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本文简要介绍了多款开源软件及工具,包括miRanda、MariaDB、MISO等。涉及开发语言有C、C++、Python、Java等,开源协议包含GPL、MIT等。还提及云服务器要求和操作系统要求,部分工具给出安装说明,同时介绍了华为云帮助中心相关服务。

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简要介绍miRanda是一种用于寻找microRNA基因组靶标的算法。该算法已用C语言编写,可以作为GPL下的开源方法使用。开发语言:C/C++一句话描述:寻找microRNA基因组靶标的算法开源协议:GPL建议的版本根据实际需要选择版本,本文档以miRanda-3.3a为例进行说明。云服务器要求本文以云服务器KC1实例测试,云服务器配置

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简要介绍MariaDB数据库管理系统是MySQL的一个分支,主要由开源社区在维护,采用GPL授权许可MariaDB的目的是完全兼容MySQL,包括API和命令行,使之能轻松成为MySQL的代替品。语言:C一句话描述:MySQL开源分支。开源协议:GPL云服务器要求本文以云服务器KC1实例测试,云服务器配置如表1所示。操作系统要求操作系统要

简要介绍MISO(同工型混合物)是一种概率框架,可从RNA-Seq数据中定量分析可变剪接基因的表达水平,并鉴定样品中差异调控的同工型或外显子。通过从RNA-Seq中的同工型产生读数的生成过程进行建模,MISO模型使用贝叶斯推断来计算读数源自同工型的可能性。开发语言:Python一句话描述:可变剪切分析工具开源协议:MIT建议的版本根据实际

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简要介绍Oases是一个转录组组装器,旨在没有任何基因组组装的情况下从短读测序技术生成转录本。开发语言:C一句话描述:基因组装软件开源协议:GPL 3.0建议的版本建议使用版本为最新版本,此处以oases0.2.09版本为例说明。云服务器要求本文以云服务器KC1实例测试,云服务器配置如表1所示。操作系统要求操作系统要求如表2所示。安装相关

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简要介绍Keepalived的作用是检测服务器的状态。假设有一台服务器出现故障,Keepalived将检测到,并将有故障的服务器从系统中剔除,同时使用其他服务器代替该服务器的工作。当服务器工作正常后,Keepalived自动将服务器加入到服务器群中。这些工作全部自动完成,不需要人工干涉,需要人工做的只是修复故障的服务器。语言:C/C++一

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简要介绍PHP-FPM(PHP FastCGI Process Manager),PHP FastCGI进程管理器,用于管理PHP进程池的软件,用于接受web服务器的请求。PHP-FPM提供了更好的PHP进程管理方式,可以有效控制内存和进程、可以平滑重载PHP配置。语言:C一句话描述:可以更好地有效管理PHP进程。开源协议:PHP建议的版

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简要介绍StringTie是一种快速高效的RNA-Seq序列比对组装器。它的输入不仅包括其他转录本汇编程序也可以使用短读序列的对比。为了在实验之间鉴定差异表达的基因,可以使用Ballgown,Cuffdiff或其他(DESeq,edgeR等)专用软件来处理StringTie的输出。开发语言:C++一句话描述:RNA-Seq组装工具开源协议

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简要介绍clang是一个C++编写、基于LLVM、发布于LLVM BSD许可证下的C/C++/Objective-C/Objective-C++编译器。语言:C++一句话描述:C/C++/Objective-C/Objective-C++编译器开源协议:Apache License Version 2.0建议的版本建议使用版本为clang

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简要介绍ipvsadm是LVS的管理工具。语言:C/C++一句话描述:LVS管理工具开源协议:GPL2云服务器要求本文以云服务器KC1实例测试,云服务器配置如表1所示。操作系统要求操作系统要求如表2所示。通过yum方式安装即可。yum install ipvsadm执行ipvsadm命令。ipvsadm回显如图1所示。使用LVS功能,内核

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简要介绍Doxygen是一种开源跨平台的、类似JavaDoc风格描述的文档系统,完全支持C、C++、Java、Objective-C和IDL语言,部分支持PHP、C#语言。Doxygen是一个程序的文件生成工具,可将程序中的特定注释转换成说明文件。语言:C++一句话描述:可将程序中注释转换成说明文件的工具开源协议:GNU GENERAL

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简要介绍randfold是一个独立的基因测序相关软件,它从原始序列开始随机显示其核苷酸顺序。它根据改组后的序列计算推断结构的最小自由能(MFE),并多次重复计算以建立最小自由能(MFE)值的分布。开发语言:C一句话描述:基因序列二级结构随机测试软件开源协议:GPL 2.0建议的版本建议使用最新版本,此处以randfold2.01版本为例说

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