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Resumo - Capítulo 4 Albertis

O DNA é uma molécula de dupla hélice composta por nucleotídeos que armazenam informação genética, com a estrutura permitindo replicação e expressão gênica. Os cromossomos eucarióticos organizam o DNA em uma forma compacta, essencial para a hereditariedade e regulação gênica. O genoma humano contém 3,2 bilhões de pares de nucleotídeos, com apenas 1,5% codificando proteínas, e é crucial para a diversidade biológica entre organismos.
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Resumo - Capítulo 4 Albertis

O DNA é uma molécula de dupla hélice composta por nucleotídeos que armazenam informação genética, com a estrutura permitindo replicação e expressão gênica. Os cromossomos eucarióticos organizam o DNA em uma forma compacta, essencial para a hereditariedade e regulação gênica. O genoma humano contém 3,2 bilhões de pares de nucleotídeos, com apenas 1,5% codificando proteínas, e é crucial para a diversidade biológica entre organismos.
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​1​

​MECANISMOS GENÉTICOS BÁSICOS​

​CAPÍTULO 4 DNA, cromossomos e genomas​


​ESTRUTURA E FUNÇÃO DO DNA​
​ DNA é um​​longo polímero​​composto por quatro tipos​​de subunidades quimicamente​
O
​semelhantes. Estudos de difração de raios X revelaram que o DNA é formado por​​duas fitas​
​de um polímero enroladas como uma hélice​​, uma observação​​crucial para o modelo de​
​Watson e Crick, que elucida seu potencial de replicação e armazenamento de informação​
​genética.​

​●​ ​A molécula de DNA consiste em duas cadeias de nucleotídeos complementares​​.​


​○​ ​Cada cadeia é uma​​fita de DNA​​, composta por quatro​​tipos de​​subunidades​
​nucleotídicas​​.​
​○​ ​As cadeias são​​antiparalelas​​entre si.​
​○​ ​São unidas por​​ligações de hidrogênio​​entre as porções​​de​​base​​dos​
​nucleotídeos.​
​○​ ​Os​​nucleotídeos​​são formados por um​​açúcar de cinco​​carbonos​
​(desoxirribose)​​, um ou mais​​grupos fosfato​​e uma​​base​​nitrogenada​​.​
​○​ ​As quatro bases do DNA são​​adenina (A), citosina (C),​​guanina (G) e timina​
​(T)​​.​
​○​ ​Os nucleotídeos são ligados covalentemente por açúcares e fosfatos, formando​
​a​​cadeia principal de açúcar-fosfato​​.​
​○​ ​A sequência de bases (A, C, G, T) projeta-se da cadeia principal.​
​●​ ​A ligação dos nucleotídeos confere​​polaridade química​​à fita de DNA, com​
​extremidades distintas: uma​​extremidade 3’ (hidroxila)​​e uma​​extremidade 5’​
​(fosfato)​​. A cadeia de nucleotídeos é direcional e​​linear, permitindo a leitura da​
​informação como um texto.​
​●​ ​A​​estrutura tridimensional da dupla-hélice de DNA​​deriva das características​
​químicas e estruturais das cadeias polinucleotídicas.​
​○​ ​Todas as​​bases estão voltadas para o interior da dupla-hélice​​,​​enquanto a​
​cadeia principal de açúcar-fosfato está na região externa.​
​○​ ​As bases se pareiam de forma complementar:​​adenina​​(A) sempre com timina​
​(T)​​, e​​guanina (G) sempre com citosina (C)​​.​
​■​ ​Purinas (bases com dois anéis, A e G) pareiam com pirimidinas (bases​
​com um anel, T e C).​
​■​ ​Duas ligações de hidrogênio são formadas entre A e T, e três entre G e​
​C.​
​○​ ​Esse pareamento garante que cada par de bases tenha uma largura similar,​
​mantendo a estrutura uniforme ao longo da molécula.​
​○​ ​As duas cadeias principais de açúcar-fosfato enrolam-se uma sobre a outra,​
​formando uma​​dupla-hélice orientada à direita​​, completando​​uma volta a cada​
​10 pares de base.​
​2​

​○​ O ​ pareamento de bases complementares só é possível se as duas fitas da​


​hélice forem​​antiparalelas​​.​
​●​ ​A estrutura do DNA oferece um mecanismo claro para a​​hereditariedade​​.​
​○​ ​A informação genética é armazenada como um​​polímero​​linear de quatro tipos​
​de monômeros​​ordenados em uma sequência definida.​
​○​ ​A​​natureza helicoidal dupla​​do DNA permite a duplicação:​​cada fita de DNA​
​serve como​​molde​​para a síntese de uma nova fita complementar.​​Isso permite​
​que a informação genética seja fielmente copiada e transmitida às células​
​descendentes.​
​●​ ​Os organismos diferem uns dos outros por possuírem​​diferentes sequências de​
​nucleotídeos​​em suas moléculas de DNA, que carregam​​mensagens biológicas​
​distintas.​
​●​ ​Os​​genes codificam proteínas​​. As propriedades e a​​função biológica de uma proteína​
​são determinadas por sua​​estrutura tridimensional​​,​​que por sua vez é determinada​
​pela​​sequência linear de aminoácidos​​que a compõe.​​Portanto, a sequência linear de​
​nucleotídeos em um gene corresponde à sequência linear de aminoácidos em uma​
​proteína. O​​código genético​​(correspondência entre​​os quatro nucleotídeos do DNA e​
​os 20 aminoácidos) foi decifrado uma década após a descoberta da dupla-hélice. O​
​processo de​​expressão gênica​​converte a sequência​​nucleotídica do DNA em RNA e,​
​subsequentemente, em uma sequência de aminoácidos de uma proteína.​
​●​ ​O​​genoma​​é o conteúdo total da informação de um organismo,​​codificando todas as​
​moléculas de RNA e proteínas que ele pode sintetizar ao longo da vida. O genoma​
​humano possui​​3,2 bilhões de pares de nucleotídeos​​e inclui aproximadamente​​21​
​mil genes que codificam proteínas​​.​
​●​ ​Em eucariotos, quase todo o​​DNA está contido no núcleo​​celular​​, um compartimento​
​que ocupa cerca de 10% do volume celular. O núcleo é delimitado por um​​envelope​
​nuclear​​de duas membranas lipídicas concêntricas,​​perfuradas por​​poros nucleares​​. O​
​envelope nuclear é mecanicamente suportado por uma rede de filamentos​
​intermediários chamada​​lâmina nuclear​​. O envelope​​nuclear permite a concentração​
​de proteínas que atuam no DNA e mantém enzimas nucleares separadas das​
​citoplasmáticas, característica crucial para a função eucariótica.​

