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Gabarito - Lista de Exercícios Enzimas

Este documento contém 16 perguntas sobre enzimas para uma disciplina de bioquímica. As perguntas abordam tópicos como a relação entre enzimas e substratos, como as enzimas afetam a velocidade e o equilíbrio de reações, e como fatores como a concentração de substrato e enzima influenciam a atividade enzimática.
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Gabarito - Lista de Exercícios Enzimas

Este documento contém 16 perguntas sobre enzimas para uma disciplina de bioquímica. As perguntas abordam tópicos como a relação entre enzimas e substratos, como as enzimas afetam a velocidade e o equilíbrio de reações, e como fatores como a concentração de substrato e enzima influenciam a atividade enzimática.
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LISTA DE EXERCÍCIOS – ENZIMAS

Disciplina: Bioquímica I Turma: Licenciatura em Química

Docente Responsável: Prof. Dr. Carlos A. Sorgi

1. A relação entre uma enzima e uma molécula de substrato pode ser descrita como
(Justifique sua resposta):

a. Uma associação temporária.


b. Uma associação estabilizada por uma ligação covalente.
c. Uma associação onde a enzima é mudada permanentemente.
d. Uma alteração mútua permanente da estrutura.
e. Uma ligação não complementar.

Resposta: Letra A.

A enzima é complementar ao estado de transição.

2. Por que uma enzima com o sítio ativo perfeitamente complementar ao substrato seria
inútil como catalisador? Desenhe as curvas de progresso de uma reação genérica, S → P, em
presença e em ausência desta enzima. Desenhe as curvas de progresso da reação S → P em
presença e em ausência de uma enzima que atua como um catalisador eficiente. De que forma
a energia de ligação contribui para a catálise?

Resposta:
Uma enzima com sítio ativo complementar ao substrato seria inútil porque a formação
do complexo ES seria mais estável que o reagente e o produto. Desta maneira a haveria
um aumento na energia de ativação (ΔGcat).
Curva de progresso de uma reação em presença e ausência de enzima ineficiente
complementar ao substrato.
Curva de progresso de uma reação em presença e ausência de enzima eficiente

Para que uma reação seja catalisada, os catalisadores agem diminuindo a barreira de
ativação. Interações covalentes entre a E e o S diminuem a Ea acelerando a reação
porque dão condições para que a reação ocorra por uma via alternativa de baixa energia.
Interações não covalentes entre a E e S é o que distingue uma E de outros catalisadores
com a formação do complexo ES específico.
A interação entre S e E neste complexo é mediada pelas mesmas forças que estabilizam
a estruturas das proteínas (hidrofóbicas Lig. H e iônicas). A formação de cada interação
fraca no complexo é acompanhada pela liberação de uma pequena quantidade de E livre
que estabiliza a interação (esta energia é a Energia de ligação Δ G ).
B
3. Durante uma experiência você descobriu que uma reação catalisada por uma enzima
apresenta um ΔG = -20 kcal/mol. Se você dobrar a quantidade de enzima na reação qual será o
ΔG para a reação?

a) -40 kcal/mol.
b) -20 kcal/mol.
c) 0 kcal/mol.
d) +20 kcal/mol.
e) +40 kcal/mol.

Resposta: Letra B. As enzimas não afetam o ΔG ou Keq de uma reação, elas aceleram
a velocidade com a qual a reação alcança o equilíbrio.

4. Existem duas maneiras para que uma reação catalisada por uma enzima seja irreversível
nas células. Uma delas é:

a) Quando o ΔG for extremamente positivo.


b) Quando um dos produtos é removido eficientemente da reação por outra reação
enzimática.
c) Quando um dos reagentes é a água, que está presente em concentrações saturantes.
d) Quando um dos produtos é formado muito rapidamente e acumula em grandes
quantidades.
e) Quando a enzima é regulada alostericamente.

Resposta: Letra B.

5. Em uma via metabólica que envolve 10 reações catalisadas por enzimas, a velocidade
de produção do produto da via é sempre determinada pelo(a):

a) ΔG da etapa da via mais favorável energeticamente.


b) ΔG da etapa da via mais desfavorável energeticamente.
c) Velocidade da etapa mais lenta da via.
d) Velocidade da etapa mais rápida da via.
e) Soma das velocidades das 10 etapas da via.

