(V1.12) GI9703X, GI10202Z (V1.0) CFX96 Manual (CE) ES
(V1.12) GI9703X, GI10202Z (V1.0) CFX96 Manual (CE) ES
AllplexTM
GI-Parasite Assay
(N.º de Cat. GI9703X, GI10202Z)
Sistema PCR multiplex en tiempo real para la detección de Giardia lamblia (GL),
Entamoeba histolytica (EH), Cryptosporidium spp. (CR), Blastocystis hominis (BH),
Dientamoeba fragilis (DF) y Cyclospora cayetanensis (CC) en muestras de heces
humanas.
GI9703X GI10202Z
Seegene Inc.,
ÍNDICE
AVISOS -------------------------------------------------------------------------------------------- 3
ANTECEDENTES --------------------------------------------------------------------------------- 6
REACTIVOS ---------------------------------------------------------------------------------------- 8
PROTOCOLO -------------------------------------------------------------------------------------- 11
RESULTADOS ------------------------------------------------------------------------------------- 39
RENDIMIENTO -------------------------------------------------------------------------------------- 44
REFERENCIAS ------------------------------------------------------------------------------------ 52
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AllplexTM GI-Parasite Assay
AVISOS
3 05/2022 V1.12_(ES)
AllplexTM GI-Parasite Assay
⚫ Prepare y utilice un juego de pipetas diferente para cada una de las siguientes áreas:
extracción de ácido nucleico, mezcla de reactivos, adición de plantilla de ácido nucleico y
la manipulación de productos de la PCR.
⚫ Abra los tubos o tiras de reacción de la PCR después de la amplificación solo en los
espacios designados, para evitar la contaminación del área con amplicones.
⚫ Almacenar materiales positivos separados de los reactivos del kit.
⚫ Se deben seguir los procedimientos de seguridad de laboratorio al manipular los
especímenes (consulte Bioseguridad en Laboratorios de Microbiología y Biomedicina y los
documentos del CLSI). Limpiar y desinfectar completamente todas las superficies de
trabajo con hipoclorito de sodio al 0,5% (en agua desionizada o destilada). Los
componentes del producto (residuos del producto, embalaje) pueden considerarse como
residuos de laboratorio. Desechar los reactivos y desechos no utilizados según las
regulaciones federales, estatales y locales aplicables.
⚫ Seegene NIMBUS y Seegene STARlet son los mismos equipos que Microlab NIMBUS
IVD y Microlab STARlet IVD, aunque el fabricante sea diferente. Ya que no hay cambios
físicos en el dispositivo, los resultados de la prueba son iguales.
⚫ El nombre de la marca “CFX96™ Real-time PCR Detection System-IVD” se cambió por
“CFX96™ Dx system”. No ha habido cambios físicos en los sistemas, por lo que se debe
esperar obtener los mismos resultados en ambos.
⚫ “CFX Manager™ Dx Software v3.1” es una versión de actualización del “CFX Manager™
Software-IVD v1.6”. El software actualizado incluye mejoras en el menú “Run (Ciclo)”.
Estas mejoras no afectan los resultados del análisis de datos, por lo que los resultados
serán los mismos.
⚫ Este kit está destinado a ayudar en el diagnóstico diferencial de las infecciones patógenas
diana;
Giardia lamblia (GL), Entamoeba histolytica (EH), Cryptosporidium spp. (CR), Blastocystis
hominis (BH), Dientamoeba fragilis (DF) y Cyclospora cayetanensis (CC)
⚫ AIOS combina Seegene STARlet, vendido por Seegene, con el equipo Real-Time PCR
(CFX96 Dx; fabricante: Bio-Rad) y sellador de placas (fabricante: SAMICK THK) para
formar una estructura de conexión automatizada de extracción de ácido nucleico para la
PCR.
USO PREVISTO
El AllplexTM GI-Parasite Assay es una prueba cualitativa in vitro para la detección simple o
múltiple de Giardia lamblia (GL), Entamoeba histolytica (EH), Cryptosporidium spp. (CR),
Blastocystis hominis (BH), Dientamoeba fragilis (DF) y Cyclospora cayetanensis (CC) en
muestras de heces humanas de personas con síntomas de gastroenteritis o diarrea infecciosa.