​ DNA CROMOSSÔMICO E SUA COMPACTAÇÃO NA FIBRA DE​


O
​CROMATINA​
​ função primordial do DNA é​​carregar os genes​​, que​​especificam todas as moléculas de RNA​
A
​e proteínas de um organismo, incluindo quando, onde e em que quantidade devem ser​
​produzidas. O DNA nuclear dos eucariotos é organizado em​​cromossomos​​.​

​●​ O ​ ​​empacotamento do DNA​​é um desafio considerável:​​os 2 metros de DNA de uma​


​célula humana devem ser compactados em um núcleo de apenas 6 µm de diâmetro.​
​Essa tarefa complexa é realizada por​​proteínas especializadas​​que se ligam ao DNA,​
​enrolando-o em uma série de espirais e alças ordenadas, evitando emaranhados.​
​Apesar da intensa compactação, o DNA permanece acessível para replicação, reparo e​
​expressão gênica.​
​●​ ​Cada​​cromossomo eucariótico​​consiste em uma única​​e enorme molécula de​​DNA​
​linear​​associada a proteínas que a enovelam e empacotam.​​Esse complexo de DNA e​
​3​

​ roteínas fortemente associadas é denominado​​cromatina​​. Além das proteínas de​


p
​compactação (histonas), os cromossomos estão associados a outras proteínas e​
​moléculas de RNA essenciais para a expressão gênica, replicação e reparo do DNA.​
​●​ ​Com exceção de gametas e alguns tipos celulares especializados, cada​​núcleo celular​
​humano​​contém​​duas cópias de cada cromossomo​​(uma​​herdada da mãe e outra do​
​pai), que são chamadas​​cromossomos homólogos​​. O único​​par de cromossomos não​
​homólogos é o dos cromossomos sexuais masculinos (X e Y). Uma célula humana​
​típica possui um total de​​46 cromossomos​​(22 pares​​autossômicos e dois​
​cromossomos sexuais).​
​●​ ​Os cromossomos humanos podem ser distinguidos individualmente pela​​coloração​
​com corantes fluorescentes​​em uma técnica baseada​​em hibridização de DNA​
​(cariotipagem espectral), que os identifica com cores diferentes. Essa coloração é mais​
​frequentemente realizada durante a​​mitose​​, quando​​os cromossomos estão mais​
​compactados e são facilmente visíveis. O arranjo ordenado do conjunto total de​
​cromossomos é chamado​​cariótipo​​.​
​●​ ​Anormalidades cromossômicas​​, como perda de partes​​ou trocas entre cromossomos​
​(translocações), podem ser detectadas por alterações no padrão de bandas ou​
​coloração, sendo úteis para identificar condições hereditárias e rearranjos em células​
​tumorais.​
​●​ ​Os​​cromossomos carregam os genes​​, que são as unidades​​funcionais da​
​hereditariedade. Um gene é um segmento de DNA que contém instruções para produzir​
​uma proteína ou uma molécula de RNA funcionalmente importante.​
​●​ ​Existe uma correlação entre a complexidade de um organismo e o​​número de genes​
​em seu genoma​​. Genomas de plantas e animais multicelulares​​contêm, além dos​
​genes, uma​​enorme quantidade de DNA intercalante​​com​​função ainda pouco​
​conhecida. Parte desse DNA extra é essencial para a expressão gênica adequada e​
​pode explicar sua abundância em organismos multicelulares, cujos genes precisam ser​
​regulados complexamente durante o desenvolvimento.​
​●​ ​A​​variação no tamanho dos genomas​​entre espécies é​​muito mais explicada pelas​
​diferenças na quantidade de​​DNA intercalante​​(DNA​​não codificador) do que pelas​
​diferenças no número de genes. Por exemplo, o genoma humano é 200 vezes maior​
​que o da levedura, mas 30 vezes menor que o de algumas plantas.​
​●​ ​A​​sequência nucleotídica do genoma humano​​(publicada​​em 2004) revelou a​
​organização dos genes. Apenas cerca de​​1,5% do genoma​​humano codifica​
​proteínas​​. Quase metade do DNA cromossômico é composta​​por​​segmentos de DNA​
​móveis (elementos transponíveis)​​.​
​●​ ​O​​tamanho médio dos genes que codificam proteínas​​em humanos é de 27 mil​
​pares de nucleotídeos​​, sendo que uma proteína de tamanho​​médio requer apenas​
​cerca de 1.300 pares de nucleotídeos. A maior parte da sequência restante no gene​
​consiste em​​segmentos de DNA não codificador que interrompem​​as sequências​
​codificadoras, chamados íntrons​​. As sequências codificadoras​​são denominadas​
​éxons​​. A maioria dos genes humanos é formada por uma​​longa sequência alternada de​
​éxons e íntrons, com os íntrons constituindo a maior parte. Em contraste, a maioria dos​
​genes de organismos com genomas compactos não possui íntrons.​
​●​ ​Cada gene está associado a​​sequências de DNA regulador​​,​​que garantem que o gene​
​seja ativado e desativado no devido tempo, expresso no nível adequado e apenas em​
​determinados tipos celulares. Em humanos, essas sequências reguladoras estão​
​distribuídas por milhares de pares de nucleotídeos.​
​4​

