔记本的配置文件。
• .github/: 包含GitHub工作流的配置文件。
• devtools/: 存放开发工具和脚本。
• docs/: 包含项目文档的源文件。
• teachopencadd/: 包含项目的核心代码和资源。
  • README.md: 项目的说明文件。
  • setup.cfg 和 setup.py: Python包的配置和安装脚本。
  • versioneer.py: 用于管理项目版本号的脚本。
• .gitattributes: 定义Git仓库的属性。
• .gitignore: 定义Git应该忽略的文件和目录。
• README.md: 项目的说明文件，包含项目的介绍和如何使用的信息。
• LICENSE: 项目的许可证信息。
• MANIFEST.in: 定义打包时应该包含的文件。
• requirements.txt: 定义项目依赖的Python包。

2. 项目的启动文件介绍

在teachopencadd/目录下，没有特定的启动文件。项目的使用主要依赖于Jupyter笔记本。用户可以通过以下两种方式运行这些笔记本：

• 在线使用Binder: 用户无需本地安装任何软件，即可通过网页直接运行Jupyter笔记本。具体操作请参考项目README文件的说明。

• 本地使用Conda环境: 用户需要在本地安装Conda，然后创建一个新的环境并安装所需的Python包。具体步骤如下：

  1. 安装Miniconda或Anaconda。
  2. 克隆项目仓库到本地。
  3. 在项目根目录下创建一个新的Conda环境，并安装依赖。

  conda create -n teachopencadd_env python=3.8
  conda activate teachopencadd_env
  pip install -r requirements.txt
  

  4. 在项目根目录下运行jupyter notebook命令，然后在浏览器中打开出现的URL，浏览和运行Jupyter笔记本。

3. 项目的配置文件介绍

项目的配置文件主要包括：

• setup.py: 此文件定义了Python包的元数据和安装脚本。它用于安装项目作为Python包，以便在本地环境中使用。

• requirements.txt: 此文件列出了项目运行所依赖的Python包。在创建Conda环境后，用户可以通过运行pip install -r requirements.txt命令来安装这些依赖。

• .binder/: 此目录中的配置文件用于在Binder平台上托管Jupyter笔记本，使得用户可以在线运行笔记本。

• .github/workflows/: 此目录中的配置文件用于GitHub Actions，自动化项目的某些任务，如自动在提交代码后构建文档。

以上是TeachOpenCADD项目的目录结构、启动文件以及配置文件的简要介绍。用户可以根据这些信息来安装和使用TeachOpenCADD项目。

teachopencadd TeachOpenCADD: a teaching platform for computer-aided drug design (CADD) using open source packages and data 项目地址: https://gitcode.com/gh_mirrors/te/teachopencadd