Resposta: Letra C. Etapa onde há quebra do complexo ES em E + P.


6. Para a reação A + B → C + D, a adição de um catalisador aumenta a velocidade de
produção de C + D em 100.000 vezes comparada com a reação onde não foi usado o
catalisador. Considerando-se agora a reação C + D → A + B, qual seria o efeito da adição do
catalisador em relação à velocidade de produção e A + B comparada com a reação onde não
foi usado o catalisador?

a) Não haverá diferença.


b) Ela será 100000 vezes menos.
c) Ela será 100000 vezes maior.
d) Ela dependerá da concentração de C e D.
e) O catalisador só atua em uma direção da reação.

Resposta: Letra C. Para que a K equilíbrio seja a mesma a velocidade (V2) deve ser
maior.

7. A velocidade inicial (v) de uma reação catalisada por uma enzima atinge V quando:
M

a. [S] = KM

b. [S] = K /10
M

c. 1/[S] = 1/ K M

d. [S] >>> K M

e. Nenhuma alternativa está correta.

Resposta: Letra D.

8. Quando [S] = 0.1 K a velocidade inicial será:


M

a. 0.1 × VM

b. 0.3 × VM

c. 0.5 × VM

d. 0.7 × VM

e. 0.9 × VM

Resposta: Letra A.
V0 = [S]/KM + [S] x VMax
KM = [S] = ½ VMax
V0 = 0.1 KM / KM + 0,1 KM x VMax
V0 = 0,09 x VMax
9. Quando a concentração do substrato é muito maior que o K a velocidade da reação é
M,

praticamente igual a:

a. K.d

b. pK.
c. V.M

d. Todas as alternativas estão corretas.


e. Nenhuma das alternativas está correta.

Resposta: Letra C.

10. A eficiência catalítica de duas enzimas diferentes pode ser aproximadamente


comparada através (justifique sua escolha):

a. Da formação do produto da reação.


b. Do valor do K .M

c. Do peso molecular das enzimas.


d. Do valor do pH ótimo.
e. Do valor das V .
M

Resposta: Letra B.
Eficiência catalítica é igual a Kcat/KM

11. Uma enzima do fígado que remove glicose do sangue tem um K elevado, já a que se
M

encontra no cérebro e faz a mesma coisa no cérebro tem um K baixo. Esses valores diferentes
M

ocorrem porque:

a. A enzima do cérebro pode retirar glicose da corrente sanguínea mesmo quando os níveis
de glicose estão baixos enquanto a do fígado só pode remover a glicose quando os níveis estão
altos.
b. A enzima do cérebro pode retirar glicose da corrente sanguínea somente quando os
níveis de glicose estão altos enquanto a do fígado só pode remover a glicose quando os níveis
estão baixos.
c. A enzima do cérebro pode retirar glicose da corrente sanguínea somente quando os
níveis de glicose estão altos enquanto a do fígado pode remover a glicose a qualquer momento.
d. Este fenômeno não tem nenhum valor aparente para o organismo.
e. Ele é realmente perigoso para o organismo pois idealmente os dois K deveriam ser
M

iguais.

Resposta: Letra A.
12. Na representação dos duplos inversos para a atividade enzimática, a maior concentração
do substrato é encontrada:

a. Próximo à origem dos eixos.


b. No topo do eixo vertical.
c. Na parte final a direita do eixo horizontal.
d. Na parte final à esquerda do eixo horizontal.
e. No intercepto horizontal da curva.

Resposta: Letra A.

13. Qual será a concentração do substrato para uma enzima que apresenta k = 30 s e K =
cat
-1
M

0,005 M e uma velocidade que é 25% da V ? Determine V quando [S] = 0,5 K ; 2 K e 10


M Max M M

K.
M

Resposta: 1,7 mM; 0,33; 0,66; 0,91.


