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原创 流式细胞术样本处理全攻略(一):组织、血液、体液制备方法详解
流式细胞术作为多参数、高通量的细胞分析技术,在细胞表型鉴定、免疫反应研究、疾病机制探索及药物效果评估中发挥关键作用。而样本制备是流式实验成功的核心前提,需将不同来源样本处理为单颗粒悬液,并最大程度减少细胞死亡与碎片干扰。本文针对组织、外周血 / 骨髓、体液三类常见样本,详细梳理其取材要求、制备步骤及注意事项,同时补充组织酶解法的操作要点与胶原酶选型指南,为流式实验人员提供可直接参考的标准化操作方案。样本时效性。
2025-09-11 22:15:44
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原创 炫酷火山图!R语言ggplot2保姆级教程
log2FC = rnorm(1000, mean = 0, sd = 2), # 随机生成log2FC,大部分在0附近。# 添加水平的P值阈值线(虚线),注意y轴是-log10(padj),所以线画在 -log10(0.05) 的位置。:图表上方两侧的点,就是既显著又变化幅度大的目标分子,也是我们关注的焦点,因其形似喷发的火山而得名。box.padding = 0.5, # 标注框的填充,ggrepel的参数,用于防止重叠。:通常表示显著性水平(-log10(adj.P.Val)),衡量结果的可信度。
2025-09-10 21:41:01
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原创 自噬机制解析(二):一文厘清 LC3/Atg8 概念及实验应用要点
核心认知:LC3-II 是自噬体的特异性标志物,但需结合溶酶体抑制剂实验,通过 LC3-II 的积聚情况判断自噬流,而非单一依赖 LC3-II 的基础表达量;抗体选择:根据细胞 / 组织类型的 LC3 亚型分布特点选择靶标抗体,优先使用 LC3A/B 联合抗体以提高检测成功率;结果解读:明确 LC3-I(16kD)与 LC3-II(14kD)的电泳位置差异,避免因分子量 “反向” 问题误判结果。
2025-09-08 18:19:40
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原创 详解自噬受体
自噬是一种降解多种细胞质成分的细胞内过程。传统观点认为自噬是随机发生的,然而近年来的研究表明,其对细胞质物质的隔离和降解往往具有高度选择性。Atg8 家族蛋白是自噬机制中的核心组分,锚定于自噬体膜上,是自噬研究中最具代表性的蛋白之一。除了选择性自噬受体,Atg8 家族蛋白还可与多种参与自噬进程、囊泡运输或蛋白互作的蛋白质结合,其中部分蛋白甚至本身也会被自噬降解。这些与 Atg8 相互作用的蛋白通常含有一段短线性序列,称为 LIR(LC3 相互作用区)基序,该基序介导其与 Atg8 家族蛋白的结合。
2025-09-08 08:51:17
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原创 《Science》神经炎症综述思路套用:从机制到跨领域研究范式
本文通过解析 [核心过程,如 TIME 时空异质性],主张未来研究需建立‘分期 - 分型 - 联合’新范式:针对 [过程 A,如 M2 型巨噬细胞活化] 的药物应在 [阶段 1,如原发肿瘤期] 使用,而与针对 [过程 B,如 CAFs 屏障形成] 的药物联用,是 [阶段 2,如转移期] 打破恶性循环的核心方向。如何基于动态性设计精准治疗策略?参照原综述,设计 3-4 张核心示意图(如阶段演变图、恶性循环图、治疗策略图),标注关键分子 / 细胞,确保读者快速理解核心观点 —— 这是编辑与审稿人关注的重点。
2025-09-06 21:54:11
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原创 科研思路套用:从《Science》帕金森病研究,学 “疾病基因 - 病理分子” 机制与干预论文框架
该《Science》帕金森病研究的核心价值,在于提供了一套 “可复制、可推广” 的 “疾病基因 - 病理分子” 机制研究框架 —— 从 “临床现象锚定” 到 “机制解析”,再到 “干预策略挖掘”,每一步都有明确的实验设计与逻辑支撑。无论你研究神经退行性疾病、癌症还是代谢病,只要聚焦 “细胞表面蛋白 / 受体与病理分子的互作”,都可套用本文的科学问题设计、技术方法选择及结果逻辑梳理思路,快速搭建课题框架,提升研究的系统性与转化价值。
