普通邻接矩阵（类型torch.Tensor）转为torch.sparse_coo稀疏矩阵

刚开始学习图神经网络，在使用PyG框架编程的时候，有一件事很让我纠结：PyG要求输入的邻接矩阵X应该是稀疏矩阵的形式（edge_index），而不是我制作的NxN邻接矩阵形式。 举个简单的例子，看下面这个图结构： 邻接矩阵的创建如下： A = np.array([0, 1, 0], [1, 0, 1], [0, 1, 0]) A = torch.LongTensor(A) 然后你会发现扔进PyG搭建的GCN模型报错了啊！ ValueError: `MessagePassing.propa

Tensor数据转换为稀疏矩阵进行存储读取还原

scipy.sparse: todense() pytorch中的稀疏张量tensor： to_dense()

函数功能：生成稀疏矩阵 使用方法 ：S = sparse(A) 将矩阵A转化为稀疏矩阵形式，即矩阵A中任何0元素被去除，非零元素及其下标组成矩阵S。如果A本身是稀疏的，sparse(S)返回S。 S = sparse(i,j,s,m,n,nzmax) 由向量i,j,s生成一个m*n的含有nzmax个非零元素的稀疏矩阵S，并且有 S(i(k),j(k)) = s(k)。向量 i，j 和 s 有相同的...

Tensorflow中将稠密矩阵转为稀疏矩阵。

Tensor中有属性torch.dtype（数据类型）， torch.device（对象创建后存储在的设备名称） torch.layout（torch.Tensor内存布局的对象）三种属性 torch.Tensor([1,2,3],dtype=torch.float32,device=torch.device('cpu')) torch.sparse_coo_tensor 定义稀疏的张量 默认cpu 使用cuda 三个参数 ...

文章目录前言构造属性和运算 前言 import torch 当一个tensor有特别多0的时候，我们可以使用稀疏矩阵来存储，大家可能都听过的库是sicpy，不过，本文要讲的是torch。 构造 有大量0元素的时候，我们可以使用坐标形式存储稀疏矩阵，例如我们有一个3*3的矩阵，但是只有0，0处有值，值为1，其他地方全为0，那么我们只需要如下做即可： i = torch.LongTensor([[0], [0]]) v = torch.FloatTensor

WARNING此API目前是实验性的，可能会用在以后更新的版本，我目前看的文档是 v1.1.0在TENSOR ATTRIBUTES 中提到，torch.tensor都有三个属性：dtype, device, layout，而layout支持两种内存布局模式：torch.strided 和 torch.sparse_cooTorch支持COO（rdinate）格式的稀疏张量，可以有效地存储和处理大多...

前言 这几天接触图神经网络，会发现有些图的边相对结点比较少，那么邻接矩阵很多元素都为0， 显然，我们可以优化存储策略，以节省内存和加快运算。本文udating… 例子 import torch # 邻接矩阵 adj_dense = torch.tensor([[2, 0], [0, 3]]) # 下标 [0, 0], [1, 1] indices = torch.tensor([[0, 1], [0, 1]]) values = torch.tensor

numpy array转scipy csr matrix，互相转换，和转coo矩阵。

pytorch稀疏矩阵（torch.sparse）Pytorch稀疏矩阵处理稀疏矩阵存储方式1. COO2. CSR/CSC3. LIL稀疏矩阵的处理1.torch.sparse.FloatTensor类参考资料Pytorch稀疏矩阵处理本文将简单介绍稀疏矩阵常用的存储方式和Pytorch中稀疏矩阵的处理方法。常用的稀疏矩阵存储格式有COO，CSR/CSC，LIL。稀疏矩阵存储方式1. COO。

pytorch 中稀疏矩阵和 dense 矩阵互转。

本文主要使用Pytorch 和 Numpy 实现图的 Adjacency Matrix 与 edge_index, 和edge_w相互转化