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原创 课前准备--10X visium通讯分析策略(Distance-based和Neighborhood-based)
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2025-06-14 17:16:49
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原创 课前准备--大panel高精度空转(Xenium、seqFISH、CosMx等)依赖空间距离的细胞邻域通讯
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2025-06-11 10:59:22
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原创 文献分享----头颈癌中成熟的三级淋巴结构通过祖细胞衰竭的CD4+ T细胞引起肿瘤内T和B细胞反应
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2025-06-06 16:57:52
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原创 文献分享---人动脉粥样硬化斑块中三级淋巴样器官结构的单细胞空间转录组学研究(Stereo-seq)
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2025-05-30 09:47:59
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原创 知识积累--python版本的生物学通路与富集分析(MSigDB、progeny)
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2025-05-28 18:02:14
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原创 多组学文献分享---Mosaic Focal Cortical Dysplasia单细胞基因分型和转录组学分析(突变 + 单细胞 + 空间)
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2025-05-22 16:57:13
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原创 顶刊方法分享---CNA neighbourhood analysis(inferCNV + moilR)
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2025-05-22 16:42:31
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原创 多组学文献分享---T-bet+CD8+ T细胞在微卫星稳定型胃癌中控制抗PD-1应答
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2025-05-22 16:39:59
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原创 CosMx文献分享---滑膜组织髓样树突状细胞亚群在健康和类风湿关节炎中表现出不同的组织生态位定位和功能
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2025-05-10 11:05:02
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原创 文献分享--将空间转录组学和ECM成像结合在3D中用于绘制肿瘤微环境中的细胞相互作用(CosMx)
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2025-04-28 15:59:39
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原创 OmicVerse---bulk、单细胞、空间基础分析框架(重点是cNMF)
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2025-04-24 15:46:49
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原创 多组学文献分享--高危神经母细胞瘤的纵向单细胞多组图谱揭示了化疗诱导的肿瘤微环境重建
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2025-04-17 11:16:18
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原创 内容复习--Xenium 5k (包括CosMx大panel)基础与多样本整合分析
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2025-04-16 16:33:39
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原创 方法更新----关于HD、Stereo-seq在bin模式下的细胞邻域分析
方法更新----关于HD、Stereo-seq在bin模式下的细胞邻域分析(double)
2025-04-14 11:26:55
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原创 文献分享---抗体-药物偶联物SHR-A1811在HER 2阳性乳腺癌新辅助治疗中疗效的空间决定因素(WGS + Xenium)
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2025-04-12 17:10:55
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原创 文献分享---单细胞和空间RNA测序识别早发性与晚发性前列腺癌的不同微环境和进展特征
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2025-04-11 11:39:26
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