文章目录
- 前言
- 一、配准工具
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- 1.1、基于 Elastix 的可视化配准工具
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- (1)elastix-napari:基于 napari 的 Elastix 图像配准
- (2)SlicerElastix:基于 3D slice 的 Elastix图像配准
- (3)BIRDS:基于 ImageJ 的 Elastix 双通道图像配准
- (4)BigWarp:基于 Fiji - BigDataViewer 的手动逐点变形的配准工具
- (5)Fiji - Plugins - Registration - Register Virtual Stack Slices:指定某帧图像作为参照并提取特征,再对其他帧进行变换。
- (6)ABBA:是一个2D切片配准的可视化工具(集成了DeepSlice、BigWarp和Elastix)
- 1.2、基于ITK开发的配准工具
- 二、可视化工具
- 基础知识
前言
(1)Elastix图像配准:算法原理 + 环境配置 + 项目实战
(2)Elastix图像配准:参数文件(配准精度的关键)
(3)Elastix图像配准:2D图像
(4)Elastix图像配准:3D图像
(5)Elastix图像配准:点集配准(局部区域的精度微调)
一、配准工具
介绍了几款基于ITK + Elastix开发的可视化配准工具,可以当成是界面化的SimpleElastix。
优点:
操作简单,使用方便
缺点:
(1)仅支持rigid、affine、bspline三个参数文件
(2)仅支持单次运行一个参数文件 + 支持加载自定义的三个参数文件