【Graph vs Transformer】Transformer是GNN的一种特例

### Graph Transformer 模型架构 Graph Transformer 结合了图神经网络 (GNN) 和 Transformer 架构的优点，旨在处理复杂的图结构化数据。传统 GNN 主要关注局部邻域聚合操作，而 Graph Transformer 则引入全局注意力机制来捕捉节点之间的远距离依赖关系[^2]。 #### 编码器部分 编码器由多层堆叠而成，每一层都包含两个主要子模块：一个多头自注意力机制（Multi-head Self-Attention Mechanism），用于计算节点间的关系权重；以及一个前馈全连接网络（Feed Forward Neural Network）。这种设计允许模型同时考虑局部特征和全局上下文信息。 ```python class GraphTransformerLayer(nn.Module): def __init__(self, d_model, num_heads, dropout=0.1): super(GraphTransformerLayer, self).__init__() self.self_attn = MultiHeadedAttention(num_heads=num_heads, d_model=d_model) self.feed_forward = PositionwiseFeedForward(d_model=d_model) def forward(self, x, adj_matrix): attn_output = self.self_attn(x, mask=adj_matrix) output = self.feed_forward(attn_output) return output ``` ### 原理分析 Graph Transformer 的核心在于如何有效融合图结构信息与序列建模能力： - **位置编码**：为了保留原始图中的拓扑特性，通常会采用拉普拉斯特征映射或其他形式的位置编码方案替代标准的正弦波位置编码。 - **边属性增强**：除了基本的节点表示外，还可以利用额外的边属性向量作为输入的一部分参与计算，从而更好地刻画复杂交互模式。 - **层次化池化策略**：针对大规模稀疏图场景下的效率优化问题，提出了多种新颖高效的采样/聚集算法，如ClusterGCN、SAGEPooling等技术。 ### 应用领域 目前，Graph Transformer 已经被广泛应用于多个实际应用场景中，特别是在社交网络分析、推荐系统构建等方面表现出色。具体来说： - 社交媒体平台可以通过该类模型更精准地理解用户行为偏好并据此推送个性化内容； - 生物医学研究者能够借助其强大的表征学习功能加速药物发现过程中的分子性质预测工作。 此外，在自然语言处理任务里也有着不俗的表现——比如文档分类、问答匹配等问题都可以视为特殊的“带标签”的图结构来进行求解。