2025-09-05 15:29:31
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原创 Graphpad 绘图(二):小鼠生存曲线绘制与数据记录分析详解
生存曲线绘制的核心并非 “软件操作”,而是 “数据记录的规范性”—— 先明确 “终点事件”,再严格按 “0/1” 规则记录结局,最后在 Graphpad 中匹配正确的表格类型,即可高效生成可靠的生存曲线。若需进一步分析组间差异(如药物组 vs 对照组),可结合 Log-rank 检验、Cox 回归等方法,后续将单独撰文详解。若在实操中遇到数据匹配错误、曲线无删失标识、P 值计算异常等问题,可在评论区留言,共同探讨解决方案。
2025-09-05 15:21:33
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原创 Graphpad Prism 实战教程(一):小鼠体重变化曲线绘制全流程(含数据处理与图表美化)
本文从 Excel 数据整理到 Graphpad 图表绘制、优化、导出,完整覆盖了小鼠体重变化曲线的制作流程。核心要点在于:规范计算均值与标准差,选择 “XY 图 + Mean±SD 误差线” 的图表类型,重点优化折线样式、坐标轴标注与图例清晰度。按照此流程操作,即使是科研新手也能快速绘制出符合规范的专业体重变化曲线。若需进一步学习 Graphpad 批量绘图、柱状图与折线图组合等进阶技巧,可持续关注后续教程。如有操作疑问,欢迎在评论区留言交流!
2025-09-03 22:32:28
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原创 科研绘图(二):R 语言实现小鼠脑图谱 3D 渲染,附完整代码与数据获取指南
在生物医学科研中,脑区的 3D 可视化是呈现实验结果、解析脑结构功能的重要手段。R 语言凭借rgl和Rvcg等工具包,可高效实现小鼠全脑及特定脑区(如 CA1 区)的立体渲染,且代码可复用性强。本文将从环境搭建、数据准备、代码实现到结果导出,手把手带你完成小鼠脑图谱 3D 绘图,小白也能快速上手!
2025-09-02 12:38:55
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原创 神经科学科研绘图实战:小鼠脑图谱精准着色教程
在神经科学领域的论文撰写、课题汇报中,一张清晰且重点突出的脑图谱能极大提升科研成果的可视化说服力。然而,多数研究者在处理脑图谱时,常受困于 “背景文字杂乱、目标脑区标记模糊” 等问题,导致图表呈现效果不佳。本文将以神经科学常用的小鼠脑图谱为例,详细拆解从权威图谱获取到 AI 软件精准着色的全流程,帮你快速制作出专业级脑区展示图。
2025-09-01 11:26:04
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原创 BCA 法蛋白定量完整操作指南(WB 实验核心系列)
Western Blot(WB)实验中,蛋白上样量的一致性是保证结果可靠、可重复的核心前提。若样本蛋白浓度不均,会直接导致条带亮度异常、定量分析偏差,甚至让整个实验数据失去参考价值。而实现精准上样的关键,在于高效、准确的蛋白定量步骤。BCA(Bicinchoninic Acid)法作为目前主流的蛋白定量技术,凭借灵敏度高(检测范围 20-2000μg/mL)、抗干扰能力强(耐受去垢剂、还原剂)、操作简便等优势,成为科研人员的首选。
2025-08-31 11:23:20
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原创 Western Blot 样本制备完整流程:从细胞 / 组织到变性样品的关键步骤与细节
在 Western Blot(WB)实验中,样本制备是决定最终结果准确性的核心环节。不少研究者在实验初期就因蛋白提取不充分、定量偏差、变性不完全等问题导致条带异常(如拖尾、冗长),最终影响实验结论。本文结合实际操作经验,详细拆解细胞与组织样本的蛋白制备流程,涵盖原理、步骤及关键注意事项,助力研究者高效获取高质量蛋白样品。
2025-08-30 15:43:27
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原创 R 语言 ComplexUpset 包实战:替代 Venn 图的高级集合可视化方案
