Controle Da Expressão Gênica
Controle Da Expressão Gênica
Objetivos
meeting_room Introdução
A genética é uma área da ciência que estuda os genes e suas regulações, as
quais são bastante complexas e muitas vezes dependem do meio em que o
organismo se encontra, isto é, nossos genes precisam responder a variações,
como a falta de nutrientes ou um ambiente com temperatura ou salinidade
elevada. Se faltar um nutriente, por exemplo, o indivíduo que mais recursos
conseguir economizar será aquele com tendência a sobreviver. Já o que continuar
utilizando normalmente as suas reservas tenderá a esgotá-las mais cedo, não
sobrevivendo às novas condições de escassez.
Comentário
Falaremos mais dos eucariotos e dos seus mecanismos de expressão gênica em breve, mas já adiantamos
uma informação: chamado de diferenciação celular, tal fenômeno ocorre nos seres multicelulares, e não nos
procariotos.
Por possuírem apenas uma célula, os procariotos são mais simples e não possuem
tantas interações. Dessa forma, sua regulação acontece visando à manutenção da
vida daquele indivíduo dentro de determinado ambiente. Normalmente, a regulação da
expressão em procariotos pode acontecer em dois diferentes pontos.
Com maior custo energético, um deles ocorre após a síntese da proteína, que é o
produto da fase de tradução. Essa regulação é chamada de pós-traducional,
21/09/2023, 11:50 Controle da expressão gênica
Induzíveis
Trata-se de genes que não são essenciais para a manutenção da vida. Eles, portanto, estão mais suscetíveis
à regulação de sua expressão.
O mesmo conceito pode ser aplicado de forma inversa, em que um fator efetor se liga
a uma região promotora, favorecendo a transcrição. Outra possibilidade é haver a
ligação de um repressor que impeça a atuação de um fator repressor, impedindo que
ocorra a inibição da transcrição do gene.
21/09/2023, 11:50 Controle da expressão gênica
RNA polimerase
21/09/2023, 11:50 Controle da expressão gênica
Existem diferentes isoformas de polimerases, mas vamos nos referir a elas como "RNA polimerase" para fins
didáticos.
Diferenças no RNAm de eucariontes e procariontes. UTR é uma sigla da expressão untranslated region, que significa
região não codificante.
Após a síntese e o processamento do RNAm nos eucariotos, ele precisa sair do núcleo
celular para encontrar o ribossomo, que fica no citoplasma. Nos procariotos, por não
possuir carioteca, o RNAm já é traduzido por um ribossomo assim que termina a
transcrição, já que ambos se encontram no citoplasma.
Agora podemos continuar falando sobre a regulação gênica dos procariotos. Para
facilitar a compreensão, vamos ver dois exemplos práticos: a regulação dos operons
TRP e Lac, ambos presentes nas bactérias Escherichia coli.
Grupamento fornil
R-CH=O
21/09/2023, 11:50 Controle da expressão gênica
Tais RNAs policistrônicos são formados por uma sequência que contém a informação
para expressar todas as diferentes proteínas que constituem uma mesma via ou estão
fortemente relacionadas de alguma forma, veja:
21/09/2023, 11:50 Controle da expressão gênica
P (promotor) expand_more
21/09/2023, 11:50 Controle da expressão gênica
O (operador) expand_more
Quanto aos genes responsáveis pelas proteínas trpE, trpD, trpC, trpB e trpA, o
mais importante é entender que todas essas proteínas funcionam em cascata,
em que uma depende da outra, para formar o triptofano.
Em baixas concentrações de triptofano, essa etapa vai ser mais demorada, a ponto de
dar tempo de formar outro grampo (dessa vez, entre os trechos 2 e 3), que pode ser
mais facilmente desfeito. Ele é chamado de “grampo antiterminação”.
21/09/2023, 11:50 Controle da expressão gênica
Também existem três genes estruturais: LacZ (gene Z), LacY (Y) e LacA (A). Eles são
responsáveis por codificar as enzimas β-galactosidase, permease e transacetilase,
além daquelas que codificam os inibidores do próprio operon. O gene I possui uma
região promotora única. Veja a representação abaixo:
Um recurso muito valioso dessas células é que elas tentam tornar o consumo de
energia o mais eficiente possível. Na ausência de lactose, não há razão para se
expressar os genes Z, Y e A, pois eles estão envolvidos no metabolismo da lactose.