​●​ O ​ genoma humano também contém milhares de​​genes que codificam moléculas de​
​RNA que não produzem proteínas​​, mas que desempenham​​diversas funções​
​importantes.​
​●​ ​Para formar um​​cromossomo funcional​​, uma molécula​​de DNA deve ser capaz de se​
​replicar, e as cópias replicadas devem ser separadas e fielmente divididas entre as​
​células-filhas a cada divisão celular. Esse processo ocorre no​​ciclo celular​​.​
​●​ ​Durante a​​interfase​​, os genes são expressos, e os​​cromossomos são replicados,​
​mantendo as duas réplicas unidas como​​cromátides-irmãs​​.​​Nessa fase, os​
​cromossomos estão estendidos. Durante a​​mitose​​, os​​cromossomos se condensam,​
​permitindo a separação das cromátides-irmãs. Os cromossomos altamente​
​condensados em células em divisão são chamados​​cromossomos​​mitóticos​​.​
​●​ ​Um cromossomo funcional precisa de três tipos de sequências nucleotídicas​
​especializadas no DNA, que controlam a replicação e segregação:​
​1.​ ​Origens de replicação do DNA​​: Locais onde a duplicação​​do DNA é iniciada.​
​Cromossomos eucarióticos possuem muitas origens para garantir replicação​
​rápida.​
​2.​ ​Centrômero​​: Sequência de DNA que permite que uma cópia​​de cada​
​cromossomo duplicado seja levada a cada célula-filha. Um​​cinetocoro​
​(complexo proteico) se forma no centrômero, ligando o fuso mitótico aos​
​cromossomos duplicados. O centrômero também mantém as cromátides-irmãs​
​unidas até a segregação.​
​3.​ ​Telômeros​​: Extremidades dos cromossomos, contêm sequências​​nucleotídicas​
​repetidas que permitem replicação eficiente das extremidades e formam​
​estruturas que evitam que sejam confundidas com DNA danificado.​
​●​ ​Em eucariotos mais complexos, as sequências de DNA que formam os centrômeros e​
​as origens de replicação são muito mais longas do que em organismos simples como​
​leveduras. Um centrômero humano, por exemplo, pode ter até 1 milhão de pares de​
​nucleotídeos e é definido por uma grande estrutura de ácidos nucleicos e proteínas que​
​pode ser herdada, em vez de uma sequência de DNA específica.​
​●​ ​As moléculas de DNA estão​​extremamente condensadas​​nos cromossomos​​. O​
​cromossomo 22 humano, por exemplo, tem 48 milhões de pares de nucleotídeos, que​
​estendidos teriam 1,5 cm, mas na mitose mede apenas 2 µm, representando uma​
​compactação de cerca de 7 mil vezes. Isso é alcançado por proteínas que enrolam e​
​enovelam o DNA em níveis crescentes de organização. O DNA dos cromossomos​
​interfásicos, embora menos condensado que os mitóticos, ainda é fortemente​
​compactado.​
​●​ ​A​​estrutura cromossômica é dinâmica​​. Regiões específicas​​dos cromossomos de​
​interfase se​​descondensam​​para permitir o acesso a​​sequências de DNA para​
​expressão gênica, reparo e replicação, e então se​​recondensam​​. O empacotamento​
​deve permitir acesso rápido e localizado ao DNA conforme necessário.​
​●​ ​As proteínas que se ligam ao DNA para formar os cromossomos eucarióticos são​
​divididas em duas classes:​​histonas​​e​​proteínas cromossômicas​​não histonas​​. O​
​complexo dessas proteínas com o DNA é a​​cromatina​​.​​Em termos de massa, um​
​cromossomo é aproximadamente um terço DNA e dois terços proteína.​
​●​ ​As​​histonas​​são responsáveis pelo primeiro e mais​​básico nível de organização​
​cromossômica: o​​nucleossomo​​. A cromatina, quando parcialmente​​desenrolada,​
​aparece como "contas em um colar", onde cada "conta" é uma​​partícula do cerne do​
​nucleossomo​​, que consiste em DNA enrolado em um núcleo​​de histonas.​
​5​

​●​ C ​ ada​​partícula do cerne do nucleossomo​​é um complexo de​​oito proteínas histonas​


