- 博客(5252)
- 资源 (1)
- 收藏
- 关注
RSS订阅转载 MP | 中科院遗传发育所冯健/韩方普组两个苜蓿材料的T2T基因组揭示其着丝粒演化机制
A17基因组为494.47 Mb，R108基因组为415.27 Mb，BUSCO完整性评估均超过99%，全部染色体实现了真正意义上的端粒到端粒连续组装，是目前苜蓿属植物最完整的参考基因组资源。研究组主要从事小麦和玉米的功能基因组研究、小麦染色体工程育种以及植物人工染色体的开发，具体研究方向包括：小麦远缘杂交及抗赤霉病条锈病小麦新品种培育，小麦多倍体基因组解析与功能研究、植物着丝粒的结构与功能、植物减数分裂染色体配对起始与分离机制、人工染色体的构建，以及植物基因的定点突变与定向重组技术。
2025-07-29 15:08:52
13
转载 关于召开首届人工智能与生物技术学术大会暨人工智能与生物技术专业委员会成立大会的通知（第二轮）
大会将围绕人工智能与生物技术领域的最新研究进展和发展趋势进行深入探讨，分别聚焦人工智能赋能蛋白质及药物设计、人工智能赋能组学数字解码、人工智能赋能合成生物学和人工智能赋能医学影像学领域，进一步推动人工智能与生物技术的交叉融合和产业发展。杜朴风、古槿、郭向前、韩俊伟、黄志伟、李国亮、刘晖、刘嵘明、刘治平、宁康、尚学群、苏建忠、苏晓泉、王春宇、王芳、王军、吴浩、谢正伟、熊旭深、严海丹、曾坚阳、张春龙、张帆、张岩、章张、周源。黄志伟、张岩、肖阳、顾悦、郭明慧、朱玉威、杨德辉、张云鹏，宁尚伟，王理，韩俊伟、杨帆。
2025-07-28 18:17:11
58
转载 iMeta大会2025 | 植物方向12位领军人才报告简介(8.23-25, 湖北中医药大学，二轮优惠/团购报名最后2周)
iMeta大会2025 植物方向分会场报告iMeta (宏)期刊是生物医学交叉学科期刊，主编刘双江和傅静远教授，影响因子33.2，全球SCI期刊排名65/22249 (前千分之三)，中国大陆排名 5/585。子刊iMetaOmics(宏组学)的主编赵方庆和于君教授，定位IF>10的生物医学交叉学科综合期刊；子刊iMetaMed(宏医学)的主编是朱依谆和郭洪波教授，定位IF>15的医学综合期刊，欢迎投稿！希望在大家共同努力下，8年内创办10本IF>10的子刊，形成可替代生物医学顶刊Cell系列的中国解决方案。
2025-07-27 07:04:11
48
转载 iMeta2023-2025年最高引论文30篇(25.7更新)
2025年6月影响因子33.2，中科院分区生物学1区Top，位列全球SCI期刊前千分之三(65/22249)，微生物学科2/163，仅低于Nature Reviews，学科研究类期刊全球第一，中国大陆5/585！” 子刊，主编由中国科学院北京生命科学研究院赵方庆研究员和香港中文大学于君教授担任，目标是成为影响因子大于10的高水平综合期刊，欢迎投稿！” 子刊，专注于医学、健康和生物技术领域，目标是成为影响因子大于15的医学综合类期刊，欢迎投稿！iMeta 2023-2025年最高引论文30篇（25.7更新）
2025-07-26 07:56:37
99
转载 iMeta | 宁大一院陈夏组-肠道细菌及代谢物治疗多囊卵巢综合征
点击蓝字 关注我们肠道微生物源性的高原儿茶酸改善多囊卵巢综合征iMetaOmics主页：http://www.imeta.science/imetaomics/研究论文● 期刊: iMeta (IF 33.2, 中科院双一区Top)● 原文链接: https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/imt2.70065● DOI: https://doi.org/10.1002/imt2.70065● 2025年7月15日，宁波大学第一附属医院陈夏、南方医科大学余光创、澳
2025-07-25 07:03:19
245
转载 scMETA教程 | 可视化单细胞宏基因组的在线平台
scMETA 将所有关键的⼯作流程步骤整合在⼀个直观、免编程的界⾯中，可通过标准的⽹络浏览器访问，从⽽使单细胞宏基因组分析简单化，使没有编程能⼒的研究⼈员可以探索复杂群落中微⽣物菌株的多样性和功能异质性。选择计算样本之间的遗传距离的⽅法。除了 FASTQ 格式的原始成对末端测序⽂件外，如果有分组，⽤户还必须上传⼀个名为 “group.txt” 的⽂件，以便为 scMETA 提供必要的分组信息。每个点对应外圈上的刻度，该刻度表示突变位点在基因组上的位置，⽽纵轴上的数值则反映了突变位点的质量。
