文章介绍了协方差分析的基本思想和应用条件，强调了它在消除协变量影响、揭示处理效应中的作用。协方差分析适用于处理效应与协变量存在线性关系的情况，并需满足正态性、独立性和方差齐性的前提。文章详细阐述了协方差分析的步骤，包括建立线性回归、方差分析和误差项检验等，以及如何进行后续的处理组间比较和修正均数计算。
一. 协方差分析的基本思想和应用条件
协变量：影响处理效应而无法人为控制或难以控制的实验因素，称为协变量。
协方差分析：协方差分析可以消除协变量对处理效应的影响，将不同处理的处理效应真正地显现出来，它是一种将直线回归和方差分析结合起来的统计学分析方法
通过一个示例来理解下协变量和协方差分析
在上述例题中，样本分为3个治疗组，每个治疗组所用药物不同，这个分组变量就是想探究的处理因素X, 实验效应通过患者治疗前后的糖化血红蛋白的含量来反映，对资料进行统计，可以到如下所示的表格
其中患者初始的糖化血红蛋白含量是难以控制的定量因素，称为协变量X；试验的观察指标是患者治疗3个月后的糖化血红蛋白含量，称为应变量Y。
三个治疗组患者的初始糖化血红蛋白含量均数不同，且差异具有统计学意义，这意味着初始糖化血红蛋白含量与治疗药物的效应混杂，即患者治疗3个月后的糖化血红蛋白含量的多少除了与治疗药物有关，还受其初始糖化血红蛋白含量的影响。针对这种数据，我们就可以采用协方差分析。
协方差分析的应用条件：
一是与方差分析的应用条件相同，即理论上要求观察变量服从正态分布，各观察变量相互独立，各样本来自的总体方差齐性
二是各总体客观存在应变量对协变量的线性回归关系且斜率相同(即各组回归线平行)，即要求各样本回归系数本身有统计学意义，且各样本回归系数间的差别无统计学意义
因此，在进行协方差分析时，必须先对样本资料进行正态性，方差齐性检验和回归平行的假设检验。
协方差分析的基本思想：
将定量变量X(指未加或难以控制的因素)对Y的影响看做是协变量，建立应变量Y随协变量X变化的线性回归关系，并利用这种回归关系把X值转化为相等后，在进行各组Y的修正均数的比较，其实质就是从Y的总平方和中扣除协变量X对Y的回归平方和，对残差平方和做进一步分解后再进行方差分析，以更好的评价处理因素的效应。
二. 协方差分析的步骤
1）计算校正数和总变异的离均差平方和，公式如下
2）计算组间离均差平方和，积和及自由度
3）计算组内误差平方和与自由度
4）计算校正后的应变量Y的总平方和与自由度，公式如下
5）计算校正后的应变量Y的误差平方和与自由度，公式如下
6）计算校正后的应变量Y的处理组间平方和与自由度，公式如下
7）根据如下所示的协方差分析表，对校正后的应变量Y进行方差分析
8）误差项回归关系分析
9）对误差项系数进行F检验，公式如下
10）修正均数的计算，公式如下
11）在协方差分析中如果有多个处理组，并且得出的结论为各组间修正均数的差别有统计学意义时，应对修正均数继续做两两比较，常采用两两比较的t检验，公式如下
·end·
—如果喜欢，快分享给你的朋友们吧—
原创不易，欢迎收藏，点赞，转发！生信知识浩瀚如海，在生信学习的道路上，让我们一起并肩作战！
本公众号深耕耘生信领域多年，具有丰富的数据分析经验，致力于提供真正有价值的数据分析服务，擅长个性化分析，欢迎有需要的老师和同学前来咨询。
更多精彩
写在最后
转发本文至朋友圈，后台私信截图即可加入生信交流群，和小伙伴一起学习交流。
扫描下方二维码，关注我们，解锁更多精彩内容！
一个只分享干货的
生信公众号
扫一扫
2149
被折叠的 条评论
为什么被折叠?
到【灌水乐园】发言