​(duas moléculas de H2A, H2B, H3 e H4) e uma fita dupla de DNA de 147 nucleotídeos​
​de comprimento. O octâmero de histonas forma um cerne proteico ao redor do qual a​
​fita dupla de DNA é enrolada.​
​●​ ​O comprimento da região de​​DNA de ligação​​que separa​​um cerne de nucleossomo do​
​próximo pode variar. Em média, os nucleossomos se repetem a cada 200 pares de​
​nucleotídeos. A formação do nucleossomo compacta a molécula de DNA em uma fita​
​de cromatina com aproximadamente um terço de seu comprimento inicial.​
​●​ ​A​​estrutura em alta resolução da partícula do cerne​​do nucleossomo​​(elucidada em​
​1997) mostra um cerne de histonas em forma de disco ao redor do qual o DNA se​
​enrola 1,7 vezes para a esquerda. As quatro histonas do cerne são pequenas e​
​apresentam um motivo estrutural comum chamado​​enovelamento​​de histonas​​.​
​●​ ​A interface entre o DNA e a histona é extensa, com cerca de 142​​ligações de​
​hidrogênio​​e numerosas interações hidrofóbicas e pontes​​salinas. Mais de um quinto​
​dos aminoácidos das histonas são lisina ou arginina (básicas, carregadas​
​positivamente), que neutralizam a carga negativa da cadeia principal fosfodiéster do​
​DNA. Isso explica a capacidade das histonas de se ligarem a praticamente qualquer​
​sequência de DNA.​
​●​ ​Além do enovelamento, cada histona do cerne possui uma​​"cauda" N-terminal de​
​aminoácidos​​que se projeta para fora do cerne histona-DNA.​​Essas caudas são​
​sujeitas a diferentes tipos de​​modificações covalentes​​que controlam aspectos críticos​
​da estrutura e função da cromatina.​
​●​ ​As histonas são proteínas eucarióticas altamente conservadas evolutivamente,​
​sugerindo que quase todos os seus aminoácidos são essenciais para sua função.​
​Muitos organismos eucarióticos também produzem pequenas quantidades de​​variantes​
​de histonas especializadas​​, que diferem das histonas​​principais em sequência e,​
​combinadas com modificações covalentes, criam grande diversidade de estruturas da​
​cromatina.​
​●​ ​Os nucleossomos possuem uma​​estrutura dinâmica​​. O​​DNA em um nucleossomo​
​isolado se desenrola espontaneamente de suas extremidades a uma taxa de cerca de​
​quatro vezes por segundo, permanecendo exposto por 10 a 50 milissegundos antes de​
​se fechar novamente, tornando-o disponível para ligação com outras proteínas.​
​●​ ​Complexos de remodelagem da cromatina dependentes de ATP​​são essenciais​
​para um "afrouxamento" adicional dos contatos entre DNA e histonas. Esses complexos​
​contêm uma subunidade ATPase que hidrolisa ATP para deslocar o DNA do cerne,​
​alterando temporariamente a estrutura do nucleossomo. Eles podem catalisar o​
​deslizamento dos nucleossomos​​, reposicionando-os para​​expor regiões específicas​
​do DNA e torná-las acessíveis a outras proteínas. Além disso, em cooperação com​
​chaperonas de histonas​​, alguns complexos podem remover​​dímeros de histonas​
​(H2A-H2B) ou o octâmero completo do cerne, permitindo a troca de histonas.​
​●​ ​As células possuem dezenas de complexos de remodelagem da cromatina​
​dependentes de ATP, cada um especializado em diferentes funções. Sua atividade é​
​cuidadosamente controlada, sendo direcionados a regiões específicas do DNA para​
​influenciar localmente a estrutura da cromatina.​
​●​ ​A posição exata de um nucleossomo ao longo de um segmento de DNA depende​
​principalmente da presença de outras proteínas fortemente associadas ao DNA, que​
​podem favorecer ou impedir a formação de nucleossomos adjacentes. O arranjo dos​
​nucleossomos no DNA é altamente dinâmico, adaptando-se rapidamente às​
​6​

​ ecessidades da célula devido à ação desses complexos de remodelagem.​


n
​●​ ​Os nucleossomos são geralmente condensados para formar uma​​fibra de cromatina​
​compacta​​, tipicamente com 30 nm de diâmetro.​
​ ​ ​Um​​modelo de zigue-zague​​é proposto para o empilhamento​​dos nucleossomos em​

​uma fibra de 30 nm, embora a estrutura real seja menos regular em muitas regiões da​
​cromatina.​
​●​ ​O forte empilhamento entre os nucleossomos é mediado por​​ligações​
​nucleossomo-nucleossomo​​que envolvem as​​caudas das​​histonas​​(especialmente a​
​cauda da H4) e a presença da​​histona H1​​. A histona​​H1 liga-se a cada nucleossomo,​
​fazendo contato com o DNA e a proteína, e alterando a direção do DNA ao sair do​
​nucleossomo, o que auxilia na compactação.​

​ESTRUTURA E FUNÇÃO DA CROMATINA​


​ sta seção abordará os mecanismos que geram as diversas estruturas da cromatina em​
E
​diferentes regiões do genoma. Alguns tipos de estrutura da cromatina podem ser​​herdados​​,​
​caracterizando uma forma de​​herança epigenética​​, que​​se baseia na estrutura da cromatina e​
​não em alterações da sequência de DNA. Essa herança se "sobrepõe" à herança genética​
​baseada no DNA.​

​●​ A ​ ​​herança epigenética​​desempenha uma função crucial​​na regulação da expressão​