A lactose não atua diretamente no operon Lac, porém, quando algumas moléculas de
galactose entram na célula, um pequeno número de enzimas β-galactosidase é capaz
de converter galactose em alolactose, que se liga ao repressor Lac e facilita a
mudança conformacional da proteína. Com isso, ocorre uma dissociação entre o
repressor e o operon 1, liberando a função da RNA polimerase para transcrever os
genes Z, Y e A.
21/09/2023, 11:50 Controle da expressão gênica
Esquema de regulação do operon Lac mediado pela lactose. Pol: RNA polimerase; mRNA Lac: mRNA mensageiro
lactose.
Outra forma de regulação é dependente da glicose. Sua presença inibe o operon Lac,
porque as células devem priorizar o metabolismo da glicose em detrimento de outros
carboidratos.
A ativação do operon Lac ocorre quando os níveis de glicose estão baixos, sendo
induzidos por uma pequena molécula efetora, a cAMP (AMP cíclico), e uma proteína
regulatória denominada CRP. Vamos entender como isso ocorre?
CRP
Sigla para cAMP receptor protein, ou seja, proteína receptora de cAMP. CRP também pode ser chamada de
CAP (catabolite activator protein).
looks_two Esse complexo se liga ao DNA na região operadora dependente de CAP-cAMP próximo
ao operador 3, ativando a transcrição dos genes Z, Y e A para o metabolismo da lactose.
21/09/2023, 11:50 Controle da expressão gênica
looks_3 Na presença de glicose, os níveis de cAMP são reduzidos e o complexo CAP-cAMP não
é formado; com isso, o operon Lac é inibido.
Regulação do operon Lac mediado por glicose. cAMP: AMP cíclico; CAP: proteína
receptora de cAMP; Pol: RNA polimerase; ATP: adenosina trifosfato; P: região
21/09/2023, 11:50 Controle da expressão gênica
promotora.
Estudar os operons Lac e TRP nos permitiu entender algumas das principais
abordagens para a regulação gênica em procariontes, ambos contendo repressores e
efetores com diferentes estratégias e abordagens nutricionais. Agora já podemos
avançar nosso estudo para a compreensão da regulação genética em eucariotos, o
que faremos no próximo módulo.
21/09/2023, 11:50 Controle da expressão gênica
Questão 1
O produto da via metabólica costuma inibir o operon que desencadeia tal via, uma
vez que a célula compreende que já possui essa molécula em quantidade suficiente
e poupa recursos, os quais, por sua vez, serão investidos em outros processos.
Existem exceções de genes constitutivos, porém, de forma geral, ocorre uma
inibição.
Questão 2
Sabemos que o RNAm dos procariotos é formado por diversos trechos, formando
apenas um RNAm chamado de policistrônico. Considerando as regulações da
expressão gênica de tais organismos, estão corretas somente as afirmativas:
A I e II.
21/09/2023, 11:50 Controle da expressão gênica
B II e III.
D I, II e IV.
E I, III e IV.
Dica
Por outro lado, os organismos multicelulares têm uma complexidade maior e uma
porcentagem muito menor de genes codificadores e não codificantes. Em seres
humanos, somente cerca de 2% do DNA é codificado.
Diferenciação celular
Quanto à especialização celular, digamos que as células do pâncreas precisam ser
muito eficientes na produção de hormônios e enzimas digestivas. Por outro lado, as
do fígado têm propriedades muito diferentes, devendo ser altamente regeneradas,
sintetizar colesterol e metabolizar diferentes moléculas, entre outras funções.
21/09/2023, 11:50 Controle da expressão gênica
Células-tronco
São células “virgens” e sem nenhum tipo de especialização, tendo o potencial de se tornar qualquer célula.