2025-07-24 08:12:05
71
转载 高级转录组分析和R数据可视化 （2025.9）
易生信团队独创实现了跨平台的分析流程，在大家的Windows笔记本上可以轻松实现转录组统计、可视化的绝大多数分析，课程带你轻松在自己的本本上搭建数据表统计分析与可视化平台，基于目前最主流的Win10进行优化和测试，让笔记本秒变数据分析可视化平台。针对很多老师缺少系统的生信背景，看不懂分析文章图表，更对绘制各式图表手足无措的情况，在培训时，我们将结合发表的高水平文章，进一步讲解16种常用分析图的原理和使用范围，让你不仅读懂图，更知道如何应用于自己的研究，并亲自轻松完成绘图。基础知识，保证你完成项目分析。
2025-07-23 08:16:44
93
转载 iMeta视频教程 | 使用PSOSP分析原噬菌体诱导模式（图文+视频）
原噬菌体普遍存在于细菌基因组中，对宿主的生理和生态功能具有显著影响。本研究开发了一种新型生物信息学工具——原噬菌体SOS依赖性预测器（Prophage SOS-dependency predictor, PSOSP），可基于LexA蛋白与靶DNA结合的异源指数（heterology insex, HI）精准预测原噬菌体的诱导模式，并将其分类为SOS依赖型原噬菌体（SOS-dependent prophage, SdP）和SOS非依赖型原噬菌体（SOS-independent prophage, SiP）。
2025-07-23 08:16:44
59
转载 Cell Host & Microbe丨一种经过基因工程改造的肠道细菌可以保护怀孕小鼠免受饮食中甲基汞的毒性影响
目前，治疗MeHg毒性的方法主要依赖于硫醇基螯合剂。与标准饮食对照组相比，母体食用富含MeHg的饮食会导致胎儿脑中产生1593个基因的差异表达，而食用中等MeHg的饮食则会导致724个基因的差异表达。同时根据富集分析发现，MeHg饮食对于无义介导降解，翻译启动，核糖体蛋白以及RNA途径都有一定的影响，这可能反映了在蛋白质翻译过程中，小鼠体内对于MeHg诱导缺陷的补偿反应（图。的定殖降低了小鼠肝脏组织中的MeHg含量，但没有降低粪便或结肠中MeHg的含量（图S4B和S4D），证明在存在肠道微生物群的情况下，
2025-07-22 09:39:31
138
原创 EasyNanoMeta | 纳米孔宏基因组3物种注释方法
综上，评估结果表明，Centrifuge 更适用于纳米孔测序数据的物种分类分析。三代纳米孔宏基因组物种注释，是指利用第三代测序技术中的纳米孔（Nanopore）平台，对环境或生物样本中的全部微生物DNA进行测序，并对获得的长序列数据进行物种鉴定和分类注释的过程。基于k-mer方法，将每一条序列分成多个k-mers，每个k-mer在分类数据库中寻找LCA，序列所有k-mers所在的分类及其祖先组成一个分类树，这个分类树每个节点的权重是序列k-mers分配到该分类的次数。
2025-07-22 09:39:31
918
转载 iMetaOmics | 中科院动物所赵勇组-解析猪肠道菌群人源化影响-肠道菌群移植
点击蓝字 关注我们肠道菌群人源化驱动猪体内代谢和免疫转录组发生人源化转变iMetaOmics主页：http://www.imeta.science/imetaomics/研究论文● 原文链接: https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/imo2.70034● DOI: https://doi.org/10.1002/imo2.70034● 2025年6月24日，中国科学院动物研究所赵勇、赵方庆、海棠等在iMetaOmics在线发表了题为“Microbiota h
2025-07-22 09:39:31
123
转载 npj Biofilms and Microbiomes | 马铃薯块茎表皮土壤细菌群落对疮痂病发病程度的影响超越病原菌丰度
