单细胞测序分析的多样本整合和去除批次效应教程

本文介绍了OmicsTools,一款无需编程的生物医学研究工具,可用于单细胞测序数据分析、批次效应去除和可视化。提供了Seurat和Harmony方法,以及示例和教程链接。

摘要生成于 C知道 ,由 DeepSeek-R1 满血版支持, 前往体验 >

单细胞测序分析的多样本整合

OmicsTools零代码生信分析软件介绍和下载

我开发了一款本地电脑无限使用的零代码生信数据分析作软图神器电脑软件OmicsTools,欢迎大家使用OmicsTools进行生物医学科研数据分析和作图,该软件件能让大家在不需要任何编程和代码编写的基础上,分析次数没有限制,可以无限使用,让您在自己的电脑上快速进行大量的生信分析和加速大家的科学研究。
在本地电脑无限使用无限分析作图的生信零代码一键分析电脑软件神器OmicsTools 软件在github上的zihaoxingstudy1/OmicsTools仓库 中,大家可以下载安装OmicsTools进行各种生信分析和可视化作图。
软件下载官方网址: https://github.com/zihaoxingstudy1/OmicsTools ,大家可以下载安装OmicsTools进行各种生信分析和可视化作图。

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运行参数解释

func_project:项目名称

func_batch__col:meta.data中含有批次效应的列名,使用harmony整合去除批次效应时要指定

func_tissue__group__col:样本meta.data中的生物学效应分组列

func_method:合并方法,可以使用seurat或harmony

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邢博士谈科教

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