1. 前言
ORFscore是评估开放阅读框(ORF)翻译活性的重要指标,通过分析Ribo-seq数据中核糖体足迹的分布特征来计算。本文将详细介绍ORFscore的计算方法、分析流程和结果解读。
2. ORFscore原理
Ribo-seq数据分析:ORFscore计算与解读
1. 前言
ORFscore是评估开放阅读框(ORF)翻译活性的重要指标,通过分析Ribo-seq数据中核糖体足迹的分布特征来计算。本文将详细介绍ORFscore的计算方法、分析流程和结果解读。
2. ORFscore原理
ORFscore基于以下假设:
- 活跃翻译的ORF会表现出明显的三碱基周期性
- 核糖体足迹在起始密码子和终止密码子附近有特征性分布
- 背景噪声和随机分布会降低ORFscore值
2.1 计算公式
Ribo-seq数据分析:ORFscore计算与解读
1. 前言
ORFscore是评估开放阅读框(ORF)翻译活性的重要指标,通过分析Ribo-seq数据中核糖体足迹的分布特征来计算。本文将详细介绍O