21/09/2023, 11:50 Controle da expressão gênica
Procarboxipeptidase
1 7,6 Albumina
A1
Apolipoproteína C-I
3 Quimotripsinogênio 4,4
2,5
Apolipoproteína C-
4 Tripsina 3,7
III
Citocromo oxidase
6 Protease E 1,9
3
Citocromo oxidase
7 Lipase 1,9
2
Citocromo oxidase
9 Amilase pancreática 1,7
1
Lipase estimulada
10 1,4 Apolipoproteína E
por sair biliares
Hoje em dia, um dos maiores mistérios da ciência é entender melhor como esses
padrões funcionam. Dessa forma, poderíamos desenvolver qualquer tecido a partir de
células-tronco e curar uma grande parte das doenças degenerativas.
Exemplo
Um estudo recente que utiliza a reprogramação do padrão de expressão gênica é o do brasileiro Ernesto
Goulart e de outros colaboradores (2019). Nesse estudo, resetou-se o padrão de expressão gênica de células
do sangue do paciente, tornando-as o mais próximo possível de células-tronco e induzindo uma
transformação em tecido hepático. Vale ressaltar que essa técnica possui uma grande vantagem por utilizar
as células do sangue do paciente, pois a chance de haver qualquer tipo de incompatibilidade celular fica
bastante reduzida. Com um grande montante de novas células hepáticas, os pesquisadores fizeram uma
porção do tecido completamente nova e saudável, utilizando impressoras 3D para construir a forma dele, e o
reinseriram no paciente, repondo aquele danificado e melhorando sua condição de vida.
21/09/2023, 11:50 Controle da expressão gênica
Entretanto, ainda há muito a ser pesquisado. Juntos, vamos entender algumas das
regulações gênicas mais importantes que funcionam nos organismos eucariontes.
Diferentemente dos procariotos, em que a maior parte das regulações ocorre no nível
de transcrição, nos eucariotos elas acontecem em vários pontos diferentes,
conferindo mais complexidade e uma maior quantidade de pontos de regulação, que
podem ser modificações transcricionais, pós-transcricionais, traducionais ou pós-
traducionais.
Comentário
Ao longo deste conteúdo, usaremos o termo "maquinaria de transcrição", pois, em eucariotos, apenas a RNA
polimerase não pode iniciar a transcrição, precisando da ajuda de fatores de transcrição universais
adicionais.
21/09/2023, 11:50 Controle da expressão gênica
Histonas
O processo de compactação e descompactação do DNA em eucariotos é mediado por
proteínas cilíndricas chamadas de histonas. Essas proteínas são ricas em resíduos de
lisina, cujo caráter é básico; por isso, elas possuem alta afinidade com o grupamento
fosfato do DNA.
Dica
O padrão de histonas do seu DNA constitui um dos fatores para que diferentes células tenham funções
diferentes.
21/09/2023, 11:50 Controle da expressão gênica
Metilação
Outro mecanismo que inibe a expressão gênica é a metilação do próprio DNA (mais
especificamente, na posição 5 do anel de citosina). Isso dificulta a interação com a
RNA polimerase, impedindo a transcrição.
Saiba mais
O DNA não codificante de uma região bastante afastada pode se dobrar sobre os genes, executando algum
tipo de regulação. Por esse e outros motivos, o termo “DNA lixo” vem caindo em desuso. Estamos a cada dia
entendendo melhor os detalhes e a complexidade do nosso material genético.
alguns deles:
biotech Na tradução
No processamento pós-traducional
21/09/2023, 11:50 Controle da expressão gênica
biotech
biotech Na degradação
Splicing alternativo
Como todos sabemos, os eucariotos são organismos muito complexos com milhares
de interações diferentes. Todos os dias, os cientistas descobrem novos conceitos e
novas formas de regulação genética.
Por isso, vamos nos concentrar em algumas das regulamentações mais relevantes,
como splicing alternativo e maturação de RNAm no nível de processamento pós-
transcricional, além de miRNAs (microRNAs) e siRNAs (small interference RNA) recém-
descobertas que levam à degradação do mRNA. Nós já estudamos o porquê de as
células, ainda que contenham exatamente o mesmo DNA, possuírem diferentes
especializações.
21/09/2023, 11:50 Controle da expressão gênica
Já vimos que parte do DNA não codificante é muito importante para a regulação, além
de ser estruturalmente relevante, pois define a forma e os espaçamentos entre as
regiões gênicas. Sobre a parte codificante, porém, resta esta questão: por que apenas
2%?
