matlab分时代码-Kinship-Privacy:从https://github.com/tastanlab/Kinship...

matlab分时代码一种保护基因组数据库中Kinhsip的实用程序最大化和隐私保护方法 假设家庭成员以顺序的时间顺序到达数据库，那么家庭f希望隐藏他们的家庭关系，同时共享他们的基因组数据。 我们通过最大限度地减少我们已经确定的隐私风险来实现这一目标。 有两种类型的隐私风险可能会透露亲属信息： 成为群体中的离群值 亲属系数> 0 hide_snps.r代码通过生成亲属关系和异常值约束将问题转换为优化模型。 但是，通常没有一种解决方案可以同时满足两种类型的隐私风险（约束）。 因此，我们在满足一种约束条件并放宽另一种约束条件的同时，开发了一种解决方案。 为了获得要在公共数据库中共享的最大数据量，我们将目标函数定义为要隐藏的SNP的最小数量。 如果放宽了异常约束，则hide_snps.r代码可解决优化模型。 不幸的是，如果放宽了亲属关系约束，则这些约束变为非线性，并且Rcplex无法解决非线性约束整数编程问题，当解决方案基于松弛亲属约束时，hide_snps.r仅生成约束并将其写入txt文件。 然后，使用optimum_phi.m Matlab代码查找满足给定非线性约束的最小phi值。 将最佳