为探究生态友好型农业管理措施，该团队2025年发表在Journal of Environmental Management期刊的文章揭示了，银杏落叶及其提取物均显著降低马铃薯疮痂病的病情指数，经银杏提取物重构的微生物群落可显著下调病原菌毒素基因txtAB的表达超90%。以第一作者和通讯作者身份在iMeta、Trends in Plant Science、ISME Journal、Microbiome等期刊发表SCI论文50余篇，引用3100余次，高被引论文2篇，H指数27。第一作者：史文宠，吕明皓。
2025-07-21 07:03:54
100
转载 iMetaOmics | 2025年6月数据分析报告：全文下载量超7万
2025年6月影响因子33.2，中科院分区生物学1区Top，位列全球SCI期刊前千分之三(65/22249)，微生物学科2/163，仅低于Nature Reviews，学科研究类期刊全球第一，中国大陆5/585！iMetaOmics发行以来，143个国家或地区共下载了相关文章，其中中国（包括香港、台湾和澳门）下载量达36,659次，位居第一；与Medicine学科恒定的下载量相比，iMetaOmics期刊从2024年12月开始连续6个月单月下载量均突破5,000次，次，2025年下载量达48,077次。
2025-07-21 07:03:54
56
转载 iMeta | 2025年6月数据分析报告：全文下载量超128万
2025年6月影响因子33.2，中科院分区生物学1区Top，位列全球SCI期刊前千分之三(65/22249)，微生物学科2/163，仅低于Nature Reviews，学科研究类期刊全球第一，中国大陆5/585！iMeta期刊发行至今，共发表文章393篇，其中2025年发表114篇，较去年同期上升86.89%。” 子刊，专注于医学、健康和生物技术领域，目标是成为影响因子大于15的医学综合类期刊，欢迎投稿！截至2025年6月底，从提交到在线出版的中位数为83，较去年同期下降69.39%。
2025-07-20 11:22:23
94
原创 MicrobiomeStatPlots | 蒙特尔检验相关性热图教程Mantel correlation heatmap
此外，在LF和HF中，SOM与土壤总养分和有效养分（HF中的AP和TK除外）之间存在显著的正相关（p<0.05）（图第3a和c段）。Mantel检验分析表明，土壤性质（C/N除外）与小麦生长指标（HF中的TK和AK除外）以及LF和HF中的产量及其成分显著正相关（p<0.05，Mantel’r≥0.25，图第3a和C段）。随机森林模型进一步确定，LF中的SOM、AN、AP和AK（p<0.05，图3b），HF中的SOM、TN、AN、美联社、AK和pH是影响产量的关键土壤因素（p<0.05，图图3d）。
2025-07-19 09:41:00
1074
转载 iMetaOmics | 广中医苏祓忧组-阿尔茨海默病失智行为精神症状中的微生物变化
点击蓝字 关注我们电针重塑了与阿尔茨海默病失智行为精神症状相关的微生物共现网络iMetaOmics主页：http://www.imeta.science/imetaomics/研究论文● 期刊: iMetaOmics● 原文链接: https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/imo2.70035● DOI: https://doi.org/10.1002/imo2.70035● 2025年7月2日，中国广州中医药大学苏祓忧等在iMetaOmics在线发表了题为“E
2025-07-18 08:49:28
202
原创 Science子刊 | 山东大学张正组-人类活动和气候变化加剧病原菌在全球生态系统中扩散
结果显示，在任何一种情境下病原菌的丰富度均会升高，但是随着人类发展可持续性的下降，病原菌丰富度上升的程度不断增加，对应SSP126、SSP245、SSP370和SSP585四种情景，病原菌丰富度分别上升了11.7%、16.8%、21.5%以及26.6%（图4B, C）。本研究的结果强调了气候因素对于人类病原菌丰富度的影响，同时也表明人为因素也是影响病原菌丰富度分布特征的主要因子，这可能是因为人类活动促进了病原菌在不同区域间的交流，进而增加了病原菌丰富度。（D-G）人类病原菌丰富度与社会经济因素之间的关系。
2025-07-17 09:31:23
715
转载 刘永鑫丨微生物组学方法开发功能挖掘和科学传播(7.18|山大)
