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pingu的生信备忘录
公主号:pingu的生信备忘录,分享关于pingu的生信技能和知识
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sklearn|机器学习:决策树(一)
决策树(Decision Tree)是一种非参数的有监督学习方法,非参数指不限制数据的结构和类型,有监督学习则指必须具有标签。决策树能够从一系列有特征和标签的数据中总结出决策规则,并用树状图的结构来呈现,可用于解决分类和回归问题,其算法本质是一种图结构。其他以树模型为核心的集成算法还有随机森林、AdaBoost。以上为基于西瓜好坏问题构建的决策树,其中最初问题所在地方为根结点(没有进边,有出边,包含最初针对特征的提问),得到结论前的每一个问题为中间节点。原创 2024-10-31 20:06:39 · 2185 阅读 · 2 评论 -
Pytorch|李沐动手学深度学习:数学基础(一)
尽管单个向量的默认方向是列向量,但在表示表格数据集的矩阵中, 将每个数据样本作为矩阵中的行向量更为常见,这种约定将支持常见的深度学习实践,如沿着张量的最外轴,我们可以访问或遍历小批量的数据样本。向量的范数表示一个向量有多大,此处的大小(size)不涉及维度,而是分量的大小;然而,张量的维度用来表示张量具有的轴数,张量的某个轴的维数就是这个轴的长度,如果直接使用。分母转置了,就是分子布局。一般的标量导数是切线的斜率,亚导数可以将导数扩展到不可微的函数,即在函数的不可导点将导数取为一个范围内的任意值。原创 2024-10-15 16:29:29 · 1377 阅读 · 0 评论 -
Pytorch|李沐动手学深度学习:基础
N维数组(张量,tensor)是机器学习和神经网络的主要数据结构创建数组形状(3✕4矩阵)每个元素的数据类型(32位浮点数)每个元素的值(全是0或随机数)访问元素。原创 2024-10-05 11:02:50 · 1921 阅读 · 0 评论 -
R语言|临床预测模型(二):简单/多重线性回归
相关 ≠ 线性回归相关:不确定性的相关关系,指两个变量在宏观上存在关系,但未精确到数学函数关系,当变量X增加时,变量Y随着增加或者减少,但变量Y的具体取值不能由变量X确定,可分为正相关、负相关和零相关。线性回归:确定性的数学函数关系。根据变量数值分布类型不同,相关可分为直线相关、秩相关、列联相关等。秩相关:当变量的数值不符合正态性或为等级资料时,宜采用秩相关,主要利用变量数值的秩次替代原始数据进行相关分析。列联相关:针对于分类变量。直线相关:可计算皮尔森(Pearson)相关系数 r。原创 2024-09-25 13:04:26 · 2066 阅读 · 0 评论 -
R语言|临床预测模型(一)
参数化方法:线性模型、广义线性模型、logistic 回归半参数化方法:竞争风险模型、cox 回归非参数化方法(没有回归系统,没有参数但可预测):机器学习(神经网络、随机森林、决策树…)原创 2024-09-04 09:34:08 · 2178 阅读 · 0 评论