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AllplexTM GI-Parasite Assay
1. Principios
Muestras
(Heces humanas)
DNA
Análisis de Resultados
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AllplexTM GI-Parasite Assay
ANTECEDENTES
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AllplexTM GI-Parasite Assay
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AllplexTM GI-Parasite Assay
REACTIVOS
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AllplexTM GI-Parasite Assay
REACTIVOS
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AllplexTM GI-Parasite Assay
ALMACENAMIENTO Y MANIPULACIÓ N
Todos los componentes del AllplexTM GI-Parasite Assay deben almacenarse a ≤ -20°C.
Todos los componentes son estables en las condiciones de almacenamiento recomendadas
hasta la fecha de caducidad indicada en la etiqueta. El rendimiento no se ve afectado por hasta
5 ciclos de congelación y descongelación. Si se van a utilizar los reactivos solo de forma
intermitente, deben almacenarse en partes alícuotas.
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AllplexTM GI-Parasite Assay
PROTOCOLO
Nota: Todas las muestras se deben tratar como material potencialmente infeccioso. Solo se
permiten ese material de la muestra recogido, almacenado y transportado de acuerdo con las
siguientes normas e instrucciones de forma rigurosa.
Heces humanas
(Heces frescas y conservadas en medios de transporte)
Nota: Para garantizar una alta calidad de la muestra, las muestras deben transportarse lo más
rápido posible. Las muestras deben transportarse a las temperaturas indicadas.
A. Recogida de muestras
⚫ Recoja muestras de heces tan pronto como sea posible tras la aparición de los síntomas.
Heces frescas
⚫ Sitúe la muestra de heces en un recipiente a prueba de fugas, sin conservantes ni otros
medios.
* Vuelva a sellar con un tapón de repuesto (N.º de cat. 2E003S500, COPAN) después del uso
para almacenarlo.
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AllplexTM GI-Parasite Assay
Almacenamiento y
Muestras transporte Nota
Temp. Duració n*
- El rendimiento puede verse afectado por la
2~8°C 2 días congelación y descongelación y el
almacenamiento prolongado de las muestras.
Heces
- Las muestras también deben adherirse a las
-20°C 1 mes instrucciones locales y nacionales para el
transporte de material patógeno.
* Duració n: El período de tiempo desde la recogida de la muestra hasta la prueba, incluido el
almacenamiento y el transporte de la muestra antes de la prueba.
Varios fabricantes ofrecen kits de extracción de ácido nucleico. Utilice el protocolo correcto de
acuerdo con el protocolo del fabricante. Los kits de extracción siguientes han sido validados
para su uso con este kit.
A. Pretratamiento de la muestra
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AllplexTM GI-Parasite Assay
B. Control Interno
Nota: Control Interno (IC) se incluye en el kit para permitir a los usuarios confirmar no solo el
procedimiento de extracción de ácido nucleico, sino también para identificar cualquier inhibición
de la PCR.
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AllplexTM GI-Parasite Assay
Nota: Utilice los volúmenes recomendados de muestras y eluciones tal y como se indica a
continuación. Para el resto, consulte el manual del fabricante.
173000-
Microlab STARlet IVD Hamilton -
075*
744300.4. Muestra: 800 μL
STARMag 96 X 4 Universal Cartridge Kit Seegene
UC384 Elución: 100 μL
Muestra: 800 μL
STARMag 96 X 4 Viral DNA/RNA 200 C kit Seegene EX00013C
Elución: 100 μL
*Si desea adquirir este producto de Seegene INC., utilice este número de catálogo.
14 05/2022 V1.12_(ES)
AllplexTM GI-Parasite Assay
Nota: Volver a colocar la tapa del control positivo (PC) con una pierceable cap. Tras finalizar la
operación, volver a colocar la tapa del control positivo (PC) con la tapa original.
Nota: La pierceable cap es un producto de un solo uso y se debe desechar tras un uso.
Nota: Si este producto se usa con AIOS se utilizará en 3 ejecuciones diferentes como máximo.
15 05/2022 V1.12_(ES)
AllplexTM GI-Parasite Assay
Taiwan
Maelstrom™ 9600 Advanced M9600 -
Nanotech Inc.
