R语言与作物模型（以DSSAT模型为例）融合应用

随着基于过程的作物生长模型（Process-based Crop Growth Simulation Model）的发展，R语言在作物生长模型和数据分析、挖掘和可视化中发挥着越来越重要的作用。想要成为一名优秀的作物模型使用者与科研团队不可或缺的人才，除了掌握对作物模型相关知识之外，还要掌握模型的快速模拟和高效数据分析能力。Decision Support Systems for Agrotechnology Transfer (简称DSSAT)模型是世界知名的作物生长模拟模型之一。现有版本V4.7能模拟27种主要农作物的生长发育和产量形成过程，被广泛应用于精细农业、水肥管理、气候变化、粮食安全、土碳循环、环境影响、农业可持续性、农业生态等诸多与农业生产和科研有关的领域。R语言在DSSAT模型的气候、土壤、管理措施等数据准备，自动化模拟和结果分析上都发挥着重要的作用。因此，为辅助提高作物模型工作者的使用DSSAT模型的技术，我们举办了本次R语言与作物模型高级应用实战技术培训班，让大家不需要使用界面操作就可以快速批量运行DSSAT模型，方便各个领域可以更好地交叉融合、扩展应用。本次培训我们精选大量作物模型应用案例，九大专题（独孤九剑），全程干货，让参训学员熟悉R语言编程技术和DSSAT这一综合型农业生态系统模型，提高学员模型应用能力、数据分析和图表制作技能。如果你是资深模型爱好者，这次培训可以进一步了解各个模块的相关算法；如果你是个模型入门者，这次培训将让你体验一键模拟的乐趣。

专题一 DSSAT模型的高级应用
1.作物模型的概念
2.DSSAT模型发展现状
3.DSSAT与R语言的安装与介绍
4.DSSAT模型的高级应用案例
5.R语言在作物模型参数优化中的应用
6.R语言在作物模型全球栅格模拟中的应用
7.R语言在作物模型结果分析和数据可视化中的应用

专题二 R语言与数据科学
1.R语言与数据科学
1)R语言发展脉络
2)R语言数据操作技巧
3)R语言在作物模型中的应用
2.R语言编程技巧数据操作
1)R与工作目录
2)R的数据类型及结构
3)R中各数据类型的赋值与操作
4)各种数据格式的读写及操作

专题三 DSSAT模型高级应用技巧
1.DSSAT模型操作
1)DSSAT的安装
2)DSSAT模型操作界面讲解
2.DSSAT模型源码操作与编译
1)DSSAT模型源码安装
2)DSSAT源码的介绍与修改
3)DSSAT源码的编译

专题四 R语言准备DSSAT气象文件
1.DSSAT自带的气象数据的准备
2.R语言操作和准备气象文件
1)DSSAT气象文件的介绍
2)日照转辐射算法的编写
3)DSSAT气象文件的编写

专题五 R语言准备DSSAT土壤文件
1.DSSAT模型的土壤模块及土壤输入参数
2.DSSAT模型土壤水分-氮素-有机碳模块的主要算法
3.DSSAT模型土壤参数在数据缺失情况下的近似估算
4.使用R语言操作和准备土壤输入文件
5.DSSAT模型全球土壤数据库的使用

专题六 R语言准备DSSAT管理文件
1.DSSAT模型的农田管理措施（播期、密度、施肥、灌溉、有机肥、秸秆还田等）的介绍
2.使用R语言进行管理文件批量准备（只需要填写excel，就能批量模拟）

专题七 R语言准备DSSAT参数文件及批量模拟文件
1.DSSAT模型的主要遗传参数，包括物种参数、生态型参数、品种参数
2.主要的参数优化方法
3.使用R语言进行参数文件准备
4.使用R语言对批量模拟文件的编写

专题八 R语言对模拟结果进行数据清洗和整理
1.使用R语言读取DSSAT文件的模拟结果
2.对模拟结果进行数据清洗、分类和整理

专题九 R语言对模拟结果进行数据分析及绘图
1.使用R语言对模拟结果进行分析
2.使用R语言计算模拟结果的MSE、RMSE、MAE、d-value、EF值
3.使用R语言对模拟结果进行可视化（模拟结果的动态图和1：1图等）