Conda的使用

1、查看当前已有的虚拟环境信息
  PowerShell/Ubuntu22：

conda env list

这条指令会显示当前存在的虚拟环境的名称和根目录，刚安装Conda则只会显示一个base环境。当前所在的环境会被标记一个*。

2、创建和删除虚拟环境

PowerShell/Ubuntu22：

# 创建环境conda create --name ⌈环境名⌋
# 删除环境conda remove -n ⌈环境名⌋ --all

创建的虚拟环境的根目录默认位于Miniconda根目录的envs目录下。

3、进入和退出虚拟环境

PowerShell/Ubuntu22：​​​​​​​

# 进入base环境conda activate
# 进入其他环境conda activate ⌈环境名⌋
# 退出conda deactivate

4、查询虚拟环境下已安装的软件包的信息

先进入虚拟环境。然后使用以下指令查询。

PowerShell/Ubuntu22：​​​​​​​

# 查询所有conda list
# 查询单个conda list ⌈软件包名⌋

如果是新创建的环境，一开始其下是没有安装任何软件包的。需要使用conda install安装。
  5、搜寻软件包信息
  PowerShell/Ubuntu22：​​​​​​​

# 精确查找conda search --full-name ⌈软件包名⌋=⌈版本号⌋
# 模糊查找conda search ⌈软件包名关键字⌋

通过以上命令可查询出软件包的新旧版本和来源频道。如果已有的频道中没有要找的软件包，可以额外添加频道再查询。

6、添加频道

conda的频道（channels）是存储软件包的服务器网络地址，可通过以下指令添加。

PowerShell/Ubuntu22：

conda config --add channels ⌈频道⌋

conda常用频道的国内镜像如下：​​​​​​​

# 清华大学源main：https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/main/‌Bioconda‌：https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/conda-forge：https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/free：https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/pytorch：https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/pytorch/
# 北京外国语大学源main：https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/main/‌Bioconda‌：https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/
# 中国科学技术大学源‌main：https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
...

其中，Bioconda上有很多的生信分析软件。有需求的用户可以添加这个频道。另外，可在.condarc文件（一般位于用户目录下）中修改已添加的频道。

7、在虚拟环境下安装软件包

先进入虚拟环境。然后使用以下指令安装。

PowerShell/Ubuntu22：​​​​​​​

# 安装单个软件包conda install ⌈软件包名⌋=⌈版本号⌋
# 安装多个软件包conda install ⌈软件包名1⌋=⌈版本号1⌋ ⌈软件包名2⌋=⌈版本号2⌋ ...

省略版本号则默认下载最新版本。另外也可以在创建虚拟环境时同时安装一些软件包。

conda create -n ⌈环境名⌋ ⌈包名1=版本号⌋ ⌈包名2=版本号⌋ ...

8、删除软件包

进入虚拟环境后执行以下指令。
  PowerShell/Ubuntu22：

conda remove ⌈软件包名⌋

也可以不进入虚拟环境删除软件包，指令如下。
  PowerShell/Ubuntu22：

conda remove --name ⌈环境名⌋ ⌈软件包名⌋

9、更新软件包

进入虚拟环境后执行以下指令。
  PowerShell/Ubuntu22：​​​​​​​

# 更新所有conda update --all
# 更新单个conda update ⌈软件包名⌋