2022年2月正式创刊！2025年6月影响因子33.2，中科院分区生物学1区Top，位列全球SCI期刊前千分之三(65/22249)，微生物学科2/163，仅低于Nature Reviews，学科研究类期刊全球第一，中国大陆5/585！” 子刊，主编由中国科学院北京生命科学研究院赵方庆研究员和香港中文大学于君教授担任，目标是成为影响因子大于10的高水平综合期刊，欢迎投稿！” 子刊，专注于医学、健康和生物技术领域，目标是成为影响因子大于15的医学综合类期刊，欢迎投稿！iMetaOmics封面。
2025-07-17 09:31:23
191
转载 重磅！国自然2024年度报告出炉！立项5.49万项，杰青延续资助41项，9项执行较差
2024年共接收2502个依托单位的40.39万项申请，资助各类科学基金项目5.49万项，资助经费335.81亿元。国内奖励培训发起者，国家院所、双一流高校奖励外培合作单位，以国家级奖励经典案例全流程指导省部级奖励策划、申报与答辩。本文来源国家基金委，文章转摘只为学术传播，如有侵权请联系（微信：nongfu3211），我们及时修改或删除。近日，《国家自然科学基金委员会2024年度报告》电子版在基金委网站上公布，报告披露，首次开展国家杰出青年科学基金项目结题分类评审及延续资助，，专注于科技奖励与人才荣誉，
2025-07-17 09:31:23
157
转载 投稿开放！生物污染物方向Biocontaminant期刊网站上线
多学科国际学术期刊，致力于推进生物污染物在不同环境和系统中的基础研究以及控制技术。期刊旨在为全球研究人员提供创新、高效和专业的论坛，以传播这一快速发展领域的研究成果。病原性生物污染物与全球系统的交互作用预测建模，及其对人类、生态和地球健康的影响。面对全球三重危机（气候变化、生物多样性丧失、环境污染）的生物污染物问题。空气、水、土壤、农作物和动物中微生物污染物的识别与特性分析。生物污染物对人类、动物、植物和水生生物的健康影响。生物污染物削减策略（物理、化学、生物方法）。
2025-07-16 12:33:49
109
转载 iMeta | 黄耀伟/朱书组-解析脆弱拟杆菌通过胆盐水解酶调控石胆酸代谢拮抗猪丁型冠状病毒感染的机制
点击蓝字 关注我们肠道菌群-胆汁酸轴通过靶向细胞受体氨肽酶N抑制一种新发冠状病毒的感染iMeta主页：http://www.imeta.science研究论文● 期刊: iMeta (IF 33.2,中科院双一区Top)● 原文链接: https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/imt2.70061● DOI: https://doi.org/10.1002/imt2.70061● 2025年7月3日，华南农业大学黄耀伟团队和浙江大学朱书团队等在iMeta在线发表
2025-07-16 12:33:49
181
转载 【人物】陈华癸院士：培养6位院士，我国农业微生物学奠基人之一
他的生活十分简朴，平日里就在食堂搭食，胃病发了，就吃块饼干。博士研究期间，陈先生勤耕苦读，他首次发现了豆科植物根毛的伸长和弯曲与根瘤菌分泌的激素有关，并揭示了无效和有效根瘤菌菌株决定共生固氮的效力，详细描述了无效根瘤和有效根瘤的结构，阐明了根瘤结构与功能的关系，引起了共生固氮领域专家的高度重视，。1979年，范业宽以笔试第一名的成绩成为华中农学院土壤农化专业第一个、也是陈华癸先生当年唯一的一个硕士研究生，他不知道的是，在录取名单公布之前，私下找陈先生说情的人接踵不断，陈先生丝毫未受影响，坚持录取了范业宽。
2025-07-15 11:55:16
165
原创 MicrobiomeStatPlots | 分层关联分析Halla analysis
HAllA（Hierarchical All-against-All association）是一种在高维、异构数据集中寻找多分辨率关联的计算方法。对数据类型具有很强的鲁棒性，可以对连续值和分类值进行操作，并且在同质数据集（所有测量值都属于同一类型，例如基因表达微阵列）和异构数据（包含具有不同单位或类型的测量值，例如患者临床数据）上都能很好地工作。热图显示了细菌或真菌物种与不同代谢途径之间的斯皮尔曼相关性，这些代谢途径是通过使用默认参数的 HAlla 确定的。物种与功能之间的关联。分层关联分析R语言实战。
2025-07-15 11:55:16
722
