illumina 双末端测序

最新推荐文章于 2024-01-28 19:45:55 发布
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分类专栏： genome bioinformatics_software
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本文链接：https://blog.csdn.net/tommy_12345/article/details/81415786

 

illumina的双末端测序指在打断的DNA片段两头正反方向各测两个片段，可以通过一定算法来进行序列组装，比对等一系列操作，对于基因片段的重复，缺失，和插入来讲，这种方法更加精确（具体算法参考相关文献），而且读长也更长，在基因组上的覆盖面更广。

在双链测序的过程中，如果正负链完全测通（例如测序仪读长为150bp，待测的序列长度<=150bp）测序的末端可能包含adater序列，需要利用软件将adapter去除。

Illumina测序原理
qq_23435961的博客
04-14 5704
Illumina测序原理 这里写目录标题Illumina测序原理1. 文库制备2. 成簇反应3. 测序阶段4. 数据分析 illumina二代测序平台特点：基于可逆终止的、荧光标记dNTP，实现边合成、边测序的工作 文字描述着实有很多局限性，文章起草基于这份视频（双端index），想要更轻松的阅读体验建议配合视频一起看：http://www.bilibili.com/video/av13107081/?share_source=copy_link&p=1&ts=1610448077&amp
illumina测序的一些注意事项
ncyujijian的博客
07-07 6099
illumina测序的一些注意事项 在二代测序领域，illumina测序平台以其核心的三项技术（分别是碱基末端可逆修饰、桥式PCR和边合成变测序策略），独步天下。充分发挥了其碱基读取精确、通量提高、测序长度也稳步提高至双末端各300bp。但是，任何测序技术面对各种测序需求总是会有些许不足，大白话说就是：没有哪项技术可以解决全部的问题。那么，illumina测序有哪些问题是需要注意的呢？我们就来聊聊这个话题。 问题一、测序过程中必须碱基平衡 所谓碱基平衡，是指，测序芯片上完成成簇反应之后，一定面积内的不同分子
单端测序，双端测序，基因组计划图谱
weixin_30544657的博客
07-31 437
nt 特指核酸碱基（nucleotide），mer作为希腊语演化来的词根表示单体，nt=nucleotide, 即核苷酸数，通常用于描述单链，如RNA, primer等bp 是描述核酸或脱氧核酸的大小主要是从碱基角度讲的.DNA双链结构是碱基配对的.base pair.bp=base pair, 即碱基对，用于描述双链的，如DNA,双链RNA等。 单端测序(Single-read)...
【中英双语】Illumina测序原理详解 | 边合成边测序/Sequencing by Synthesis
最新发布
weixin_43843918的博客
01-28 5705
很多朋友们问我视频讲解时用的笔记可不可以分享，那当然必须是可以呐！但我当时其实没有好好记录，只是打了个草稿就开讲啦！既然大家有需求，俺就重新整理了一下，希望可以帮到大家！
单端测序与双末端测序问题
wangprince2017
01-10 9179
单端测序与双末端测序问题 问题 Paired-End测序与Mate-Pair测序相对于单端测序有何优势？ Paired-End中的Read1和Read2到底是啥关系？它们是如何参与拼接和比对的呢？ Mate-Paired与Paird-End两种不同建库测序的区别在哪里？产生的数据有何不同？各自有哪些优缺点？ Single-Read测序、Paired-End测序、Mate-Pair测序，何时选择哪种测序策略？读长、插入序列为多少？ 不懂的问题很多，困惑很多，借此寻.
Illumina Hiseq 2500型和2000型测序仪的比较
huangliangbo的专栏
10-08 1万+
原文来自：http://blog.sina.com.cn/s/blog_53e7471b0101bqw2.html 仪器升级： Hiseq 2500是Hiseq 2000的升级版。 其主要的改进点是：Hiseq 2500可以在快速、高通量两种模式之间切换。高通量模式就是原来的Hiseq2000的每张Flowcell有8个Lane的模式。 Hiseq 2500的快速模式，
illumina 二代测序原理及过程
abdslfwoeugp
05-25 1万+
illumina 二代测序原理及过程
生信小白学习日记Day2——NGS基础 illumina高通量测序原理
weixin_42953727的博客
05-26 1万+
2019年5月26日，周日，小雨 说明：阅读生信宝典和查阅文章的总结，原文请关注公众号生信宝典，参考的博文都附有链接，仅供参考。 生信宝典 NGS基础——高通量测序原理 本文介绍了测序文库构建原理、链特异性文库构建方式和识别方法、测序簇生成过程、双端测序过程、测序接头产生、PCR duplicate、测序通量选择标准等。原文都是一张张PPT，截图下来之后，附一些自己理解的注释吧 以目前最常用的il...
illumina SBS测序详解
sixu_9days的博客
01-02 4万+