​gênica. Serão detalhadas as​​modificações covalentes​​das histonas​​nos​
​nucleossomos, que atuam como sítios de reconhecimento para domínios proteicos que​
​se ligam a complexos específicos da cromatina. Assim, a estrutura da cromatina​
​influencia a expressão gênica e outros processos relacionados ao DNA, sendo vital para​
​o desenvolvimento, crescimento e manutenção de organismos eucarióticos.​
​●​ ​No núcleo interfásico de eucariotos superiores, distinguem-se dois tipos de cromatina: a​
​heterocromatina​​(forma altamente condensada) e a​​eucromatina​​(forma menos​
​condensada). A heterocromatina é uma forma compacta especial, grandemente​
​concentrada em​​centrômeros e telômeros​​, mas também​​em outros locais dos​
​cromossomos, variando com o estado fisiológico da célula. Em uma célula de mamífero​
​típica, mais de 10% do genoma está empacotado como heterocromatina.​
​●​ ​O DNA na heterocromatina contém poucos genes; quando regiões de eucromatina são​
​convertidas em heterocromatina, seus genes são geralmente​​desligados​​. A​
​heterocromatina não deve ser vista como "DNA morto", mas como domínios compactos​
​de cromatina que são anormalmente resistentes à expressão gênica.​
​●​ ​O estado da heterocromatina é​​autopropagável​​. A translocação​​de um segmento​
​eucromático para perto da heterocromatina pode causar o​​silenciamento (inativação)​
​de genes normalmente ativos, um fenômeno chamado​​efeito​​posicional​​. Esse efeito,​
​observado em Drosophila, leveduras, plantas e humanos, reflete a propagação do​
​estado de heterocromatina.​
​●​ ​O​​efeito posicional variegado​​demonstra que, uma vez​​estabelecida em um segmento​
​de cromatina, a condição de heterocromatina tende a ser herdada de forma estável pela​
​descendência da célula. Isso é análogo à inativação aleatória de um dos dois​
​cromossomos X em fêmeas de mamíferos, onde o cromossomo X inativado é mantido​
​em todas as células-filhas, formando um mosaico.​
​●​ ​Essa observação de "heterocromatina gera mais heterocromatina" sugere um​
​mecanismo de feedback positivo​​que propaga o estado​​de heterocromatina tanto no​
​7​

​ spaço (pelo cromossomo) quanto no tempo (entre gerações).​


e
​●​ ​Rastreamentos genéticos identificaram mais de cem genes cujos produtos aumentam​
​ou reduzem a propagação da heterocromatina. Muitos desses genes codificam​
​proteínas cromossômicas não histonas​​que interagem​​com histonas e estão​
​envolvidas na modificação ou manutenção da estrutura da cromatina.​
​●​ ​As​​cadeias laterais dos aminoácidos das quatro histonas​​do cerne do​
​nucleossomo​​estão sujeitas a uma vasta gama de​​modificações​​covalentes​​,​
​incluindo​​acetilação de lisinas, mono-, di- e trimetilação​​de lisinas e fosforilação de​
​serinas​​. Muitas dessas modificações ocorrem nas​​caudas​​N-terminais das histonas​​,​
​que se projetam para fora do nucleossomo. Existem mais de 20 modificações​
​específicas que também ocorrem no cerne globular do nucleossomo.​
​●​ ​Todas essas modificações são​​reversíveis​​, com enzimas​​específicas que as adicionam​
​(ex:​​histonas acetiltransferases (HATs)​​,​​metiltransferases​​de histonas​​) e outras que​
​as removem (ex:​​histonas desacetilases (HDACs)​​,​​demetilases​​de histonas​​). Essas​
​enzimas são recrutadas a sítios específicos da cromatina por​​proteínas reguladoras​
​da transcrição​​(fatores de transcrição). A sequência​​de DNA, em última análise,​
​determina como as histonas são modificadas. As modificações covalentes nos​
​nucleossomos podem persistir por um longo tempo após o desaparecimento dos fatores​
​de transcrição que as induziram, proporcionando uma​​memória​​à célula que pode ser​
​transmitida entre gerações celulares.​
​●​ ​Diferentes padrões de modificações covalentes são observados em grupos de​
​nucleossomos, dependendo de sua posição no genoma e da história da célula. A​
​acetilação de lisinas​​nas caudas N-terminais relaxa​​a estrutura da cromatina, em parte​
​por remover a carga positiva da lisina e reduzir a afinidade das caudas aos​
​nucleossomos adjacentes. O efeito mais significativo das modificações de histonas é a​
​sua capacidade de​​recrutar outras proteínas específicas​​para o segmento de​
​cromatina modificado. Por exemplo, a​​trimetilação​​de uma lisina específica na cauda​
​da histona H3 atrai a proteína HP1​​, que é específica​​da heterocromatina, contribuindo​
​para o estabelecimento e propagação da heterocromatina.​
​●​ ​Além das quatro histonas-padrão do cerne, os eucariotos contêm um pequeno conjunto​
​de​​variantes de histonas​​que podem formar nucleossomos.​​Essas variantes são​
​inseridas na cromatina já formada, principalmente durante a interfase, por um processo​
​de troca catalisado por complexos de remodelagem dependentes de ATP e chaperonas​
​de histonas.​
​●​ ​Modificações covalentes e variantes de histonas atuam em conjunto para​
​controlar as funções dos cromossomos​​. Embora haja​​um vasto potencial de​
​diversidade nas marcações e variantes, as modificações de histonas ocorrem em​
​grupos coordenados.​
​●​ ​Algumas combinações de modificações de histonas têm um significado específico na​
​célula, determinando como o DNA compactado nos nucleossomos será acessado ou​
​manipulado, dando origem à ideia de um​​"código de​​histonas"​​. Diferentes marcas​
​podem indicar, por exemplo, replicação recente, dano ao DNA que requer reparo, ou o​
​momento e modo da expressão gênica. Várias​​proteínas​​reguladoras contêm​
​pequenos domínios que se ligam a essas marcas específicas​​,​​como uma lisina​
​trimetilada na posição 4 da histona H3. Esses domínios frequentemente operam como​
​módulos em grandes proteínas ou complexos proteicos que reconhecem combinações​
​específicas de modificações nas histonas. O resultado é um​​complexo de leitura​​que​
​atrai outras proteínas para executar uma função biológica específica no momento certo.​
​8​

