新手3dslicer手动肝脏切割及体积测量（详细图文）

最新推荐文章于 2025-05-07 16:17:00 发布
最新推荐文章于 2025-05-07 16:17:00 发布
阅读量4.3k 收藏 36
点赞数 17
CC 4.0 BY-SA版权
文章标签： 图像处理 ai 人工智能
版权声明：本文为博主原创文章，遵循 CC 4.0 BY-SA 版权协议，转载请附上原文出处链接和本声明。
本文链接：https://blog.csdn.net/linjianping513/article/details/136585776
本文介绍使用3dslicer开源软件进行肝脏图像分割与体积测量。作者尝试自动分割工具遇问题后采用手动切割，详细说明了导入数据、选择窗口窗位、勾画轮廓等分割步骤，完成分割后，还介绍了测量肝脏体积的操作，最终得出肝脏体积为1066.5ml。

摘要生成于 C知道 ，由 DeepSeek-R1 满血版支持， 前往体验 >

早就准备更新这篇了，由于懒癌发作，一直早葛优躺，今天刚好有点时间，就简单写下来。

3dslicer是一个开源软件，研究的人很多，废话少说，直接上图。

刚接手软件的时候，我一直想用自动分割工具，试验了Med sam，依赖安装不了；试验了英伟达的AI，NvidiaAIAssis，传服务器根本没反应，所有只有用了手动切割。有大神请指点一下。