最近回头重新看了illlumina paired end sequence的测序原理视频，发现了以前没有注意的一些问题，而这些问题也是大家平时容易搞错的，因此花了几天时间将illumina 的paired end sequence 从构建文库到上机测序的整个过程以及原理较为详细的写了出来。 基础知识：illumina测序的核心在于利用可逆终止的、荧光标记的dNTP进行边合成边测序    
Illumina Hiseq 2500测序平台小片段DNA文库构建方法
Illumina公司的HiSeq 2500是一种高通量测序平台，广泛应用于基因组学、转录组学、表观遗传学和小RNA研究等众多领域。小片段DNA文库的构建是测序实验中一个关键步骤，它是将遗传材料样本准备成适合于高通量测序平台...
Illumina测序基础知识.pdf
09-23
"Illumina测序基础知识" Illumina测序基础知识是指通过Illumina测序仪器对DNA样本进行高通量测序的技术基础知识。该技术的核心组件是Flowcell，它是一个载玻片大小的芯片，内部有八个通道，每个通道的内表面进行了...
测序中，什么是“测通”
ccc_bioinfo的博客
02-14 1万+
今天继续研究DNA测序分析流程，有个步骤引起注意 使用Stithcer软件对测通的双端reads进行组装及过滤… 里面的“测通”是什么意思呢？ 询问了几位前辈，发现我一直以来脑子里对于双端测序都有两个版本的认识混乱存在着。顺次厘清“双端测序”、“插入序列”、“测通”这几个概念。 双端测序 高通量测序在建库时对DNA随机打断成fragment（F），。。后面再议 这里的关键在于理解，如何判断read1和read2是不是一个pair？我之前以为是通过是否有overlap、然后overlap部分识别拼接后合并
单端测序(Single-read)和双端测序(Paired-end和Mate-pair)的关系
光尘的博客
10-09 2万+
目前3种测序技术 Roche 454，illumina Solexa和ABI SOLID均有单端测序和双端测序两种方式。 在基因组De Novo测序过程中，Roche 454的单端测序读长可以达到400 bp，经常用于基因组骨架的组装，而Solexa和ABI SOLID双端测序可以用于组装scaffolds和填补gap。下面以solexa为例，对单端测序(Single-read)和双端测序(Pa...
关于双端测序
weixin_34221276的博客
05-22 5528
2019独角兽企业重金招聘Python工程师标准>>> ...
测序技术的一些原理理解（sanger测序与illumina测序）
wangprince2017
08-19 2万+
sanger测序sanger是第一代测序，它是使用的链终止法。下面我来说说我的理解。 当你拿到你需要测定的测序后（一般sanger测序为几百bp）， 首先，加热变性使双螺旋解螺旋，然后将引物结合到一条链上，如图： 将结合了引物的序列等量放入4个反应体系中，然后将dna聚合酶和dNTPs加入各个反应体系中； 下一步，也是最关键的一步，在四个不同的反应体系中分别加入A,T,C,G四种带...
Illumina平台测序原理–详细而易懂
life_journey的博客
10-11 7540
Illumina平台测序原理–详细而易懂 转载：https://wenku.baidu.com/view/ea7894faddccda38376baff3.html?pn=50
二代测序的原理和简介
yearstime的博客
03-25 2万+
二代测序的简介 ​ 第二代测序（Next-generation sequencing，NGS）又称为高通量测序（High-throughput sequencing），是基于PCR和基因芯片发展而来的DNA测序技术。我们都知道一代测序为合成终止测序，而二代测序开创性的引入了可逆终止末端，从而实现边合成边测序（Sequencing by Synthesis）。二代测序在DNA复制过程中通过捕捉新添加的碱基所携带的特殊标记（一般为荧光分子标记）来确定DNA的序列，现有的技术平台主要包括Roche的454 FLX
illumina不愧是二代测序无冕之王
shengxinxiaobaibai的博客
10-11 6295
写在前面 illlumina公司自1998年成立，至2012年成为全球范围内最主要的测序平台后，illumina测序仪的产品发布也快速更迭，在2014年美国科技评论杂志MIT Technology Review 的评选结果中，illumina公司入选“2014年度全球创新企业50强”，并高居基因测序仪器公司的榜首；而在2018年的“福布斯”杂志评选的2018年全球最具创新企业百强榜单中，illum...
二代测序原理（Illumina）
热门推荐
Baimoc
10-12 7万+
虽然三代测序现在已经商用，但是目前的主流还是二代测序，尤其是Illumina公司的测序方式更是大行其道。那么，下面我们从四个方面来说说illumina家的二代测序是怎么得到的生物数据。 0、 基本原理 基于可逆终止的，荧光标记dNTP，做边合成边测序 分为三步： 样本准备 Sample Prep 成簇 Cluster Generation 测序 Sequencing 数据分析 Data Anal...
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