转载 iMeta | 湘雅医院泌尿外科团队-揭示基于新辅助免疫治疗的肌层浸润性膀胱癌的保膀胱疗法
点击蓝字 关注我们新辅助免疫治疗驱动的肌层浸润性膀胱癌的保膀胱疗法iMeta主页：http://www.imeta.science研究论文● 期刊: iMeta (IF 33.2, 中科院双一区Top)● 原文链接: https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/imt2.70063● DOI: https://doi.org/10.1002/imt2.70063● 2025年6月30日，中南大学湘雅医院泌尿外科膀胱癌诊疗团队联合多家大型医学中心在iMeta在线发表
2025-07-14 08:06:43
481
转载 iMetaOmics | 浙江省农科院卢立志组-解析藏鸡高海拔适应性机制
点击蓝字 关注我们“肠-体”轴多组学分析揭示藏鸡高海拔适应性iMeta主页：http://www.imeta.science研究论文● 期刊: iMetaOmics● 原文链接: https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/imo2.70038● DOI: https://doi.org/10.1002/imo2.70038● 2025年6月29日，浙江省农业科学院卢立志、曾涛和江苏省家禽科学研究所韩威等在iMetaOmics在线发表了题为“Multi-omics
2025-07-13 22:41:06
191
转载 报告|施春林-iMeta期刊及文章发表(四川农大,7.1510:00)
目标是发表前10%(IF > 20)的高影响力论文。2025年6月影响因子33.2，中科院分区生物学1区Top，位列全球SCI期刊前千分之三(65/22249)，微生物学科2/163，仅低于Nature Reviews，学科研究类期刊全球第一，中国大陆5/585！” 子刊，主编由中国科学院北京生命科学研究院赵方庆研究员和香港中文大学于君教授担任，目标是成为影响因子大于10的高水平综合期刊，欢迎投稿！” 子刊，专注于医学、健康和生物技术领域，目标是成为影响因子大于15的医学综合类期刊，欢迎投稿！
2025-07-13 22:41:06
255
转载 iMeta | 被引超10000次，发文317篇，平均引用31.59，百引耗时4天(2025/7/13)
根据 Dimensions 网站统计，截止2025年7月13日，iMeta 己发表论文317篇，被引10000，平均引用31.59，百引耗时4天。引超4200次，百引耗时14天；● iMeta | 被引超1400次，发文122篇，平均引用11.55，百引耗时18天(2023/10/5)● iMeta | 被引超2100次，发文151篇，平均引用13.96，百引耗时16天(2024/1/23)● iMeta | 被引超2800次，发文179篇，平均引用15.88，百引耗时16天(2024/4/17)
2025-07-13 22:41:06
90
原创 MicrobiomeStatPlots | 森林图教程Forest plot tutorial
P=0.001），夏季出生（相对=0.83%；P=0.027）和妊娠期补充鱼油（R2冬季，R2（R2=0.67%；在对这些暴露进行调整后，病毒组评分仍与后期哮喘相关（OR=1.32（1.09-1.61）；它在平面直角坐标系中，以一条垂直的无效线（横坐标刻度为1或0）为中心，用平行于横轴的多条线段描述了每个被纳入研究的效应量和置信区间，用一个图形描述了多个研究合并的效应量及置信区间。森林图显示了双侧线性回归的β系数和P值，点表示点估计值，水平线表示早期暴露与1年哮喘病毒组特征评分之间相关性的95%置信区间。
2025-07-12 09:59:17
717
转载 iMeta | 中科院南土所褚海燕组-解析合成菌群在除草剂降解和碳代谢中的调控机制
点击蓝字 关注我们合成菌群介导的除草剂降解进程激活了土壤中的微生物碳代谢iMeta主页：http://www.imeta.science研究论文● 期刊: iMeta (IF 33.2,中科院双一区Top)● 原文链接: https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/imt2.70058● DOI: https://doi.org/10.1002/imt2.70058● 2025年7月3日，中国科学院南京土壤研究所褚海燕等在iMeta在线发表了题为“SynCom m