Uma das chaves para entender por que o DNA codificador é tão pequeno é o splicing
alternativo. Cada célula possui um padrão de splicing, um conjunto de informações
sobre como ela realizará esse processamento que é dado de acordo com sua função
para produzir diferentes proteínas de um mesmo gene.
Um mesmo gene pode dar origem a uma enorme quantidade de diferentes RNA
mensageiros e, por consequência, proteínas diferentes.
Os trechos que serão considerados éxons ou íntrons também podem ser regulados
por repressores ou ativadores do splicing. Além do splicing alternativo, o pré-RNAm
precisa ser processado para poder sair do núcleo e chegar ao ribossomo onde será
traduzido. O pré-RNAm passa por duas etapas:
filter_1 filter_2
Adição de um cap 5' criado pela ligação GMP metilado (monofosfato de
de nucleotídeos alterados. guanosina metilado) unido por uma
ligação trifosfato na extremidade 5' do
RNAm.
O cap 5' é essencial para que o RNAm maduro seja reconhecido e, em seguida,
exportado para o citoplasma. Uma vez fora do núcleo, ele é direcionado para o
ribossomo. O cap 5’ também possui um efeito protetor, impedindo a degradação do
RNAm.
Saiba mais
A palavra cap significa chapéu ou capacete; portanto o cap 5’ seria de fato um capacete que protege o RNAm
da degradação e perda de informação por ação de ribonucleases e fosfatases. Ele ainda direciona o RNAm
para fora do núcleo celular para realizar o processo de tradução.
21/09/2023, 11:50 Controle da expressão gênica
Quando o cap 5' e a cauda poli-A são adicionados, o RNAm se torna maduro e pode
ser traduzido pelos ribossomos no citoplasma. Esse processo é regulado pela
remoção de um desses aditivos (cap 5’ ou cauda poli-A).
Se a célula não precisa mais de determinada proteína, sinais regulatórios são enviados
ao núcleo, de onde são removidos. O RNAm agora "imaturo" é degradado (processo
conhecido como regulação pós-transcricional).
Processamento do RNAm.
21/09/2023, 11:50 Controle da expressão gênica
miRNA
21/09/2023, 11:50 Controle da expressão gênica
A fita dupla de miRNA passa por um complexo proteico chamado miRISC, que
seleciona uma das duas fitas para atuar como regulador (miRNA maduro). Apesar de
tal mecanismo não ter sido completamente elucidado, os cientistas compreendem
que a fita escolhida deve ter afinidade com a sequência-alvo a ser regulada, mesmo
sabendo que o miRNA tem uma característica promíscua quanto aos seus alvos.
siRNA
21/09/2023, 11:50 Controle da expressão gênica
Eles são um pouco maiores, com cerca de 22 a 23pb. Os siRNA podem ser exógenos
(oriundos do RNA viral de fita dupla) ou endógenos (oriundos de retrotransposons),
sendo formados a partir de um pareamento perfeito de uma dsRNA sem a formação
prévia de um hairpin.
O dsRNA já está presente fora do núcleo celular e não sofre processamento pela
Drosha. No citoplasma, a Dicer cliva o dsRNA, formando, com isso, os fragmentos de
siRNA. O miRNA maduro e o siRNA podem regular a produção proteica de duas
formas:
Retrotransposons
Componentes genéticos com capacidade de autorreplicação, convertendo RNA em DNA. Os retrotransposons
estão presentes em eucariotos, embora sua possível origem seja viral. Ao longo da evolução, eles se
estabeleceram no genoma eucarionte.
filter_1 filter_2
Ligar-se ao RNAm, reprimindo a tradução Degradar o RNAm caso o pareamento de
por bloqueio físico e não deixando o bases seja completo.
ribossomo atuar.
Exemplo
Foram encontrados miRNA relacionados a diversos oncogenes, que são genes responsáveis por ações que
promovem a multiplicação celular. O silenciamento dessas proteínas pode auxiliar na prevenção de tumores
ou de desordens oriundas da quebra da homeostase mediada por tais oncogenes.
Os cientistas ainda estão trabalhando para entender melhor como eles funcionam,
embora suas aplicações médicas pareçam promissoras.
