Python-MNE全套教程（官网翻译）-入门06：配置MNE-python

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#python #numpy #学习

于 2024-07-31 22:13:05 首次发布

本教程介绍如何配置MNE-Python以适应本地系统和分析首选项。

老样子：

import os

import mne

获取和设置配置变量

使用mne.get_config()和mne.set_config()函数读取和写入配置变量。要读取一个特定的配置变量，将其名称作为关键参数传递给get_config() (key是第一个参数，所以如果你愿意，你可以不命名地传递它)：

print(mne.get_config("MNE_USE_CUDA"))
print(type(mne.get_config("MNE_USE_CUDA")))

false
<class ‘str’>

请注意，从JSON文件读取的字符串值不会以任何方式进行解析，因此get_config()即使对于true/false配置值也会返回字符串，而不是Python布尔值。类似地，set_config()将只设置字符串值：

try:
    mne.set_config("MNE_USE_CUDA", True)
except TypeError as err:
    print(err)

value must be an instance of str, path-like, or NoneType, got <class ‘bool’> instead.

如果我们不确定是否设置了配置变量，有一种方便的方法可以检查它，并在它不存在的情况下fallback：get_config()的一个default参数。

print(mne.get_config("missing_config_key", default="fallback value"))

fallback value

get_config()还有两种方便的使用模式。第一个将返回一个字典，其中包含在系统上设置的所有配置变量及其值，这是通过传递key=None（默认值，所以以下代码省略了）来完成的：

print(mne.get_config())  # same as mne.get_config(key=None)

{‘MNE_BROWSE_RAW_SIZE’: ‘8.0,8.0’, ‘MNE_DATASETS_BRAINSTORM_PATH’: ‘/home/circleci/mne_data’, ‘MNE_DATASETS_EEGBCI_PATH’: ‘/home/circleci/mne_data’, ‘MNE_DATASETS_EPILEPSY_ECOG_PATH’: ‘/home/circleci/mne_data’, ‘MNE_DATASETS_ERP_CORE_PATH’: ‘/home/circleci/mne_data’, ‘MNE_DATASETS_EYELINK_PATH’: ‘/home/circleci/mne_data’, ‘MNE_DATASETS_FIELDTRIP_CMC_PATH’: ‘/home/circleci/mne_data’, ‘MNE_DATASETS_FNIRS_MOTOR_PATH’: ‘/home/circleci/mne_data’, ‘MNE_DATASETS_HF_SEF_PATH’: ‘/home/circleci/mne_data’, ‘MNE_DATASETS_KILOWORD_PATH’: ‘/home/circleci/mne_data’, ‘MNE_DATASETS_LIMO_PATH’: ‘/home/circleci/mne_data’, ‘MNE_DATASETS_MISC_PATH’: ‘/home/circleci/mne_data’, ‘MNE_DATASETS_MTRF_PATH’: ‘/home/circleci/mne_data’, ‘MNE_DATASETS_MULTIMODAL_PATH’: ‘/home/circleci/mne_data’, ‘MNE_DATASETS_OPM_PATH’: ‘/home/circleci/mne_data’, ‘MNE_DATASETS_PHANTOM_4DBTI_PATH’: ‘/home/circleci/mne_data’, ‘MNE_DATASETS_PHANTOM_KERNEL_PATH’: ‘/home/circleci/mne_data’, ‘MNE_DATASETS_PHANTOM_KIT_PATH’: ‘/home/circleci/mne_data’, ‘MNE_DATASETS_REFMEG_NOISE_PATH’: ‘/home/circleci/mne_data’, ‘MNE_DATASETS_SAMPLE_PATH’: ‘/home/circleci/mne_data’, ‘MNE_DATASETS_SOMATO_PATH’: ‘/home/circleci/mne_data’, ‘MNE_DATASETS_SPM_FACE_PATH’: ‘/home/circleci/mne_data’, ‘MNE_DATASETS_SSVEP_PATH’: ‘/home/circleci/mne_data’, ‘MNE_DATASETS_TESTING_PATH’: ‘/home/circleci/mne_data’, ‘MNE_DATASETS_UCL_OPM_AUDITORY_PATH’: ‘/home/circleci/mne_data’, ‘MNE_LOGGING_LEVEL’: ‘info’, ‘MNE_USE_CUDA’: ‘false’, ‘SUBJECTS_DIR’: ‘/home/circleci/mne_data/MNE-fsaverage-data’, ‘MNE_3