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背景
RNA-seq分析一般逻辑
1.上下调
2.趋势分析
对分类基因开展功能、调控分析
局限性
大样本情况，无法进行有效分类
依赖数据的功能分析无法推测新的调控关系
基因表达和调控方式
1、组成型表达（constitutive gene expression）
细胞中持续进行的基因表达，且较少受环境因素的影响。这类基因通常被称为持家基因（housekeeping gene）。
2、基因间相互诱导和阻遏表达
即一个基因诱导（例如转录因子）或阻遏（例如 miRNA）另外一个基因的转录翻译。
3、协调表达
在一定机制控制下，功能相关的一组基因，协调一致，共同表达。
与网络相关的基础概念
网络图的两大元素：
• 点：图中每一个圆圈代表一个节点，如基因。
• 边：在基因调控网络中，基因相互间的调控关系构成了边。
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