稀疏矩阵存储格式总结+存储效率对比:COO,CSR,DIA,ELL,HYB

本文介绍了稀疏矩阵的五种典型存储格式:COO, CSR, DIA, ELL和HYB。CSR是标准格式,适合大部分操作;ELL在矩阵-向量乘法中效率高,但可能造成存储浪费;DIA适合对角线主导的矩阵;HYB结合ELL和COO优点;COO则适用于文件读写。不同格式适用于不同类型的计算任务和矩阵特性。" 114361543,643027,WebRTC客户端实现:SimplePeerConnection详解,"['WebRTC开发', '客户端编程', 'rtc库', '音频处理', '视频处理']

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稀疏矩阵是指矩阵中的元素大部分是0的矩阵,事实上,实际问题中大规模矩阵基本上都是稀疏矩阵,很多稀疏度在90%甚至99%以上。因此我们需要有高效的稀疏矩阵存储格式。本文总结几种典型的格式:COO,CSR,DIA,ELL,HYB。

 

(1)Coordinate(COO)

image

这是最简单的一种格式,每一个元素需要用一个三元组来表示,分别是(行号,列号,数值),对应上图右边的一列。这种方式简单,但是记录单信息多(行列),每个三元组自己可以定位,因此空间不是最优。

 

(2)Compressed Sparse Row (CSR)

image

CSR是比较标准的一种,也需要三类数据来表达:数值,列号,以及行偏移。CSR不是三元组,而是整体的编码方式。数值和列号与COO一致,表示一个元素以及其列号,行偏移表示某一行的第一个元素在values里面的起始偏移位置。如上图中,第一行元素1是0偏移,第二行元素2是2偏移,第三行元素5是4偏移,第4行元素6是7偏移。在行偏移的最后补上矩阵总的元素个数,本例中是9。

 

CSC是和CSR相对应的一种方式,即按列压缩的意思。

以上图中矩阵为例:

Values:        [1 5 7 2 6 8 3 9 4]

Row Indices:[0 2 0 1 3 1 2 2 3]

Column Offsets:[0 2 5 7 9]

 

再来看一个CSR的例子[4]:

96202_2458312_1

 

(3)ELLPACK (ELL)

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用两个和原始矩阵相同行数的矩阵来存:第一个矩阵存的是列号,第二个矩阵存的是数值,行号就不存了,用自身所在的行来表示;这两个矩阵每一行都是从头开始放,如

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