Unetr++训练自己的数据集 02环境配置

一.语义分割 二.上采样和下采样 1.下采样的作用： （1）是减少计算量，防止过拟合。 （2）是增大感受野，使得后面的卷积核能够学到更加全局的信息。 2.下采样的方式： （1）采用stride为2的池化层，如Max-pooling和Average-pooling，目前通常使用Max-pooling，因为计算简单而且能够更好的保留纹理特征； （2）采用stride为2的卷积层，下采样的过程是一个信息损失的过程，而池化层是不可学习的，用stride为2的可学习卷积层来代替pooling可以得到更

（默认所需环境已经配置好，且为linux环境与linux命令） （1） 安装hiddenlayer pip install --upgrade git+https://github.com/nanohanno/hiddenlayer.git@bugfix/get_trace_graph#egg=hiddenlayer （一行） （2）安装nnUNet 1、在空间充足的位置安装nnUNet(最好超过100G)，在该位置mkdir home 2、然后进入home文件夹mkdir nnUNetFrame，进入

由主函数进入网络结构这个大函数下，设置网络。仅记录部分

那只好再去构建一下张量，它这里的2是来自于Dataloder里面的一个参数batch_size（自己可以去了解一下，很重要的一个东西）。第二步是对我们数据的尺寸处理，尺寸必须是符合网络输入尺寸的，input_H和input_w也是要相应对应，这段代码在train和val.py里面都有相应的。上面的问题，应该是源自我没能把tqdm原理搞明白，或者是val_loader里面打印的时候只返回二进制，没有有用的信息，那我只好另外写新的代码了。那么我想用自己的几张数据去用这个模型，只要换一下数据就行了吗？

环境配置 先安装Anaconda，再安装cuda，配置torch环境 一、Anaconda安装 Anaconda的安装主要是为了方便环境管理，可以同时在一个电脑上安装多种环境，不同环境放置不同框架：pytorch、tensorflow、keras可以在不同的环境下安装，只需要使用conda create –n创建新环境即可。 1、Anaconda的下载 anaconda的下载： 如果想要安装最新的Anaconda，首先登录Anaconda的官网：https://www.anaconda.com

unetr++训练自己的数据集，找遍了全网没有，自己写一个

UNet（全名为 U-Net）是一种深度学习架构，最初由Olaf Ronneberger、Philipp Fischer和Thomas Brox于2015年提出，用于图像分割任务。该网络的名称来源于其U形状的架构，该架构使得网络在编码和解码过程中能够捕捉多尺度的特征信息。UNet主要用于语义分割，医学图像分割等领域，其优点在于可以有效地学习和还原输入图像的细节。

【代码】RTX4060ti配置unet-pytorch的环境。

UNet图像分割GitHub程序复现（含数据集）

包括三种U-Net网络配置，分别是2D U-Net，3D全分辨率U-Net，3D U-Net级联（包括3D低分辨率U-Net和3D全分辨率U-Net），要进行级联下的3D全分辨率U-Net需先完成3D低分辨率U-Net。注意不是所有的数据集都能触发级联，在完成数据集预处理的图中可以看到，本数据集仅有2d和3d_fullres，对于部分数据集来说，还有3d_lowres, 3d_cascade_fullres，而肝细胞肿瘤数据集就可以触发级联（暂时还不明白这是不是与数据集大小有关0.0）修改epoch。

nnUNetv2初使用，分享内容包括：环境配置、数据集文件构建、数据格式化、数据预处理、数据训练整体流程说明。

本人初步接触深度学习与医学图像分割领域，第一个项目就是运用nnUNet网络对BrainTumour的数据集进行分割，在学习的过程中，学了很多资料，踩了很多坑，也解决了很多bug，在此把自己的学习经验分享出来，希望有需要的同学可以少走一些弯路。本篇博客的操作均在服务器的linux系统（Ubuntu）上进行。作者的建议也是使用linux系统。本篇文章使用的数据集为Medical Segmentation Decathlon比赛的Task01_BrainTumour数据集。

nnUNet是一个自动化的深度学习框架，专为医学图像分割而设计，具有高效性和灵活性。本教程将引导你从环境配置到模型训练和推理的整个过程。

在图像分割这个问题上，主要有两个流派：Encoder-Decoder和Dialated Conv。本文介绍的是编解码网络中最为经典的U-Net。随着骨干网路的进化，很多相应衍生出来的网络大多都是对于Unet进行了改进但是本质上的思路还是没有太多的变化。比如结合DenseNet 和Unet的FCDenseNet, Unet++ 一、Unet网络介绍 论文：https://arxiv.org/abs/1505.04597v1(2015) UNet的设计就是应用与医学图像的分割。由于医学影像处理中，数据..

搭建一个简单的Unet

本文介绍如何使用pytorch搭建UNet网络结构进行医学视网膜血管影像分割