导入患者数据并打开

点击volumes

选择合适的窗口窗位；

选择Segment Editor

点击增加一个节点

增加如下图

最低0.47元/天 解锁文章

200万优质内容无限畅学
3D Slicer 教程二 ---- 数据集
smallITperson的博客
10-14 2471
上一章下载3d slicer的软件,这章从加载数据集来弄清楚3dslicer怎么使用.如果没有数据集,也可用用样本数据.可以添加图片文件夹,(试了MP4不行,内镜的视频估计不支持),添加单个图片的话,会出现一些选项,‌ 这种图通常用于医学图像处理中，表示解剖结构、病变和其他对象的空间位置。图像分割是制作标签图的过程，可以通过手动、半自动或全自动的方法进行‌1。在3D Slicer中，标签图可以用于多种用途，包括可视化某些结构、进行定量分析（如测量体积、表面、形状属性）、3D打印和遮罩处理等。
3D Slicer 教程五 ---- 基本功能介绍(二)
smallITperson的博客
10-18 1263
接上篇。
【3D Slicer】阈值法测量肺部病灶体积
SQ的博客
08-09 4123
利用3D Slicer测量肺容积
3D slicer获取segment相关数据（centroid质心，ROI体表面积等）
luemeon的博客
10-21 6391
以获取质心为例（以中心点为坐标原点，所以为负的）
用3D slicer 去掉影像中的干扰体素而还原干净影像（脱敏切脸处理同）
最新发布
learner_jj的博客
05-07 449
记录用3D slicer 完成去除干扰体素，可应用于数据挖脸脱敏
SlicerMorph：在Slicer中进行3D形态计量学的扩展
02-16
这是的开发存储库。 SlicerMorph使生物学家能够更有效地从3D Slicer中的体积扫描（CT和MR）以及3D表面扫描仪中检索，可视化，测量和注释高分辨率样品数据。 它具有许多有助于对这些3D标本进行几何形态计量学分析的模块。 预印本。 安装 获取SlicerMorph的官方方法是通过3D Slicer的扩展机制。 要安装，请先安装的v4.11或更高版本，因为SlicerMorph对于较旧的版本不可用。 打开应用程序，然后使用搜索并安装SlicerMorph扩展。 重新启动3D Slicer之后，所有SlicerMorph模块将在应用程序中可用。 引文 如果您在研究中使用SlicerMorph，请引用这些出版物中的一项或多项。 SlicerMorph作为数字解剖的通用平台：Rolfe，S.，Pieper，S.，Porto，A.，Diamond，K.，Winchester，J.
3D slicer分割器官的步骤简介（一）
weixin_44587573的博客
06-03 6217
组里需要一些人体器官的分割图，这里记录下在3D slicer软件下简单的分割过程，以备后用。
医学图像预处理——3D CT肝脏dicom图像预处理学习记录（3D-IRCADB）
weixin_43259626的博客
03-27 2553
得到了各轴实际对应的空间大小后，可以根据重采样后期望各体素在某个轴上单位体素对应的空间大小，算各种重采样后的体素总数。结果如下：x轴数据的空间大小为512 * pixdim[1] = 451.07199mm，y轴数据的空间大小为512 * pixdim[2] = 451.07199mm，z轴数据的空间大小为81 * pixdim[3] = 405mm。作用是读取data_path中的文件，放入到image_slices中，得到一个129个大小的list，每一个list元素表示一个切片的全部信息。
一种基于临床CT影像的肝内血管体积测量方法
02-10
实验采用10套不同规格的肝脏CT图像进行肝内门静脉血管体积测量,并选取3套数据与基于手工测量得到的血管体积进行对比。实验结果表明,通过本研究方法测量得到的体积与手工测量结果基本一致,利用统计学方法得到的肝内门...
3D肝脏分割-使用GAN实现3D肝脏Liver分割算法-附项目源码-优质项目实战.zip
10-15
在当前的医学影像处理领域，精确的三维肝脏分割技术是一个重要的研究方向。这项技术的目标是在计算机断层扫描(CT)或磁共振成像(MRI)等医学图像中，准确地识别并划分出肝脏的三维边界，这对于疾病的诊断、手术规划、...
3D病理分割-基于GAN实现的3D肝脏分割算法-附项目源码-优质项目实战.zip
04-20
肝脏作为人体重要的器官，对其进行精确的3D分割可以帮助医生更好地了解肝脏病变情况，从而制定更为精确的治疗方案。该项目的算法设计中，生成器负责生成高质量的肝脏图像，判别器则用于区分生成图像与真实肝脏图像的...
3D Slicer及体绘制算法介绍
12-08
3D Slicer 体绘制 医学图像可视化
医学影像建模(3DSlicer)及临床应用
weixin_48628148的博客
06-10 4207
各企事业单位、高等院校及科研院所： 2021年全国神经外科第十九次学术会议在上海成功举行,会议主题为数字神经外科。由此可见,数字医学技术在各项临床工作中越来越成为主导。数字医学技术是数学、物理学、计算机科学等学科在医学中的综合应用，如今以三维医学影像重建、虚拟现实技术、机器学习、3D打印等为代表的数字医学技术已在临床中展现出了广泛的应用前景，尤其在骨科、口腔科、神经外科等临床学科中已有许多成功的应用。目前包括影像相关的人工智能在内的各种高端技术，都是以3D影像建模作为开篇。 ...
3Dslicer_AnnotationsModule
Huadong_eddy的博客
05-10 1363
一、模块简介 该模块作为3Dslicer核心模块的中的一个，主要被用来在MRML scene场景中创建和编辑相关的注释（annotations）和补充信息。目前在该模块里支持的注释（annotations）有标尺（rulers）和ROIs（regions of interest），关于基准点的相关创建和应用已经被放在了Markups模块中。 二、应用方向 该模块经常被应用在以下情形下： ...
超级简单的3D slicer使用教程（一）
热门推荐
wacebb的博客
05-05 3万+
接触此软件的对他应该是有几个基本了解了，话不多说，直接来介绍用法吧。 1.界面基本介绍 一打开界面应该是这个样子： 这是外国人开发的软件，所以是英文界面也没有什么疑问，而且这软件多用与医学领域，所以也不是特别热门，所以也暂时没有汉化，所以对于一些英文不是特别好的同学还是有点困难的，但是只要认识一些基本词汇，比如model这些，使用此软件还是没什么问题的。 首先就是基本的操作界面，或者我...
3DSlicer入门操作教程
luemeon的博客
09-16 2万+
3DSlicer用于医学图像
3D Slicer的学习（二） 图像的分割
tuweibazong的博客
06-12 4097
先对不同层级标注，然后点击Fill between slices -> Initialize -> Apply拖动层级颜色区域就会变成连续自适应的动态变化区域。如图，点击Level tracing，在图像上放置鼠标，会显示可能想要选中区域的轮廓，点击鼠标右键会将其显示为蓝色。然后点击Grow from seeds -> Initialize -> Apply，显示3D之后会自动扩展到其他位置的相同部位，从而展示整个部位。如图为copy之后，将黄色区域的颜色复制到原本的绿色区域。
快准狠！在3D Slicer中，使用TotalSegmentator扩展可在1分钟内自动分割全身117个器官
Tina姐的博客
02-07 8030
本系列涵盖从 3D Slicer 医学图像查看器的基础使用到高级自动分割扩展程序的内容（从入门到高阶！），具体包括软件安装、基础使用教程，自动分割扩展（totalsegmentator, monai label）快速标注数据。：强烈建议做图像分割的宝宝们好好学习，跟着Tina姐涨姿势！如果对你有帮助，转发支持一下🖖这是该系列的第二篇，在这篇博文中，我们将从3D Slicer下载一些示例数据，并使用自动分割扩展从图像中分割目标。将重点介绍扩展。
基于图割理论的MATLAB肝脏分割及3D渲染技术
3. MATLAB中图割分割肝脏的方法 在本资源提供的代码中，使用了图割技术对肝脏进行分割。算法首先定义初始种子点，通常是图像中的像素，并将其8个邻居像素点纳入考虑。然后，算法将利用能量函数比较种子点及其周围...
评论 3
添加红包

请填写红包祝福语或标题

个

红包个数最小为10个

元

红包金额最低5元

当前余额3.43元 前往充值 >
需支付：10.00元
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付元
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明：

1.余额是钱包充值的虚拟货币，按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载，可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值