EX00029P, Muestra: 200 L
STARMag™ M96 Kit Seegene
EX00030P Elución: 100 L
C-7. SEEPREP32
Muestra: 200 μL
STARMag 96 ProPrep (Tube Type) Seegene EX00009T Elución: 100 μL
Muestra: 200 μL
STARMag 96 ProPrep C (Plate Type) Seegene EX00017P
Elución: 100 μL
Muestra: 200 μL
STARMag 96 ProPrep C (Tube Type) Seegene EX00017T
Elución: 100 μL
16 05/2022 V1.12_(ES)
AllplexTM GI-Parasite Assay
Nota: Use los volúmenes recomendados de muestra y elución indicados a continuación. Para
otros datos, consulte el protocolo del fabricante.
Nota: Se deben usar los tubos y tapas correctos (Consulte la página 10).
Nota: Deben usarse puntas de filtros resistentes a los aerosoles y guantes ajustados para
preparar las reacciones de la PCR. Tenga especial cuidado en evitar la contaminación cruzada.
Nota: Descongele totalmente todos los reactivos en hielo.
Nota: Ponga todas las reacciones en hielo para minimizar el riesgo de degradación del DNA.
Nota: Centrifugue brevemente los tubos de reactivos para retirar las gotas dentro de la tapa.
Nota: Los pasos A~D se procesan automáticamente en Microlab NIMBUS IVD, Microlab
STARlet IVD, Seegene NIMBUS y Seegene STARlet. Consulte cada manual de
operaciones respectivamente.
17 05/2022 V1.12_(ES)
AllplexTM GI-Parasite Assay
20 μL Mastermix PCR
Nota: Se recomienda centrifugar los tubos de la PCR antes de la PCR para eliminar las
burbujas de aire y recoger todos los líquidos residuales en el fondo de los tubos.
Correcto Incorrecto
Nota: Para cada muestra utilice una nueva punta de pipeta estéril.
Nota: Para el Control negativo (NC), use 5 l de RNase-free Water en lugar del ácido
nucleico de la muestra.
Nota: Para el Control Positivo (PC), use 5 μL de GI-P PC en lugar del ácido nucleico de la
muestra.
Nota: Tenga cuidado de que no se produzca una contaminación cruzada de la Mastermix PCR
y las muestras con el Control Positivo.
Nota: No etiquete la tapa de los tubos de reacción ya que se detectará fluorescencia en la
parte superior de la tapa.
18 05/2022 V1.12_(ES)
AllplexTM GI-Parasite Assay
Nota: La configuración del experimento en el CFX96 TM Real-time PCR Detection System (Bio-
Rad) puede dividirse en tres pasos: Protocol Setup (Configuración de protocolo), Plate Setup
(Configuración de la placa) y Start Run (Inicio del ciclo).
19 05/2022 V1.12_(ES)
AllplexTM GI-Parasite Assay
3) Haga clic en el cuadro al lado de Sample Volume (Volumen de la muestra) para añadir
directamente 25 μL.
4) Haga clic en OK (Aceptar) y guarde el protocolo para abrir la ventana Experiment Setup
(Configuració n del experimento).
20 05/2022 V1.12_(ES)
AllplexTM GI-Parasite Assay
2) Haga clic en Select Fluorophores (Seleccionar fluoró foros) para indicar los fluoróforos
(FAM, HEX, Cal Red 610 y Quasar 670) que se van a usar y haga clic en OK (Aceptar).
Fig. 5. Select Fluorophores (Seleccionar fluoró foros) (FAM, HEX, Cal Red 610, y Quasar 670)
21 05/2022 V1.12_(ES)
AllplexTM GI-Parasite Assay
3) Seleccione los pocillos donde se colocará el tubo de PCR y seleccione sus tipos de muestra
en el menú desplegable Sample Type (Tipo de muestra).
- Unknown (Desconocido): Muestras clínicas
- Negative Control (Control negativo)
- Positive Control (Control positivo)
4) Haga clic en las casillas de verificación adecuadas (FAM, HEX, Cal Red 610 y Quasar 670)
para especificar los fluoróforos que se van a detectar en los pocillos seleccionados.
