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衡量基因相对表达量的RPKM和FPKM、及TPM1.RPKM（Reads Per Kilobase per Million）和FPKM（Fragments Per Kilobase per Million）1.引入“每一千碱基（per kilobase）”的原因在于，不同的RNA可能有不同长度，长度越长，对应的reads就越多。当每个RNA都除以自身长度（以1000碱基,即kb为单位）时，就可以比较同一个样本中不同基因的相对表达量了。2.引入“每一百万reads”的原因是，不同的样本可能测序的深度不一

常见的降纬方法1.PCA降纬方法2.tSNE降纬分析3.UMAP降纬分析1.PCA降纬方法2.tSNE降纬分析3.UMAP降纬分析

3.1.Oxford Nanopore公司：[纳米孔测序技术]蛋白质纳米孔是微型的小孔，其本质是在膜上形成通道。在我们的技术中，蛋白质纳米孔被嵌入合成膜中，并浸入在电生理溶液中，使离子电流通过纳米孔。当像DNA或RNA这样的分子穿过纳米孔时，它们会对电流带来干扰。该信号会被实时分析，用以确定正在通过纳米孔的DNA或RNA链的碱基序列。英国牛津纳米孔公司 新型纳米孔测序法（nanopore sequencing）是将人工合成的一种多聚合物的膜浸在离子溶液中，多聚合物膜上布满了经改造的穿膜孔的跨膜通道蛋

一代、二代、三代测序技术简要原理及比较1.一代测序2.二代测序3.三代测序3.1.Oxford Nanopore公司：[纳米孔测序技术]3.2.Pacific Bioscience公司：[单分子实时荧光测序技术SMRT]4.一代、二代、三代测序技术的比较：1.一代测序2.二代测序3.三代测序第三代测序技术是指单分子测序技术，DNA测序时，不需要经过PCR扩增，实现了对每一条DNA分子的单独测序。第三代测序技术也叫从头测序技术，即单分子实时DNA测序,主要可以分为单分子荧光测序和纳米孔测序。3

单细胞测序单细胞测序技术（Single cell sequencing）是在单个细胞水平上，对基因组、转录组及表观基因组水平进行测序分析的技术;目前应用最多的是ScRNA-Seq;单细胞测序的流程单细胞RNA测序的主要步骤有：（1）分离消化单细胞 ：一次处理的细胞数量（通量）（2）将RNA转为cDNA：目标mRNA被转化为cDNA的概率（灵敏度）（3）cDNA扩增 ：cDNA扩增后读数能否与对应mRNA丰度成比例（定量准确性）（4）数据分析：数据分析算法单细胞测序的应用（1..