Substituir nas fórmulas
Kcat = VMax/ nº mol E
V = [S]/KM + [S] x VMax

A. ¼ VMax = [S]/ 0,005M + [S] x VMax = ¼ = [S]/0,005 +[S] = 1,7 x 10 M -3

B. V0= 0,5KM/ KM+ 0,5KM x VMax = 0,5 KM/ 1,5 KM x VMax = 0,33 VMax

14. Como a concentração total da enzima afeta o número de turnover e a V ? M

Resposta:
Kcat = VMax/[E]t
A [E] afeta a VMax e o nº turnover não afeta.
O número de turnover (Kcat) é o número de moles de substrato transformado por minuto
por mol de enzima sob condições ótimas. Para calcular Kcat considera-se que toda
enzima existe como ES e que v=VMax.
Não depende de [E] e depende de pH e temperatura

15. A anidrase carbônica das hemáceas tem um PM= 30.000 e catalisa a hidratação
reversível do CO até H CO que é muito importante no transporte de CO dos tecidos para os
2 2 3 2

pulmões. Se 10 µg de anidrase carbônica catalisam a hidratação de 0,30 g de CO /min., a 37ºC,


2

qual será o número de turnover dessa enzima? O número de turnover pode variar em função do
tempo? Por quê? E em função da concentração do substrato?

Resposta:
Kcat = VMAX / nº mol E
Nº mol de E = 10x10 g/30.000g = 3,33 x 10 mol
-6 -9

V= 0,30 g CO2 /min


VMax = 6,82 x 10 mol/min
-3

Kcat = 6,82 x 10 mol/min/ 3,33 x 10 mol = 2,05 x 10 min


-3 -9 7 -1
O número de turnover depende do tempo e da concentração de substrato, se tiver menor
tempo e menor [S] o Kcat é diminuído.

16. O sabor doce do milho recém-colhido deve-se ao alto conteúdo de açúcar no grão. O
milho comprado em mercados (vários dias depois de colhido) não é tão doce porque 50% do
açúcar livre é convertido em amido no primeiro dia após a colheita. Para manter a doçura do
milho fresco, depois de debulhado, ele pode ser imerso em água fervente por alguns minutos
e, então, resfriado com água fria. O milho processado dessa maneira e mantido congelado
mantém a doçura. Qual é a base bioquímica desse processo?

Resposta: O processo pode ser explicado pela influência do fator temperatura na


atividade enzimática. No milho, há uma enzima capaz de converter o açúcar em amido, e em
alta temperatura esta é desnaturada, fazendo com que a conversão de açúcar em amido demore
muito mais tempo para ocorrer, mantendo, portanto, o milho com sabor doce.

17. A enzima urease aumenta a velocidade da hidrólise da ureia em pH 8,0 e 20ºC por um
fator de 10 . Se uma dada quantidade de urease pode hidrolisar completamente certa quantidade
14

de ureia em 5 minutos a 20ºC e pH 8,0, quanto tempo levaria para que essa mesma quantidade
de ureia fosse hidrolisada sob as mesmas condições na ausência de urease? Suponha que ambas
as reações ocorram em sistemas estéreis, de modo que a ureia não possa ser atacada por
bactérias.

Resposta: Se a velocidade da hidrólise é aumentada por um fator de 1014, logo sem ela
o tempo de reação será 1014 maior. Assim, ao invés de 5 minutos, calcula-se 1014 vezes mais,
resultando em 9,5 x 108 anos.

18. Quando uma solução de enzima é aquecida, há perda progressiva da atividade catalítica
com o tempo, devido à desnaturação da enzima. Uma solução da enzima hexocinase incubada
a 45ºC perde 50% da atividade em 12 minutos, mas, quando incubada a 45ºC na presença de
uma grande quantidade de um dos seus substratos, ela perde apenas 3% da atividade em 12
minutos. Sugira uma explicação para a desnaturação térmica da hexocinase ser retardada
quando um dos seus substratos está presente.

Resposta: Quando a enzima se liga ao substrato, ocorre a transposição dos dois para
um complexo enzima-substrato. Este é quimicamente mais estável que a enzima
sozinha, portanto há o retardo de sua desnaturação.