​●​ A ​ s marcas nos nucleossomos são​​dinâmicas​​, sendo constantemente removidas e​


​adicionadas a velocidades que dependem da localização cromossômica. As caudas das​
​histonas, que se projetam para fora do cerne nucleossômico, são acessíveis e podem​
​ser prontamente alteradas de acordo com as necessidades da célula.​
​●​ ​Um​​complexo de proteínas de leitura e escrita (marcação)​​pode propagar​
​modificações específicas da cromatina ao longo do cromossomo. Enzimas que​
​adicionam modificações de histonas (enzimas de "escrita") podem ser inicialmente​
​recrutadas por proteínas de ligação ao DNA específicas da sequência. Após a enzima​
​de escrita criar sua marca em um ou alguns nucleossomos adjacentes, uma "proteína​
​de leitura" no mesmo complexo reconhece e se liga firmemente ao nucleossomo​
​recém-modificado. Essa ligação ativa a enzima de escrita, posicionando-a próxima ao​
​nucleossomo adjacente. Através de ciclos repetidos de escrita e leitura, a proteína de​
​leitura pode carregar a enzima de escrita ao longo do DNA, espalhando a marca pelo​
​cromossomo.​
​●​ ​Esse processo é complexo, envolvendo complexos proteicos que podem conter​
​diversas proteínas de leitura e escrita, e exigir várias marcas nos nucleossomos para​
​sua propagação. Muitos desses complexos também contêm uma proteína de​
​remodelagem da cromatina dependente de ATP, que pode atuar em conjunto para​
​condensar ou descondensar longos segmentos de cromatina.​
​●​ ​Um processo semelhante é usado para a remoção de modificações de histonas, onde​
​uma "enzima de remoção" (como uma histona demetilase ou desacetilase) é recrutada.​
​●​ ​Sequências de DNA de barreira bloqueiam a propagação dos complexos de leitura​
​e escrita​​, separando domínios de cromatina adjacentes​​com diferentes estruturas e​
​funções. Essas sequências indicam os limites dos domínios. Por exemplo, a sequência​
​HS4 separa o domínio de cromatina ativa do lócus da b-globina humana de uma região​
​adjacente silenciada. Sua remoção resulta no silenciamento de genes e um efeito​
​posicional variegado. As barreiras contêm sítios de ligação para​​enzimas acetilases de​
​histonas​​, que acetilam lisinas e, assim, competem​​com a metilação (necessária para a​
​propagação da heterocromatina).​
​●​ ​A​​cromatina nos centrômeros​​ilustra como as variantes​​de histonas podem criar​
​estruturas especiais. Nucleossomos com variantes de histonas parecem produzir​
​marcas na cromatina de duração excepcionalmente longa. No centrômero, a região do​
​cromossomo essencial para a ligação ao fuso mitótico e a segregação das cópias do​
​genoma, há uma​​variante de histona H3 específica do​​centrômero, conhecida​
​como CENP-A​​.​
​●​ ​Centrômeros em organismos complexos são consideravelmente maiores do que em​
​leveduras e, embora contenham CENP-A, não parecem conter uma sequência de DNA​
​específica do centrômero. Eles consistem em sequências repetidas de DNA (DNA​
​satélite alfa em humanos), mas essas sequências também são encontradas em outras​
​posições não centroméricas. Isso indica que os​​centrômeros​​de organismos​
​complexos são definidos por um conjunto de proteínas, em vez de uma sequência​
​específica de DNA​​. A formação espontânea de novos​​centrômeros (neocentrômeros)​
​em cromossomos fragmentados, mesmo em regiões sem DNA satélite alfa, apoia essa​
​plasticidade.​
​●​ ​A inativação de centrômeros excessivos ou a formação de novos foram essenciais na​
​evolução para garantir que cada cromossomo contenha um e apenas um centrômero.​
​●​ ​Algumas estruturas da cromatina podem ser​​herdadas​​diretamente​​. A formação de um​
​centrômero requer um evento inicial de "semeadura" envolvendo nucleossomos com a​
​9​