Exemplo
21/09/2023, 11:50 Controle da expressão gênica
Imagine uma pessoa cujo metabolismo seja alterado para produzir grandes quantidades de colesterol
endógeno. Ela pode ter muitos problemas de saúde causados pelo colesterol alto.
No futuro, será possível construir siRNAs específicos para inibir a expressão da HMG-
CoA redutase, principal enzima na síntese endógena de colesterol, abrindo a
possibilidade de uma nova terapia gênica. Diversos estudos vêm sendo realizados no
silenciamento de genes relacionados a câncer – e um ajuste da regulação dos
oncogenes pode ajudar a prevenir o câncer e ser uma terapia bastante promissora.
Questão 1
Alguns seres procariotos possuem um DNA muito mais extenso que o DNA dos
organismos eucariontes, mas o nível de complexidade de um ser unicelular é bem
menor. Como isso se explica?
O paradoxo do valor C diz que, mesmo com uma quantidade bem inferior de pares
de bases, o DNA dos eucariotos é muito mais complexo graças ao processamento
que o RNAm recebe após a transcrição. Mecanismos como o splicing alternativo,
geram inúmeras variações para um mesmo trecho expresso.
Questão 2
21/09/2023, 11:50 Controle da expressão gênica
A Pós-traducional
B Pós-transcricional
C Transcricional
D Traducional
E Replicação
para o endereçamento dele para fora do núcleo. A não adição dessas porções
resulta na degradação do RNAm.
3 - Epigenética
Ao final deste módulo, você será capaz de identificar o conceito e as características da epigenética.
21/09/2023, 11:50 Controle da expressão gênica
Conceitos iniciais
A genética é o estudo das funções e estruturas dos genes, das características
hereditárias e da variação dos seres vivos. Todas essas informações ficam
armazenadas nas moléculas de DNA.
Já a epigenética estuda as características que vão além dos genes. Por isso, ela
possui o prefixo “epi”, um derivado do radical grego que indica a posição de superior a
algo.
A resposta está nos fatores de transcrição específicos de cada linhagem celular que
fazem com que essas células se especializem em sua forma final, bem como nas
21/09/2023, 11:50 Controle da expressão gênica
A epigenética está acima dos genes: ela estuda as alterações na expressão gênica
que não alteram a estrutura primária da sequência de nucleotídeos. Além disso,
explora as modificações no DNA decorrentes da interação do indivíduo com o
ambiente.
Ambiente
O ambiente pode ser explicado pela forma como um indivíduo vive, do que ele se alimenta, quais são seus
hábitos e suas condições de moradia, entre outros exemplos.
Exemplo
Um indivíduo fumante consome grandes quantidades de nicotina. O mecanismo de ação dela sobre o DNA
ainda não foi totalmente elucidado, mas acredita-se que, por causar grande estresse oxidativo no corpo, haja
maior produção de resíduos de metila e, por consequência, maior metilação do DNA. A fumaça do cigarro
também contém agentes oxidantes capazes de causar danos a macromoléculas celulares, ativando
leucócitos e plaquetas, o que contribui ainda mais para o estresse oxidativo. Por isso, o hábito de fumar e
ficar exposto a nicotina, por si só, é capaz de modificar o padrão de metilação em determinados genes, o
que, em longo prazo, pode auxiliar no desenvolvimento de algumas doenças.
Genes que, em condições normais, não estariam sendo expressos passam a sê-lo,
enquanto a homeostase celular é quebrada. Desse modo, genes que deveriam ser
21/09/2023, 11:50 Controle da expressão gênica
Comentário
É difícil especificar todas as mudanças em nossos corpos causadas por determinada substância. Contamos,
afinal, com milhares de células diferentes a expressar proteínas diferentes. No entanto, a comunidade
científica trabalha incansavelmente para estudar as várias alterações genéticas causadas por alimentos,
comportamento, drogas e qualquer outro agente.
Ainda usando a nicotina como exemplo, sabemos que o cigarro é conhecido por ser
prejudicial à saúde. Estudos têm demonstrado que seu uso pode reduzir em cerca de
14 anos a expectativa de vida de fumantes adultos.