在生物信息学、数据挖掘等领域的集合分析中,传统 Venn 图在多维度数据展示时存在信息拥挤、可读性差等问题。本文基于 R 语言的 ComplexUpset 包,以基因表达研究为场景,从包安装、数据准备到可视化实现,完整演示如何制作正刊级别的集合交集图,解决多条件下差异基因(或其他数据)的交集展示难题,代码可直接复用。
2025-08-28 14:35:42
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原创 R 语言 eulerr 包绘制韦恩图:比例精准
eulerr包的核心优势在于 **“比例精准” 和 “自定义灵活”** —— 无需手动调整图形位置,即可实现数据与图形的精准匹配;同时通过quantitiesfillsedges等参数,可轻松适配报告、PPT、论文等不同场景的需求。本文提供的代码均经过验证,可直接复制运行,新手只需替换自身数据即可快速上手。
2025-08-28 14:29:38
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原创 琼脂糖凝胶核酸电泳条带异常问题及解决方案汇总
在分子生物学实验中,琼脂糖凝胶核酸电泳是检测核酸片段的常用技术,但条带模糊、迁移异常等问题常影响实验结果判读。本文结合实际操作经验,梳理条带异常的常见原因及对应解决方案,助力实验人员高效排查问题。琼脂糖浓度与凝胶孔径呈负相关:浓度越高,孔径越小,会显著阻碍高分子量 Marker 片段(尤其>10000 bp)的迁移,表现为条带跑不动、分离度差,甚至堆积在加样孔附近。通过针对性排查上述问题,可有效改善琼脂糖凝胶核酸电泳的条带质量。缓冲液是电泳的导电介质,常见异常场景包括:。
2025-08-27 14:28:42
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原创 蛋白质残基 - 残基距离计算:单蛋白工具与批量处理方案
在蛋白质结构分析、功能预测及疾病机制研究中,残基 - 残基距离是核心分析指标之一。本文整理了常用的单蛋白残基距离计算工具,并提供批量处理方案,帮助科研人员提升分析效率。针对这一痛点,可采用药理实验屋开发的批量下载工具,操作流程如下:。蛋白质的稳定结构与功能依赖于氨基酸残基间的相互作用(氢键、疏水作用、盐桥等),而残基间的空间距离直接决定了这些相互作用的强度与类型,其计算价值主要体现在:。若仅需分析单个蛋白质,以下网页工具可满足基础需求,无需本地部署,操作便捷:。残基距离列表 + 相互作用界面。
2025-08-27 14:18:12
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原创 HPA 数据库实用指南:解决科研文章逻辑衔接难题的实操教程
HPA 数据库凭借其全面的蛋白质表达数据、直观的可视化结果及便捷的临床关联工具,成为科研人员完善研究逻辑、补充实验证据的高效工具。无论是基础的组织表达验证,还是进阶的临床预后分析,掌握其核心用法均可显著提升科研文章的说服力。建议根据研究方向针对性挖掘模块功能,让公共数据更好地服务于研究结论。
2025-08-24 15:59:20
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原创 进阶版蛋白互作研究方法:构建 “体内 + 体外 + 结构 + 功能” 多维度论证体系
体内验证:通过 Co-IP(内源性互作)+PLA(原位共定位)证明生理条件下的互作存在;体外量化:用 Pull-down 验证直接结合,搭配 ITC 获取热力学参数(ΔH、ΔS)揭示能量驱动机制;结构解析:通过 Cryo-EM 或 NMR 定位互作界面关键残基,明确分子作用模式;功能验证:结合 MST/FP 检测突变体验证关键残基的重要性,AI 预测提前锁定候选位点,减少实验盲目性。
2025-08-23 18:10:01
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原创 脑立体定位坐标查找实用指南:3 个核心要点轻松掌握
脑立体定位坐标的准确获取需要结合文献参考、经典图谱和数字工具,核心在于明确坐标基准、选择权威资源。无论是依赖文献坐标、查阅 Paxinos 经典图谱,还是利用 Allen Brain Atlas 数字资源,都需始终关注坐标的基准定义和种属特异性,确保实验操作的精准性。
2025-08-21 18:31:24