22 05/2022 V1.12_(ES)
AllplexTM GI-Parasite Assay
9) Haga clic en Next (Siguiente) para ejecutar Start Run (Inicio del ciclo).
1) En la pestaña Start Run (Inicio del ciclo) en Experiment Setup (Configuració n del
experimento), haga clic en Close Lid (Cerrar tapa) para cerrar la tapa del instrumento.
23 05/2022 V1.12_(ES)
AllplexTM GI-Parasite Assay
3) Guarde el archivo del ciclo, ya sea en Mis documentos o en una carpeta que designe.
Introduzca el nombre del archivo, haga clic en SAVE (GUARDAR), y se iniciará la ejecución.
1) Cree una carpeta para guardar los datos de todos los pasos de detección de las curvas de
amplificación a partir del archivo de resultados.
2) El nombre de la carpeta puede ser elegido por el usuario (para la función ‘Seegene Export
(Exportación de Seegene)’, se crearán automáticamente las carpetas “QuantStep4” y
“QuantStep5” con el fin de guardar los datos de cada curva de amplificación dentro de la
carpeta creada por el usuario).
1) Después de la prueba haga clic en la pestaña Quantitation (Cuantificación) para confirmar los
resultados de la curva de amplificación.
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AllplexTM GI-Parasite Assay
25 05/2022 V1.12_(ES)
AllplexTM GI-Parasite Assay
4) Seleccione una ubicación para guardar los datos y haga clic en OK (Aceptar).
1) Abra el programa Seegene Viewer y haga clic en Option (Opció n) para seleccionar CFX96
en el Instrument (Instrumento).
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AllplexTM GI-Parasite Assay
2) Haga clic en Open (Abrir) para encontrar el archivo guardado en la carpeta “QuantStep4”,
abra el archivo de resultados y seleccione el kit de prueba en el menú PRODUCT (PRODUCTO).
Nota: Especifique el tipo de tubo cuando seleccione el kit de prueba (8 strip, 96 plate o
96 film).
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AllplexTM GI-Parasite Assay
HEX
Control FAM (Ct) Cal Red 610 (Ct) Quasar670 (Ct) Interpretación
(Ct)
automática
BH GL DF EH CC CR IC
Control negativo N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A Control negativo(-)
28 05/2022 V1.12_(ES)
AllplexTM GI-Parasite Assay
29 05/2022 V1.12_(ES)
AllplexTM GI-Parasite Assay
3) Haga clic en el cuadro al lado de Sample Volume (Volumen de la muestra) para añadir
directamente 25 μL.
4) Haga clic en OK (Aceptar) y guarde el protocolo para abrir la ventana Run Setup
(Configuració n del ciclo) .
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AllplexTM GI-Parasite Assay
1) En la pestaña Plate (Placa) en Run Setup (Configuració n del ciclo), haga clic en Create
New (Crear nuevo) para abrir la ventana Plate Editor (Editor de placas).
2) Haga clic en Select Fluorophores (Seleccionar fluoró foros) para indicar los fluoróforos
(FAM, HEX, Cal Red 610 y Quasar 670) que se van a usar y haga clic en OK (Aceptar).
Fig. 5. Select Fluorophores (Seleccionar fluoró foros) (FAM, HEX, Cal Red 610, y Quasar 670)
31 05/2022 V1.12_(ES)
AllplexTM GI-Parasite Assay
3) Seleccione los pocillos donde se colocará el tubo de PCR y seleccione sus tipos de muestra
en el menú desplegable Sample Type (Tipo de muestra).
- Unknown (Desconocido): Muestras clínicas
- Negative Control (Control negativo)
- Positive Control (Control positivo)
4) Haga clic en las casillas de verificación adecuadas (FAM, HEX, Cal Red 610 y Quasar 670)
para especificar los fluoróforos que se van a detectar en los pocillos seleccionados.
32 05/2022 V1.12_(ES)
AllplexTM GI-Parasite Assay
9) Haga clic en Next (Siguiente) para ejecutar Start Run (Inicio del ciclo).
1) En la pestaña Start Run (Inicio del ciclo) en Run Setup (Configuració n del ciclo), haga
clic en Close Lid (Cerrar tapa) para cerrar la tapa del instrumento.
