Unetr++训练自己的数据集 01总纲

unetr++训练自己的数据集，找遍了全网没有，自己写一个

实验数据集为下载的公开数据集。U-Net网络包含编码和解码两部分,编码器进行下采样,提取原始图像空间特征,解码器进行上采样,根据编码器所提取的空间特征构造出图像。为了防止对应特征丢失,对应编码器和解码器之间有跳跃连接。U-Net的编码器采用两层3x3卷积、ReLU激活函数和2×2最大池化,来提取图像特征,共进行4次下采样,该过程降低特征图尺寸,增加通道数。解码器部分使用2×2反卷积进行上采样,减少通道数,逐渐恢复特征图尺寸。

在医疗图像分割任务中，transformer模型获得了巨大的成功，UNETR提出了efficient paired attention (EPA) 模块，利用了空间和通道注意力来有效地学习通道和空间的特征，该模型在Synapse，BTCV,ACDC,BRaTs数据集上都获得了很好地效果。

【代码】[医学影像分割] nnunet 如何创建自己的数据集？

UNETR++：高效且精确的3D医学图像分割工具 在医学图像处理领域，精确且高效的图像分割技术对于疾病诊断和治疗至关重要。UNETR++项目，由Mohamed Bin Zayed University of Artificial Intelligence等机构联合开发，旨在提供一种既高效又准确的3D医学图像分割方法。本文将详细介绍UNETR++的项目背景、技术特点、应用场景及其独特优势。 项目介绍...

UNETR++：轻量级的、高效、准确的共享权重的3D医学图像分割高效配对注意(EPA)块，该块使用一对基于空间和通道注意的相互依赖的分支来有效地学习空间和通道方面的判别特征

得益于Transformer模型的成功，近期研究开始探索其在3D医学分割任务中的适用性。在Transformer模型中，自注意力机制是核心构建模块之一，与基于局部卷积的设计相比，它致力于捕捉长距离依赖关系。然而，自注意力操作存在二次复杂度问题，这已成为计算瓶颈，尤其在体医学成像中——此类输入为3D形式且包含大量切片。本文提出一种3D医学图像分割方法，名为UNETR++，该方法既能生成高质量分割掩码，又在参数数量、计算成本和推理速度方面具备高效性。

在本文中，我们提出了一种名为unetr++的三维医学图像分割方法，该方法既提供了高质量的分割mask，又在参数、计算成本和推理速度方面具有效率。我们设计的核心是引入一种新的高效成对注意(efficient paired attention， EPA)块，该块使用基于空间和通道注意的一对相互依赖的分支有效地学习空间和通道方面的判别特征。

UNETR++。通过引入有效的配对注意力（EPA）模块，UNETR++能够丰富空间和通道之间相关依赖的特征。在配对注意力（EPA）模块中，共享query和key的映射函数权重能够使得空间和通道分支进行更高效地交流特征信息，这可以为双方提供互补的有益特征并且降低参数量。UNETR++在三个国际著名医学图象分割数据集中均以更少的模型复杂度取得最更高的精度结果。

杀疯了! | UNETR++：轻量级的共享权重Transformer称霸医学图像分割领域

UNETR++ 开源项目教程 项目介绍 UNETR++ 是一个用于高效和准确的三维医学图像分割的开源项目。该项目基于 IEEE TMI-2024 论文，旨在通过改进的 Transformer 模型来提升医学图像分割的性能。UNETR++ 结合了 Transformer 的自注意力机制和传统的卷积神经网络，以处理三维医学图像数据。 项目快速启动 环境配置 首先，确保你的开发环境满足以下要求： Py...

UNETR: Transformers for 3D Medical Image Segmentation 背景： 1、具有跟踪和扩展路径的全卷积神经网络（FCNNs）（如编码器和解码器），近年来在各种医学图像分割应用中显示出了突出的地位。在这些体系结构中，编码器通过学习全局上下文表示来扮演一个不可或缺的角色，该全局上下文表示将进一步用于解码器的语义输出预测。 2、卷积层作为FCNN的主要构造块，其局部性限制了此类网络学习长时空间依赖的能力。 3、在NLP领域，基于transformer的模型已经在各种任务

UNETR++ 开源项目安装与使用指南 1. 目录结构及介绍 该项目采用了清晰的目录结构来组织代码和资源，以下是对主要目录及其作用的简要说明： src 此目录包含了项目的核心功能实现。 models 存储所有模型定义及相关函数。 utils 存放辅助函数和工具类。 data 负责管理数据集的下载、预处理以及加载操作。 scripts 提供了一系列脚本来执行常见的任务，例如训练、评估和推理等。 co...

本文主要记载 nnFormer 从安装到训练再到推理的过程。nnFormer 的环境十分难配，训练和推理都是 2 行代码搞定，要想成功训练 nnFormer，首先得确保自己的环境配置的没有问题。按照上面的流程执行一遍后，就可以得到属于你自己的 nnFormer 了！参考资料。

unet++ 学习历程记录 0、一位大大的论文解读 https://blog.csdn.net/weixin_40519315/article/details/104457459 1、unet++作者在知乎上的解读 https://zhuanlan.zhihu.com/p/44958351 get到了网络大致是在保留原来unet的长跳的同时加了许多小跳 用到了深监督。 因为采用了深监督，所有可以进行剪枝。因为L1到L4均可以计算loss，我个人的理解是。 2、unet++作者的视频解读，没了打不开 http

UNet图像分割GitHub程序复现（含数据集）

1. 背景介绍 1.1 图像分割的挑战与需求 图像分割是计算机视觉领域的一项重要任务，其目标是将图像分割成多个具有语义意义的区域。这项技术在许多领域都有着广泛的应用，例如： 医学影像分析: 识别肿瘤、器官和病变区域。