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原创 DSSP 工具:蛋白质二级结构信息计算与批量处理教程
DSSP(Dictionary of Secondary Structure in Proteins)是一款经典的蛋白质二级结构计算工具,由荷兰癌症研究所(NKI Research)Perrakis 团队维护。它通过分析蛋白质的 PDB 结构文件,能够自动标注每个氨基酸残基的二级结构类型、相对溶剂可及性(暴露面积)等关键信息,为后续的拓扑图绘制、疏水 / 亲水表面分析、二级结构预测模型训练等提供核心数据支持。
2025-08-19 17:49:47
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原创 亚细胞定位工具汇总:9 款蛋白定位预测工具(附操作指南)
本文介绍了9种常用的亚细胞定位分析工具,帮助科研人员预测和研究蛋白质在细胞内的分布位置。这些工具包括:openGPS(多模态预测)、WoLFPSORT(快速初筛)、BUSCA(集成算法)、CELLO2.5(物种特异性)、DeepLoc2.1(精细定位)、SignalP5.0(信号肽预测)、TargetP2.0(N端导向)、PSORTb(细菌专属)和UniProt(实验验证数据库)。每种工具都有其独特原理和适用场景,建议结合多个工具结果进行交叉验证,并参考实验数据提高预测可靠性。
2025-08-18 13:33:41
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原创 WGCNA 实战教程:从数据到核心基因筛选的完整流程(附 R 代码)
本文通过 7 个核心步骤完成 WGCNA 分析,从数据预处理到核心基因筛选,涵盖关键参数调整与结果解读。样本量建议≥15,否则模块稳定性可能不足;基因筛选步骤(MAD 前 5000)可根据数据量调整(如样本少则保留 3000);模块与核心基因需结合功能富集分析(如 GO/KEGG)验证生物学意义。
2025-08-16 22:42:00
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原创 网络药理学核心数据库汇总:从化合物筛选到机制解析全流程工具清单
网络药理学研究的核心在于 “数据整合” 与 “网络构建”,上述 6 类数据库覆盖了从化合物筛选、靶点预测到机制解析的全流程需求。实际研究中可根据具体场景(如中药复方、西药多靶点、毒性机制等)灵活选择工具组合,通过多数据库交叉验证提升结果可靠性。
2025-08-14 17:40:14
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原创 基因组织表达查询实操:2 步掌握 NCBI Gene 与 Expression Atlas 数据库使用指南
掌握基因组织表达模式的查询方法,是分子生物学研究的基础技能。NCBI Gene 数据库适合人、小鼠、大鼠等常见物种的精准查询,而 Expression Atlas 则在跨物种查询中更具优势。通过上述两步实操,可快速获取目标基因在各组织中的表达数据,为后续功能研究或疾病关联分析提供数据支撑。实际操作中可根据研究物种及需求选择合适的数据库,进一步挖掘基因表达背后的生物学意义。
2025-08-13 16:21:48
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原创 Excel 实战:基因表达矩阵前处理中测序符号的快速剥离方法
符号位置确认:上述方法依赖符号的规则性(如固定为 “-” 分隔),使用前需确认原始数据中符号的一致性,若存在少数异常值,可手动微调。公式适配性:若符号长度不同(如前缀为gene_而非gene-),只需调整公式中的符号定位参数(如将改为效率对比:对于万级以上样本量,建议使用 Python(pandas.str方法)或 R(stringr包)批量处理;但对于小样本量或临时需求,Excel 的轻量特性更具优势。在生信分析的前处理阶段,高效清理数据冗余能为后续分析节省大量时间。
2025-08-11 08:45:32
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原创 Western Blot 内参蛋白选择指南