​ ariante CENP-A. A presença de CENP-A em um nucleossomo herdado pode recrutar​


v
​seletivamente mais histonas CENP-A para nucleossomos recém-formados adjacentes,​
​assegurando que um novo centrômero seja produzido no mesmo local em ambos os​
​cromossomos-filhos após cada ciclo de divisão celular.​
​●​ ​A formação e manutenção dos centrômeros e de algumas regiões de heterocromatina​
​são processos altamente cooperativos, propagando-se de uma semente inicial de​
​maneira similar ao efeito posicional variegado. Esse recrutamento cooperativo de​
​proteínas, juntamente com a ação dos complexos de escrita e leitura, é responsável​
​pela propagação de formas específicas de cromatina no espaço e através das gerações​
​celulares.​
​●​ ​A​​herança epigenética​​é crucial na formação de organismos​​multicelulares, pois os​
​tipos celulares diferenciados são mantidos após repetidos ciclos de divisão celular. A​
​estrutura da cromatina desempenha um papel importante nessa transmissão​
​epigenética.​
​●​ ​Experimentos com embriões de rã sugerem que estruturas de cromatina de ativação e​
​repressão podem ser herdadas epigeneticamente. A dificuldade de reprogramar núcleos​
​de células diferenciadas em óvulos enucleados, especialmente de animais mais velhos,​
​deve-se, em parte, à manutenção e transmissão de​​estruturas​​específicas da​
​cromatina​​, resultando em expressão gênica inadequada.​​Isso demonstra que um​
​estado herdado da cromatina fundamenta a​​memória epigenética​​.​
​●​ ​O empacotamento do DNA em nucleossomos foi fundamental para a evolução dos​
​eucariotos, permitindo a especialização celular através da regulação de genes.​
​Variações locais na estrutura da cromatina, exclusivas de eucariotos, permitem que​
​genes permaneçam ativados ou desativados em estados estáveis. Isso inclui a​
​cromatina centromérica e a heterocromatina clássica (com proteína HP1), que​
​persistem de forma estável, e formas mais transitórias de cromatina condensada.​

​A ESTRUTURA GLOBAL DOS CROMOSSOMOS​


​ urante a interfase, os cromossomos estão geralmente descondensados, dificultando a​
D
​visualização de detalhes estruturais. No entanto, presume-se um nível superior de​
​enovelamento, mesmo nesses cromossomos interfásicos, envolvendo o enrolamento da​
​cromatina em uma série de alças e espirais. A estrutura da cromatina interfásica é fluida e​
​muda em resposta às necessidades da célula.​

​●​ E ​ studos de​​cromossomos plumosos​​(lampbrush) em oócitos​​de anfíbios, que são​


​excepcionalmente grandes e estendidos, revelaram que os cromossomos são​
​organizados em uma série de​​grandes alças de cromatina​​que se projetam de um eixo​
​cromossômico linear. A maioria dos genes presentes nessas alças está sendo​
​expressa, enquanto a maior parte do DNA permanece condensada no eixo do​
​cromossomo e não é expressa.​
​●​ ​Acredita-se que os cromossomos de interfase de todos os eucariotos sejam​
​organizados em alças de maneira similar. Tecnologias modernas de DNA, como a​
​captura de conformação cromossômica (3C)​​, permitem​​inferir a presença dessas​
​alças, que podem ter de 50 mil a 200 mil pares de nucleotídeos, ou até 1 milhão.​
​●​ ​Os​​cromossomos politênicos​​de moscas (como a Drosophila),​​encontrados em​
​células poliploides gigantes com centenas de milhares de cópias do genoma alinhadas,​
​proporcionaram uma visualização detalhada de estruturas de cromatina.​
​10​

​●​ N ​ os cromossomos politênicos, observam-se​​bandas escuras e regiões interbandas​


​claras​​alternadas. As bandas contêm cromatina mais​​condensada e maior​
​concentração de proteínas, enquanto as interbandas contêm cromatina menos​
​condensada. Esse padrão de bandas se assemelha à organização em alças observada​
​nos cromossomos plumosos.​
​●​ ​Os cromossomos de interfase podem ser considerados um​​mosaico de estruturas de​
​cromatina​​, cada uma com modificações específicas nos​​nucleossomos e associada a​
​um conjunto particular de proteínas não histonas. O recrutamento dessas proteínas​
​pode se propagar por longas distâncias no DNA, transmitindo uma estrutura de​
​cromatina similar a grandes regiões do genoma, que são separadas por proteínas de​
​barreira.​
​●​ ​Análises em Drosophila identificaram​​múltiplas formas​​de cromatina​​, incluindo três​
​tipos principais de cromatina repressora e dois tipos em genes de transcrição ativa,​
​cada um associado a diferentes complexos de proteínas não histonas. A​
​heterocromatina clássica, por exemplo, contém a proteína HP1.​
​●​ ​As​​alças de cromatina se descondensam quando os genes​​nelas contidos são​
​expressos​​. Nos cromossomos politênicos, isso se manifesta​​como "puffs"​
​cromossômicos, que resultam da descondensação de uma única banda cromossômica.​
​A cromatina descondensada dentro de um puff sintetiza ativamente RNA.​
​●​ ​Observações em células humanas também indicam que alças de cromatina dobradas​
​se expandem e ocupam um volume maior quando um gene é expresso. Regiões​
​cromossômicas quiescentes aparecem como pontos compactos, mas ao expressar​
​seus genes, transformam-se em estruturas alongadas.​
​●​ ​Cada um dos 46 cromossomos de interfase em uma célula humana tende a ocupar seu​
​próprio território discreto​​dentro do núcleo, sem​​emaranhamento extensivo. Regiões​
​heterocromáticas estão intimamente associadas à lâmina nuclear, e regiões ricas em​
​genes parecem ausentes próximas ao envelope nuclear.​
​●​ ​A maior parte da cromatina nos cromossomos interfásicos, quando seus genes não​
​estão sendo expressos, está condensada em uma conformação de​​glóbulo fractal​​.​
​Este arranjo não emaranhado promove a máxima densidade de compactação e, ao​
​mesmo tempo, preserva a capacidade da fibra de cromatina de ser descondensada e​
​condensada facilmente.​
​●​ ​A​​posição de um gene dentro do núcleo é alterada quando​​este é altamente​
​expresso​​. Uma região ativamente transcrita pode se​​mover para fora de seu território​
​cromossômico, expandindo-se como uma alça. Esse movimento pode ser facilitado pela​
​reunião de proteínas necessárias para a transcrição em regiões nucleares específicas.​
​●​ ​O núcleo é altamente heterogêneo, contendo​​regiões​​funcionais distintas​
​(subcompartimentos nucleares)​​para onde determinados​​segmentos de​
​cromossomos podem se mover para diferentes processos bioquímicos. O​​nucléolo​​é o​
​maior e mais evidente subcompartimento, sendo o local da formação das subunidades​
​ribossômicas e de outras reações especializadas. Outras organelas nucleares incluem​
​os​​corpos de Cajal​​e os​​aglomerados de grânulos de​​intercromatina​​.​
​●​ ​Esses subcompartimentos são compostos por redes de RNAs e proteínas que se​
​associam, formando​​redes altamente permeáveis​​a outras​​macromoléculas, criando​
​ambientes bioquímicos distintos. Eles otimizam as reações complexas por meio de​
​compartimentalização, mas, por não possuírem membrana de bicamada lipídica, não​
​podem concentrar ou excluir pequenas moléculas específicas.​
​●​ ​A célula constrói esses ambientes para realizar tarefas bioquímicas complexas de forma​
​11​