2025-07-12 09:59:17
354
转载 iMeta | 林昊/吕昊/黄健-解析2型糖尿病进程中胰岛风险细胞的异常扰动
点击蓝字 关注我们scRiskCell：用于量化 2 型糖尿病中的胰岛风险细胞及其适应性动力学的单细胞框架iMeta主页：http://www.imeta.science研究论文● 原文: iMeta (IF 33.2, 中科院双一区Top)● 原文链接: https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/imt2.70060● DOI: https://doi.org/10.1002/imt2.70060● 2025年6月24日，电子科技大学林昊，吕昊和黄健等在iMe
2025-07-11 08:03:08
160
转载 iMetaOmics | 左志向/陈志航/刘炜-开发癌症组织偏向性基因数据库TBCancer
点击蓝字 关注我们TBCancer：探索癌症中组织偏向性基因特征与功能的数据库iMeta主页：http://www.imeta.science方法论文● 原文: iMetaOmics● 原文链接: https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/imo2.70039● DOI: https://doi.org/10.1002/imo2.70039● 2025年6月29日，中山大学左志向、陈志航、刘炜等团队在iMetaOmics在线发表了题为“TBCancer: A d
2025-07-11 08:03:08
410
原创 纳米孔宏基因组宿主序列去除方法
此外，其他的针对三代纳米孔长读数据的去宿主方法有待开发，例如基于机器学习的序列预测方法等。从动物（包括人类）或植物宿主身上采集的样本（如粪便、血液、组织、拭子、植物根系等）中，宿主自身的DNA通常占测序数据的绝大部分（可能高达99%以上），如果不去除宿主序列，目标微生物（细菌、病毒、真菌、古菌等）的序列会被淹没在庞大的宿主序列中，使得后续分析效率低下且成本高昂。将测序reads与宿主参考基因组进行比对（Minimap2为最常用的纳米孔测序数据比对工具），然后去除比对到参考基因组上的reads。
2025-07-10 11:10:25
286
转载 iMeta | 尹佟明组和汪阳东组-开发用于细胞器基因组的高效图形化组装工具包PMAT2
点击蓝字 关注我们PMAT2：用于细胞器基因组的高效图形化组装工具包iMeta主页：http://www.imeta.science方法论文● 原文: iMeta (IF 33.2，中科院双一区Top)● 原文链接: https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/imt2.70064● DOI: https://doi.org/10.1002/imt2.70064● 2025年7月1日，南京林业大学尹佟明和中国林科院汪阳东等在iMeta在线发表了题为“PMAT2:
2025-07-09 07:03:55
116
原创 MicrobiomeStatPlots | 误差棒点图教程Error bar plot tutorial
颜色表示不同的队列，点表示用Fisher精确检验作为OR估计的效应大小，误差条表示95%的CI（Inova、CHILD和CP分别为n=203178和314）。在考虑了植物和环境变量后，真菌官能团内的多样性对生态系统稳定性的显著影响得以维持，这表明微生物多样性的稳定作用在现实世界的生态系统中是不可替代的（图3）。C：N，土壤碳氮比；在与CP和NDD相关的基因集中，在CP队列中观察到ExpansionHunter Denovo在与轴突引导和突触后密度相关的基因中检测到的大TR的过度传递（图2和补充表4）。
2025-07-09 07:03:55
844
转载 Bio-protocol | 近一年“生物信息”实验方案合集
