生信入门第九课：PCA、相关性、热图和火山图及代码详解

最新推荐文章于 2025-05-26 13:22:16 发布
原创 最新推荐文章于 2025-05-26 13:22:16 发布 · 270 阅读 · 0 ·
CC 4.0 BY-SA版权
版权声明：本文为博主原创文章，遵循 CC 4.0 BY-SA 版权协议，转载请附上原文出处链接和本声明。
文章标签：

#PCA #相关系数 #热图 #火山图 #R代码 #科学科普 #生信分析

微生信助力高分文章，用户220000+，谷歌学术4400+

生信分析（1）——PCA主成分分析及绘图（附代码）
abao不想写代码的博客
05-09 318
PCA（主成分分析）是一种数据降维方法，用于从多个特征中提取最能代表数据变化的主成分，从而简化数据分析和可视化。PCA的主要作用包括压缩特征、去除冗余信息以及方便数据可视化和建模。在生物信息学中，PCA常用于代谢物分析。本文以R语言为例，展示了如何进行PCA分析：首先读取并整理数据，进行归一化、对数转换和标准化处理，然后进行PCA分析并绘制2D得分图。最终的可视化结果能够清晰展示不同组别（如癌症与对照组）在主成分空间中的分布情况，帮助研究者更好地理解数据。
科研绘图系列：R语言热图和PCA（heatmap PCA）
专注生信领域
08-27 1662
科研绘图系列：R语言热图和PCA（heatmap PCA）
生信入门第十三课：RNA-seq原始数据上传到GEO数据库详细步骤
微生信
12-24 587
生信入门第十三课：介绍了RNA-seq原始数据 上传到GEO数据库详细步骤
WGCNA分析流程详解及应用
weixin_35755562的博客
05-26 1385
加权基因共表达网络分析（WGCNA）是一种基于系统生物学原理的强大工具，它通过建立基因之间的相关性网络来识别与特定表型密切相关的模块。WGCNA不仅可以用于分析基因数据，还广泛应用于表型特征的预测以及生物标志物的识别。由于其能够在复杂的生物系统中揭示基因调控关系，WGCNA已成为基因组学和功能基因组学研究的有力补充。
送你一个目录，一站式学习生信！众多干货，有趣有料！
悟道西方
12-20 8713
生信的作用越来越大，想学的人越来越多，不管是为了以后发展，还是为了解决眼下的问题。但生信学习不是一朝一夕就可以完成的事情，也许你可以很短时间学会一个交互式软件的操作，却不能看完程序教学视频...
生信宝典教程大放送，一站式学习生信技术
悟道西方
11-14 5893
生物信息学包含生物数据分析、数据可视化、重复工作程序化，是生物、医学科研必备的技能之一。生信宝典精心组织生信学习系列教程、生信工具精品教程，通过大量的生信例子、关键的注释、浓缩的语句和录...
代谢组数据分析（零）：从质谱样本制备到MaxQuant搜库（蛋白质组和代谢组）
专注生信领域
05-01 4940
本文详细介绍了代谢组数据分析的过程，从LC-MS/MS技术的样本制备、分离、质谱鉴定到MaxQuant软件的使用。LC-MS/MS包括样本制备、液相色谱分离、质谱上机和鉴定等步骤。MaxQuant在蛋白质定性和定量中扮演关键角色，通过搜库和数据处理提供精准结果。此外，文章还涉及了数据采集模式、质谱图谱解析、数据库和软件选择以及结果评估等方面
精心整理（含图版）|你要的全拿走！（R数据分析，可视化，生信实战）
weixin_39556044的博客
11-12 1874
本文首发于“生信补给站”公众号，https://mp.weixin.qq.com/s/ZEjaxDifNATeV8fO4krOIQ 更多关于R语言，ggplot2绘图，生信分析的内容，敬请关注小号。 为了能更方便的查看，检索，对文章进行了精心的整理。建议收藏，各取所需，当前没用也许以后就用到了呢！ 一 R资料+计划 R语言精品资料年中无套路赠送 R-plotly|交互式甘特图（Gantt c...
送书 | 知乎阅读300w+的生信学习指南（更新版）
悟道西方
05-03 4678
先送书在上周的留言送书活动中，恭喜下面这位读者获得书籍“Oracle高性能系统架构实战大全”，请及时与生信宝典编辑（shengxinbaodian）联系。2020过去三分之一了，您年初定...
【R语言生信分析的7大绝技】：COUNT到TPM转换的终极指南
![【R语言生信分析的7大绝技】：COUNT到TPM转换的终极指南]...特别是在基因表达分析、基因组学、蛋白质组学等研究领域，R语言因其内置的丰富统计函数库和易用的数据可视化工具，成为生信分析不可或缺的一部分。 R语言
GWAS ATLAS:最全面的GWAS数据库
庐州月光的博客
11-24 7232
欢迎关注”生信修炼手册”!GWAS ATLAS数据库收录了来自4756个人类不同表型的GWAS结果，并进行了不同表型间的遗传相关性分析，对应的文献发表在nature genetics上，...
基因型与表型的交互作用如何分析，多元回归来搞定
庐州月光的博客
10-17 4120
欢迎关注”生信修炼手册”!回归分析最为关联分析中最长使用的一种手段，除了可以进行协变量的校正，还可以分析各种因素间的交互作用，比如SNP与表型，SNP与环境之间的交互。具体是如何实现的呢...
02.《大数据》配套之二：-数据采集与预处理PPT.ppt
08-04
02.《大数据》配套之二：-数据采集与预处理PPT.ppt
PLC的编程实例电机正反转控制演示幻灯片.ppt
08-04
PLC的编程实例电机正反转控制演示幻灯片.ppt
计算机组成原理所有概念.ppt
08-04
计算机组成原理所有概念.ppt
计算机配许课上C语言数据类型和学习框架思维导图
08-04
课上总结
推荐-办公软件学习.ppt
08-04
推荐-办公软件学习.ppt
yaochao_edu_source_crawler_2920_1754319247437.zip
最新发布
08-04
yaochao_edu_source_crawler_2920_1754319247437.zip
评论
添加红包

请填写红包祝福语或标题

个

红包个数最小为10个

元

红包金额最低5元

当前余额3.43元 前往充值 >
需支付：10.00元
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付元
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明：

1.余额是钱包充值的虚拟货币，按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载，可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值