外泌体相关基因肝癌临床模型预测——2-3分纯生信文章复现——03.差异表达基因筛选（2）

内容如下：

1.外泌体和肝癌TCGA数据下载

2.数据格式整理

3.差异表达基因筛选

4.预后相关外泌体基因确定

5.拷贝数变异及突变图谱

6.外泌体基因功能注释

7.LASSO回归筛选外泌体预后模型

8.预后模型验证

9.预后模型鲁棒性分析

10.独立预后因素分析及与临床的相关性分析

11.列线图，ROC曲线，校准曲线，DCA曲线

12.外部数据集验证

13.外泌体模型与免疫的关系

14.外泌体模型与单细胞测序

############################## 03.差异表达基因筛选 #############################

 上次讲了差异表达基因，通过正则表达式将肿瘤组和正常组提取出来，然后肿瘤组放前面，正常组放后面进行差异表达分析，下面讲一个万能的办法，不用正则表达式，就是自己生成一个表达，对样本ID进行分组。

如我们肝癌的样本，我们复制到一个新的表格里面，然后对每个样本进行分组标记：