匹配样本类型:根据全细胞、核、胞质、膜、线粒体等不同样本组分选择特异性内参;规避实验干扰:实验处理(如缺氧、代谢干预、细胞周期调控)需避开内参的表达敏感场景;分子量差异:内参分子量应与目标蛋白拉开差距(建议相差 5kDa 以上),避免条带重叠干扰;预实验验证:新模型或特殊样本需通过预实验验证内参表达稳定性,不可完全依赖经验选择。合理选择内参是 WB 实验结果可信的基础,结合实验目标、样本特性及处理条件综合判断,才能实现数据的精准校准。
2025-08-10 10:58:17
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原创 ImageJ 实用技巧:通过 Overlay 实现图像透明标记的完整教程
基础规则:Hex 颜色值共 8 位,前两位AA为透明度,后六位RRGGBB为 RGB 颜色(与常见的 6 位 Hex 颜色值对应)。透明蓝色可设置为#4c0000ff半透明绿色可设置为#8000ff00参考工具:可通过 ImageJ 官方文档的Hex 与 RGB 对照表查询常用颜色的十六进制值,或使用在线 Hex 颜色生成器(如 Adobe Color)自定义后,按#AARRGGBB格式组合。注意事项:输入颜色值时需连续无空格,确保格式正确(如#4cff0000而非#4c ff0000。
2025-08-09 11:53:14
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原创 细胞传代全攻略:操作步骤与传代次数计算
在细胞培养实验中,传代是维持细胞活性与增殖的核心操作,而传代次数则是判断细胞状态、保障实验稳定性的关键指标。本文将系统梳理细胞传代的操作流程、传代次数的计算规则及核心注意事项,助力科研人员规范实验操作、提升结果可靠性。
2025-08-08 10:52:52
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原创 Transwell 细胞迁移与侵袭实验:从原理到操作的详细指南
Transwell 实验的核心在于通过标准化操作模拟体内细胞迁移 / 侵袭的微环境,其结果可靠性依赖于 Matrigel 包被、细胞状态控制、趋化系统构建及染色计数等关键步骤的精准执行。通过预实验优化参数(浓度、密度、时间)并严格控制操作细节,可有效提高实验重复性和数据可信度,为细胞迁移与侵袭相关研究提供可靠的量化依据。
2025-08-06 22:38:23
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原创 脂质体转染、物理转染(电穿孔)与病毒转染:原理及操作步骤详解
三种转染技术各有优势与适用场景:脂质体转染操作简便,适合常规细胞的瞬时转染;电穿孔无载体限制,适合多种细胞类型但需优化参数;慢病毒转染效率高,适合难转染细胞及稳定株构建。实验中需根据细胞类型、实验目的及成本选择合适方法,并通过优化关键参数(如试剂比例、电脉冲强度、MOI 值)提升转染效果。实验操作中需严格遵循无菌原则,注重细节控制(如细胞状态、试剂孵育时间),以确保实验稳定性与重复性。
2025-08-06 22:24:31
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原创 免疫荧光总是无信号?别忽略 PFA 固定液的这些关键问题
PFA 固定液是免疫荧光实验的 “第一关”,其制备是否规范、存储是否得当直接影响后续染色结果。从 PFA 的解聚原理到 4% 溶液的精准配制,从商品化试剂的存储注意事项到福尔马林的替代误区,每一个细节都可能决定实验成败。希望本文能帮你避开 PFA 相关的常见问题,让免疫荧光实验结果更稳定、更可靠。
2025-08-02 18:27:04
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原创 SCI 绘图实用 RGB 配色方案:多组比较
在 SCI 论文绘图中,合理的配色不仅能提升图片的视觉效果,更能让数据对比清晰、结果呈现直观,尤其是多组比较场景中,组别区分度直接影响审稿人和读者对数据的理解效率。本文整理了科研绘图中高频使用的多组比较 RGB 配色方案,覆盖病理染色、细胞标记、代谢通路、基因编辑、器官组织等 10 + 研究场景,每个方案均标注具体 RGB 值,方便直接应用于 GraphPad、Origin、AI 等绘图工具。
2025-08-02 13:24:48
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原创 2025 年国家自然科学基金青年科学基金 A/B 类资助结果公布:查询指南及项目调整说明