Bio-101 是Bio-protocol旗下一个中文生命科学实验方案的共享平台，通过与上百个国内优秀科研团队的合作，已出版了多本同行评审、免费获取的中文实验方案电子书。多种方法，重点展示不同生物样本的数据处理与组学分析、细胞显微成像技术优化，以及从序列组装、差异分析到代谢网络构建的实用工具与流程，希望能为研究人员提供思路与参考。，强调使用无需外源参照物的siQ-ChIP和标准化覆盖度方法，实现更严谨、可复现的蛋白–DNA互作信号定量与比较，适用于多种物种的研究。
2025-07-09 07:03:55
261
转载 iMeta | 北京大学白凡组-揭示巨噬细胞内沙门氏菌表型耐药现象的机制
点击蓝字 关注我们巨噬细胞活性氧促进沙门氏菌蛋白质聚集体形成有助于抗生素耐药iMeta主页：http://www.imeta.science研究论文● 原文: iMeta (IF 33.2，中科院双一区Top)● 原文链接: https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/imt2.70059● DOI: https://doi.org/10.1002/imt2.70059● 2025年6月22日，北京大学白凡课题组在iMeta在线发表了题为“Macrophage-d
2025-07-08 20:40:20
133
转载 重磅消息！Bio-protocol正式拓展至生物信息学和计算生物学领域
是 Bio-protocol 旗下一份同行评审的国际学术期刊，专注于发表高质量的生命科学实验方案。该期刊已被PubMed Central、Web of Science 等国际权威数据库收录,是全球为数不多的拥有影响因子的生物学实验方案期刊之一。Bio-101 是Bio-protocol旗下一个中文生命科学实验方案的共享平台，通过与上百个国内优秀科研团队的合作，已出版了多本同行评审、免费获取的中文实验方案电子书。Bio-protocol 于2011年在斯坦福大学创建，旨在提高科研的可重复性，以助力科学发现。
2025-07-08 20:40:20
45
转载 iMeta | 中农任发政院士团队-益生菌改善终末期肾病患者预后的多维度解析
点击蓝字 关注我们益生菌恢复肠道HDL3分泌并改善终末期肾病患者的预后iMeta主页：http://www.imeta.science研究论文● 原文: iMeta (IF 33.2，中科院双一区Top)● 原文链接: https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/imt2.70062● DOI: https://doi.org/10.1002/imt2.70062● 2025年7月1日，中国农业大学任发政院士、王晓玉副教授，岳麓山实验室印遇龙院士和中国航天科工集团
2025-07-08 20:40:20
594
转载 iMeta大会2025第一轮通知(8.23-25, 湖北武汉，早鸟价最后2周)
东院与东湖公园相邻，西院与珞珈山、磨山隔岸相望，院内高树如云，鸟语花香，鹭飞鹤翔，自然环境优美，政治人文资源丰厚，素有“湖北国宾馆”之称。张天缘、白德凤、彭凯、侯辉宇、马闯、朱志豪、曾美尹、罗豪、荀佳妮、杨海飞、周远平、周扬、徐锦波、王瑶、高云云、万锈琳、韩维、丁霞、魏勇军、许鹏飞、周文、刘亚勇、孟佳林、赵纪伟、于小晶、何天乐、赵婧瑄、陈怡、陶永富、沈鹤霄等，约。地铁：轨道交通4号线（武汉火车站-柏林方向），岳家嘴换乘轨道交通8号线（军运村方向），省博湖北日报站下车后步行2.2公里到达，全程约1小时。
2025-07-07 10:13:50
278
原创 纳米孔长读宏基因组简介及分析方法概述
纳米孔宏基因组测序数据的数据特征包括读长长、读长分布不均、准确性差等，因此相对应的分析方法不同于传统的二代高通量宏基因组测序，EasyNanoMeta的开发不仅补全了纳米孔宏基因组数据分析流程的空白，同时具备简单易用以及高度灵活的特征，能够满足不同人群的分析需求。EasyNanoMeta是一个专为纳米孔宏基因组数据分析设计的流程，该流程整合了超过100个不同的生物信息工具，能够实现从下机数据到结果汇总的全部分析。包括全部分析步骤的运行脚本，该脚本提供了详细的、可重复的纳米孔宏基因组分析步骤。
2025-07-06 07:01:42
744
Windows系统R语言4.0安装包合集(20200909)
2020-09-09
空空如也
TA创建的收藏夹 TA关注的收藏夹
TA关注的人