Hereditariedade genética
Os conceitos sobre hereditariedade genética evoluíram com o passar dos anos. Não
apenas os genes são responsáveis por transmitir as informações dos pais para os
filhos. Os padrões epigenéticos também são fundamentais, podendo ser passados por
meio de gerações.
Atenção!
21/09/2023, 11:50 Controle da expressão gênica
A fase gestacional e os primeiros meses de vida de um indivíduo são períodos importantes para a formação
de padrões epigenéticos.
Durante a fase adulta, na formação dos gametas, ocorre uma limpeza do padrão
epigenético seguida de uma reprogramação para a formação de um novo padrão que
será armazenado no gameta. Esse padrão pode ter características oriundas das
células-mãe, herdando características durante o processo.
21/09/2023, 11:50 Controle da expressão gênica
Saiba mais
Utilizando irmãos gêmeos univitelinos, um estudo com camundongos realizado por Waterland e Jirtle em
2010 mostrou que eles continham o mesmo material genético. Foi feito um experimento separando os dois
irmãos: um deles recebia lambidas e era limpo pela mãe, enquanto o outro ficava isolado, sem contato com
ela. Houve diferenças bastante significativas quando ambos se tornaram adultos. Foi observada uma
metilação do gene ASIP no camundongo sem afeto: ele desenvolvia uma pelugem com uma cor diferente,
mais amarelada, tinha mais propensão a desenvolver obesidade e era mais suscetíveis a doenças genéricas.
Todas essas questões intrigam a comunidade científica. Por conta disso, foram
realizados estudos em humanos a partir de uma das maiores catástrofes já ocorridas
na nossa história. O holocausto vivido na Segunda Guerra Mundial (1939-1945) deixou
marcas visíveis e invisíveis naqueles que sofreram o terror nazista, bem como em
seus filhos e netos.
21/09/2023, 11:50 Controle da expressão gênica
A compreensão do TTT trouxe avanços para a vida de muitas crianças e adultos que
vivenciaram eventos traumáticos, possibilitando o diagnóstico precoce e o tratamento
de sequelas pós-traumáticas como uma forma de medicina epigenética.
Atenção!
21/09/2023, 11:50 Controle da expressão gênica
Os mecanismos epigenéticos são maleáveis e podem ser alterados ao longo da vida, dependendo de fatores
químicos e socioambientais que oferecem perspectivas terapêuticas promissoras.
Pessoas que sofrem de fome no início da vida têm menor risco de desenvolver
câncer colorretal.
Crianças que sofreram traumas frequentemente desenvolvem depressão quando
adultos devido a hipermetilação do gene NR3C1 (responsável pela expressão de
receptores ligados ao estresse).
Associações de metilação de DNA, que formam ilhas CpG em determinadas
regiões, são associadas à maior prevalência de diabetes tipo 2 e de obesidade
na população árabe.
Questão 1
Questão 2
Considerações finais
21/09/2023, 11:50 Controle da expressão gênica
headset Podcast
Para encerrar, ouça sobre o papel das regiões promotoras na expressão gênica.
21/09/2023, 11:50 Controle da expressão gênica
Explore +
Pesquise no YouTube o vídeo Epigenética – a regulação da vida e veja como Samuel
Cunha aborda o conceito de epigenética.
Referências
AL MUFTAH, W. A. et al. Epigenetic associations of type 2 diabetes and BMI in an arab
population. Clinical epigenetics. v. 8. n. 1. 2016.
AMBROS, V. The functions of animal microRNAs. Nature. v. 431. n. 7006. 2004. p. 350-
355.
GANJU, A. et al. miRNA nanotherapeutics for cancer. Drug discovery today. v. 22. n. 2.
2017. p. 424-432.
HICKMAN, A. B.; DYDA, F. Mechanisms of DNA transposition. Mobile DNA III. 2015. p.
529-553.
MELAS, P. A. et al. Genetic and epigenetic associations of MAOA and NR3C1 with
depression and childhood adversities. International journal of
neuropsychopharmacology. v. 16. n. 7. 2013. p. 1513-1528.
MERINO, E.; JENSEN, R. A.; YANOFSKY, C. Evolution of bacterial TRP operons and their
regulation. Current opinion in microbiology. v. 11. n. 2. 2008. p. 78-86.
Download material
21/09/2023, 11:50 Controle da expressão gênica