19. A carboxipeptidase, que remove sequencialmente resíduos de aminoácidos


carboxiterminais de substratos peptídicos, é um polipeptídeo único de 307 aminoácidos. Os
dois grupos catalíticos essenciais do sítio ativo são fornecidos por Arg145 e Glu270.

a. Se a cadeia da carboxipeptidase fosse uma a-hélice perfeita, quão distante (em Å) o


resíduo de Arg145 estaria do resíduo de Glu270?
Resposta: Considerando cada volta de uma alfa-hélice perfeita é correspondente a 3,6
resíduos de aminoácidos, com uma distância de 5,4Å, para 125 aminoácidos que separam Arg 145

e Glu serão 34,72 voltas (35, arredondando), e, portanto, 189Å.


270

b. Explique como, então, esses dois resíduos de aminoácidos podem catalisar uma
reação que ocorre em uma distância de poucos angströms.

Resposta: O enovelamento tridimensional da enzima aproxima os resíduos de


aminoácidos.

20. Uma enzima catalisa a reação A ⇆ B. A enzima está presente em uma concentração de
2 nM e a V é 1,2 µM s . A K para o substrato A é 10 µM. Calcule a V da reação quando a
max
-1
m 0

concentração do substrato for: (a) 2 µM, (b) 10 µM, (c) 30 µM.

Resposta: (a) Para 0,2 µM de substrato, temos:

V = (1,2 µM s * 2 µM) / (10µM + 2µM) = 0,2 µM s


0
-1 -1

(b) Para 10 µM de substrato, temos:

V = (1,2 µM s * 10 µM) / (10µM + 10µM) = 0,6 µM s


0
-1 -1

(c) Para 30 µM de substrato, temos:

V = (1,2 µM s * 30 µM) / (10µM + 30µM) = 0,9 µM s


0
-1 -1

21. Os dados da tabela abaixo foram obtidos para uma reação enzimática (volume final 10
mL), usando-se o seguinte procedimento:

A fim de se estudar a dependência da velocidade de uma reação enzimática pela


concentração de substrato, uma quantidade constante de enzima foi adicionada a uma
série de tubos contendo diferentes concentrações de substrato. As velocidades iniciais
da reação foram determinadas medindo-se o número de mol (ou mmol) de substrato
consumido (ou produto formado) por minuto. A tabela a seguir mostra as velocidades
iniciais fornecidas pelas respectivas concentrações de substrato:

[S] (mol/L) v (mmol/min)


5,0 x 10-2 0,25
5,0 x 10-3 0,25
5,0 x 10-4 0,25
5,0 x 10-5 0,20
5,0 x 10-6 0,71
5,0 x 10-7 0,096

(a) Qual é a V para esta concentração de enzima?


max

(b) Qual é o K desta enzima?


M
(c) Verifique se essa reação segue uma cinética simples de Michaelis-Menten.
(d) Calcule a quantidade total de produto formado durante os primeiros cinco minutos,
quando a [S] = 2,0 x 10 M. É possível fazer o mesmo para [S]=2,0x10 M?
-3 -6

(e) Suponha que a concentração de enzima em cada tubo foi aumentada por um fator de
4. Quais são os valores de K e V ? Neste caso, qual é o valor de v para
M max

[S] = 5,0x10-6 M?

Resposta:

a. V = 0,2359 mmol/min
max

b. K = 7,29 x 10
M
-7

c. Sim, seu gráfico de V em função de [S] segue o padrão das enzimas michaelianas,
0

atingindo o platô em V . max

d. Para [S] = 2,0 x 10 M, a quantidade de produto formado seria de 1,1795 mmol, e para
-3

[S] = 2,0x10 M, 0,8455 mmol.


-6

e. K = 2,92x10 , V = 0,9412 mmol/min, V = 0,594 mmol/min


M
-6
max 0

22. Considerando a reação A → B não catalisada, faça o gráfico da concentração de produto


formado em função do tempo ([P] x t) e da velocidade da reação em função do tempo (V x t).
Assinale nos gráficos os tempos iniciais e finais da reação. Por que se utilizam tempos iniciais
para medidas de velocidade de reação?

Resposta:
Os tempos iniciais de reação são utilizados pois assumem um perfil linear, ao passo que
conforme o tempo passa, o gráfico se torna mais próximo de uma curva.

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