近日,2025 年国家自然科学基金青年科学基金 A 类(原杰出青年科学基金)和 B 类(原优秀青年科学基金)资助结果已正式公布。科研人员可通过国家自然科学基金委员会(以下简称 “基金委”)项目信息管理系统查询结果,同时基金委对部分项目名称的调整也需重点关注。本文将详细说明结果查询路径、项目名称调整细节,并结合近十年规律预测青年科学基金 C 类及面上项目的公布时间。
2025-08-01 22:13:34
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原创 R 语言文件读写、批量读取与图片保存实用代码汇总
本文整理了 R 语言中文件读写(TXT/CSV/Excel/R 格式)、批量数据读取及图片保存的核心代码,覆盖了日常数据分析中最常用的文件操作场景。实际使用时,可根据数据格式和需求调整参数(如文件路径、分辨率、分隔符等)。
2025-08-01 15:20:01
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原创 细胞培养基核心成分解析:影响细胞存活与生长的关键因素
细胞培养基的成分设计需兼顾细胞的营养需求、代谢特性及环境适应性。合理配置缓冲体系、碳源、氮源、维生素、无机盐等成分,并根据细胞类型精准调控生长因子与激素的添加,是保证细胞存活及良好生长的核心。实验中需结合细胞说明书及操作场景,灵活调整培养基配方,以获得稳定的实验结果。
2025-07-28 14:32:18
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原创 细胞传代操作全指南:把握时机,杜绝污染,附核心原理与实操细节
细胞传代看似步骤繁琐,实则是熟能生巧的过程。核心在于 “多观察、少失误”—— 通过反复实操积累对细胞状态的判断经验,才能稳定维持细胞活性。本文整理的原理与步骤适用于多数贴壁细胞传代,具体操作时需结合所用细胞类型的特性灵活调整。希望本文能为科研人员提供实用参考。
2025-07-26 18:55:56
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原创 R 语言绘制六种精美热图:转录组数据可视化实践(基于 pheatmap 包)
在转录组 Bulk 测序数据分析中,热图是展示基因表达模式、样本聚类关系的核心可视化工具。一张高质量的热图不仅能清晰呈现数据特征,更能提升研究成果的展示效果。本文基于 R 语言的pheatmap包,整理了六种适用于不同场景的热图绘制方法,涵盖基础聚类、分组对比、通路注释等需求,私信即可获取全部代码,方便科研人员快速实现数据可视化。
2025-07-25 14:14:42
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原创 大脑各脑区功能解析:从痛觉处理到动作执行的协作机制
从痛觉的快速反应到记忆的长期留存,再到简单的动作执行,大脑各分区通过精准的信号传递与功能配合,构成了一套高效的 “神经协作网络”。理解这些机制不仅能帮助我们更科学地认识自身行为的本质,也能为学习、记忆优化(如利用海马体特性提升记忆效率)、情绪管理(如通过额叶调控焦虑)提供理论参考。大脑作为人体最精密的 “核心中枢”,其功能的正常运转直接影响我们感知世界、应对环境的能力。深入了解脑区功能,也是呵护大脑健康的重要前提 —— 毕竟,它是我们认知世界、体验生活的基础。
2025-07-24 17:03:51
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原创 Western blot(WB)灰度分析方法(二):去背景与精确量化操作指南
点击 “Analyze”(分析)->“Set Scale”(设置比例尺),在打开的窗口中,将 “Unit of length”(长度单位)设置为 “pixels”(像素)。同时,勾选 “Light background”(浅色背景)选项,该选项适用于背景为浅色的 WB 图像,点击 “OK” 确认后,图像的背景会明显变白,条带与背景的对比度大幅提升,为后续的定量分析扫清障碍。点击 “Analyze”(分析)->“Set Measurements”(设置测量参数),在弹出的窗口中勾选以下关键参数:。
2025-07-21 11:18:35
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