dicom批量转换为nii.gz,并修改文件名

最新推荐文章于 2025-05-09 15:27:14 发布

Fly*Boy

最新推荐文章于 2025-05-09 15:27:14 发布

阅读量2.1k

点赞数 2

CC 4.0 BY-SA版权

分类专栏：学习文章标签： python

本文链接：https://blog.csdn.net/mvpboy123/article/details/120306770

学习专栏收录该内容

32 篇文章

订阅专栏

这段代码主要用于从DICOM文件夹中读取图像系列，使用SimpleITK库将它们转换为nii.gz格式，并进行编号保存。它遍历指定目录下的所有子文件夹，对每个子文件夹中的DICOM图像执行转换操作。

摘要生成于 C知道，由 DeepSeek-R1 满血版支持，前往体验 >

import SimpleITK as sitk
import os

folderPath = r'C:\Users\Desktop\lung_data\dicom'
outputPath = r'C:\Users\\Desktop\lung_data\1'

num = 371 #编码起始
for i in os.listdir(folderPath):
    file = os.path.join(folderPath, i)
    for folder in os.listdir(file):
        imagePath = os.path.join(file, folder)
        reader = sitk.ImageSeriesReader()
        dicom_names = reader.GetGDCMSeriesFileNames(imagePath)
        reader.SetFileNames(dicom_names)
        image = reader.Execute()
        sitk.WriteImage(image, outputPath + r'\needle_' + str(num) + '_0000.nii.gz') #图像，输出地址—文件名
        print(i + '-' + folder + '-' + str(num))
        num += 1

print("完成")

import SimpleITK as sitk
import os

folderPath = r'C:\Users\320133514\Desktop\DATA1'
outputPath = r'C:\Users\320133514\Desktop\DATA1\1'

num = 371
for i in os.listdir(folderPath):
    file = os.path.join(folderPath, i)
    for folder in os.listdir(file):
        imagePath = os.path.join(file, folder)
        reader = sitk.ImageSeriesReader()
        dicom_names = reader.GetGDCMSeriesFileNames(imagePath)
        reader.SetFileNames(dicom_names)
        image = reader.Execute()
        os.chdir(r'C:\Users\320133514\Desktop\DATA1\2') #使用os.chdir切换到指定输出文件路径
        sitk.WriteImage(image, 'needle_' + str(num) + '_0000.nii.gz') #文件名
        print(i + '-' + folder + '-' + str(num))
        num += 1

print("完成")