33 05/2022 V1.12_(ES)
AllplexTM GI-Parasite Assay
3) Guarde el archivo del ciclo, ya sea en Mis documentos o en una carpeta que designe.
Introduzca el nombre del archivo, haga clic en SAVE (GUARDAR), y se iniciará la ejecución.
1) Cree una carpeta para guardar los datos de todos los pasos de detección de las curvas de
amplificación a partir del archivo de resultados.
2) El nombre de la carpeta puede ser elegido por el usuario (para la función ‘Seegene Export
(Exportación de Seegene)’, se crearán automáticamente las carpetas “QuantStep4” y
“QuantStep5” con el fin de guardar los datos de cada curva de amplificación dentro de la
carpeta creada por el usuario).
1) Después de la prueba haga clic en la pestaña Quantitation (Cuantificación) para confirmar los
resultados de la curva de amplificación.
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AllplexTM GI-Parasite Assay
35 05/2022 V1.12_(ES)
AllplexTM GI-Parasite Assay
4) Seleccione una ubicación para guardar los datos y haga clic en OK (Aceptar).
1) Abra el programa Seegene Viewer y haga clic en Option (Opció n) para seleccionar CFX96 Dx
en el Instrument (Instrumento).
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AllplexTM GI-Parasite Assay
2) Haga clic en Open (Abrir) para encontrar el archivo guardado en la carpeta “QuantStep4”,
abra el archivo de resultados y seleccione el kit de prueba en el menú PRODUCT (PRODUCTO).
Nota: Especifique el tipo de tubo cuando seleccione el kit de prueba (8 strip, 96 plate o
96 film).
37 05/2022 V1.12_(ES)
AllplexTM GI-Parasite Assay
HEX
Control FAM (Ct) Cal Red 610 (Ct) Quasar 670 (Ct) Interpretación
(Ct)
automática
BH GL DF EH CC CR IC
Control negativo N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A Control negativo(-)
38 05/2022 V1.12_(ES)
AllplexTM GI-Parasite Assay
RESULTADOS
Analito
Fluoró foro
Gráfico 1 Gráfico 2
Valor Ct Resultado
≤ 43 Detectado (+)
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AllplexTM GI-Parasite Assay
Resultado diana
Resultado
Interpretació n
Gráfico Gráfico IC
1 2
- + +
+ +
No válido**
- Una señal de IC negativa sugiere procesos
inadecuados (es decir, sin adición de IC exógena) o
presencia de inhibidores.
- - - - Repita la prueba desde la extracción del ácido nucleico
utilizando otra parte alícuota de la muestra original.
- Si se muestra el mismo resultado en ácido nucleico
reextraído, diluya la muestra (1/3~1/10) en solución
salina y repita la prueba de la extracción.
* La detección del Control Interno en el canal HEX no es necesaria para obtener un resultado
positivo de los patógenos objetivo. Un alto valor de otro analito puede conducir a una señal de
Control Interno reducida o ausente.
** Si no se observa ninguna de las señales, incluido el Control Interno, consulte SOLUCIÓ N DE
PROBLEMAS.
40 05/2022 V1.12_(ES)
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Muestra 1
Muestra 2
Muestra 3
41 05/2022 V1.12_(ES)
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SOLUCIÓ N DE PROBLEMAS
CAUSAS
OBSERVACIONES SOLUCIÓ N
PROBABLES
Configuración incorrecta
Verifique las condiciones del ciclo térmico y repita
del ciclador térmico en
la prueba con la configuración correcta.
tiempo real
Sin señ al de Control nucleico del patógeno. patógeno diana. Para poder confirmar la señal IC,
42 05/2022 V1.12_(ES)
AllplexTM GI-Parasite Assay
CAUSAS
OBSERVACIONES SOLUCIÓ N
PROBABLES
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AllplexTM GI-Parasite Assay
RENDIMIENTO
1. Especificidad
La alta especificidad del AllplexTM GI-Parasite Assay viene garantizada por los oligos
diseñados específicamente para las dianas de interés en las condiciones de reacción
establecidas. En el AllplexTM GI-Parasite Assay se probó la reactividad cruzada de 205
patógenos diferentes y la detección y amplificación de la PCR solo se identificó en las dianas
especificadas.
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AllplexTM GI-Parasite Assay
45 05/2022 V1.12_(ES)
AllplexTM GI-Parasite Assay
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AllplexTM GI-Parasite Assay
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AllplexTM GI-Parasite Assay
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AllplexTM GI-Parasite Assay
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AllplexTM GI-Parasite Assay
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AllplexTM GI-Parasite Assay
2. Sensibilidad
Para determinar la sensibilidad del AllplexTM GI-Parasite Assay se configuró una dilución en
serie estándar de 105 a 100 copias/reacción de DNA diana clonadas y se analizó con Allplex TM
GI-Parasite Assay. El límite de detección del AllplexTM GI-Parasite Assay fue de 100
copias/reacción.
3. Reproducibilidad
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AllplexTM GI-Parasite Assay
REFERENCIAS
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enteric protozoa in the immunosuppressed human population] Clin. Microbiol. Rev. (2009) 22: 634-650
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diarrheal illness is negatively associated with the growth of preschool children: evidence from a prospective
Blastocystis hominis infection: epidemiologic study] Medicina Clin. (Barc) (1997) 108:608-612
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among Blastocystis isolates from a major hospital in Singapore] Parasitol Res. (2008) 102:663–670
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15. M. F. Stephanie, D. Stark, J. Harkness, and J. Ellis. [Enteric Protozoa in the Developed World: a Public
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52 05/2022 V1.12_(ES)
AllplexTM GI-Parasite Assay
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53 05/2022 V1.12_(ES)
AllplexTM GI-Parasite Assay
Símbolo Explicació n
Código de lote
Número de catálogo
Fecha de caducidad
RNase-free Water
Fabricante
Fecha de fabricación
Precaución
54 05/2022 V1.12_(ES)
AllplexTM GI-Parasite Assay
Símbolo Explicació n
55 05/2022 V1.12_(ES)
AllplexTM GI-Parasite Assay
Serie AllplexTM
GI10186Z AllplexTM GI-Virus plus Assay 25 rxns*
GI10187Y AllplexTM GI-Virus plus Assay 50 rxns
GI10188X AllplexTM GI-Virus plus Assay 100 rxns*
GI10184Z AllplexTM GI-Virus Assay 25 rxns*
GI9701Y AllplexTM GI-Virus Assay 50 rxns
GI9701X AllplexTM GI-Virus Assay 100 rxns*
GI9801Y AllplexTM GI-Bacteria(I) Assay 50 rxns
GI9801X AllplexTM GI-Bacteria(I) Assay 100 rxns*
GI10183Z AllplexTM GI-Bacteria(II) Assay 25 rxns*
GI9702Y AllplexTM GI-Bacteria(II) Assay 50 rxns
GI9702X AllplexTM GI-Bacteria(II) Assay 100 rxns*
TM
GI10202Z Allplex GI-Parasite Assay 25 rxns*
GI9703Y AllplexTM GI-Parasite Assay 50 rxns
GI9703X AllplexTM GI-Parasite Assay 100 rxns*
GI10189Z AllplexTM GI-Helminth(I) Assay 25 rxns
GI10190Y AllplexTM GI-Helminth(I) Assay 50 rxns
GI10191X AllplexTM GI-Helminth(I) Assay 100 rxns
GI10196Z AllplexTM GI-EB Screening Assay 25 rxns
GI10197Y AllplexTM GI-EB Screening Assay 50 rxns
GI10198X AllplexTM GI-EB Screening Assay 100 rxns
GI10359Z AllplexTM stx1/2/2a/2d Typing 25 rxns
GI10358X AllplexTM stx1/2/2a/2d Typing 100 rxns
Serie Seeplex®
DR6411Y Seeplex® Diarrhea-V ACE Detection 50 rxns
DR6501Y Seeplex® Diarrhea-B1 ACE Detection 50 rxns
DR6502Y Seeplex® Diarrhea-B2 ACE Detection 50 rxns
56 05/2022 V1.12_(ES)
AllplexTM GI-Parasite Assay
Producto accesorio
SG1701 Ribo_spin vRD (Viral RNA/DNA Extraction Kit) 50 preps
57 05/2022 V1.12_(ES)