​ ficiente, como a expressão gênica. Eles são formados apenas quando necessário,​
e
​criando altas concentrações locais de enzimas e RNAs. Exemplos incluem "fábricas de​
​reparo" que se formam quando o DNA é danificado.​
​●​ ​Cromossomos mitóticos são especialmente supercondensados​​.​​Durante a mitose,​
​os cromossomos se tornam visíveis ao microscópio óptico, formando estruturas​
​altamente condensadas. Essa condensação reduz o comprimento de um cromossomo​
​interfásico em aproximadamente dez vezes, resultando em uma drástica mudança de​
​aparência.​
​●​ ​Um cromossomo mitótico típico no estágio de metáfase é composto por​​duas​
​cromátides-irmãs​​(moléculas de DNA replicadas) unidas​​pelos centrômeros. Cada​
​cromátide pode ser visualizada como​​alças organizadas​​de cromatina​​que emanam​
​de uma estrutura central. A ordem das características visíveis ao longo de um​
​cromossomo mitótico reflete grosseiramente a ordem dos genes na molécula de DNA. A​
​condensação dos cromossomos mitóticos é o nível final da hierarquia de compactação​
​cromossômica.​
​●​ ​A compactação dos cromossomos na mitose é um processo altamente organizado e​
​dinâmico, que serve a dois propósitos principais:​
​1.​ ​Desemaranhar as cromátides-irmãs​​e dispô-las lado​​a lado para facilitar a​
​separação pela maquinaria mitótica.​
​2.​ ​Proteger as moléculas de DNA​​, que são relativamente​​frágeis, de quebras​
​durante a separação entre as células-filhas.​
​●​ ​A condensação dos cromossomos da interfase para os mitóticos começa no início da​
​fase M e está intimamente ligada à progressão do ciclo celular. Durante a fase M, a​
​expressão gênica é suspensa, e ocorrem modificações específicas nas histonas que​
​auxiliam na reorganização e compactação da cromatina. Duas classes de proteínas em​
​forma de anel, chamadas​​coesinas e condensinas​​, auxiliam​​nesse enovelamento.​

​COMO OS GENOMAS EVOLUEM​


​ sequenciamento de genomas está revolucionando a compreensão da evolução, fornecendo​
O
​insights sobre o parentesco entre organismos e os mecanismos moleculares que​
​impulsionaram a evolução.​

​●​ G ​ enes com funções semelhantes são encontrados em uma vasta gama de formas​
​de vida​​, e suas sequências nucleotídicas exibem um​​alto grau de conservação.​​Genes​
​homólogos​​, que são semelhantes em sequência e função​​devido a um ancestral​
​comum, são frequentemente reconhecíveis mesmo através de grandes distâncias​
​filogenéticas. Homólogos de genes humanos podem ser encontrados em organismos​
​tão diversos quanto vermes, moscas, leveduras e bactérias, e a similaridade pode ser​
​tão acentuada que a porção codificadora de proteínas de um gene de levedura pode ser​
​substituída por seu homólogo humano.​
​●​ ​O reconhecimento de similaridades entre sequências é uma ferramenta importante para​
​associar genes a funções proteicas​​. Isso permite prever​​a função de genes humanos​
​para os quais não há informação bioquímica ou genética disponível, simplesmente​
​comparando suas sequências nucleotídicas com as de genes já caracterizados em​
​organismos mais estudados.​
​●​ ​A sequência de genes individuais é, em geral, mais fortemente conservada do que a​
​estrutura genômica completa. Características da organização dos genomas, como​
​12​

t​amanho, número de cromossomos, ordem dos genes, abundância e tamanho dos​


​íntrons, e quantidade de DNA repetitivo, variam consideravelmente entre organismos​
​distantes.​
​●​ ​Uma abordagem importante para decifrar o genoma humano é procurar​​sequências de​
​DNA muito semelhantes em diferentes espécies​​, partindo​​do princípio de que uma​
​sequência de DNA com função é mais provável de ser conservada do que uma sem​
​função. Por exemplo, humanos e camundongos divergiram há cerca de 80 milhões de​
​anos; as únicas regiões que permaneceram muito similares nos dois genomas são​
​aquelas onde mutações prejudicariam funções importantes e seriam eliminadas pela​
​seleção natural​​. Essas​​regiões conservadas​​incluem​​éxons codificadores de​
​proteínas, moléculas de RNA funcionalmente importantes, sequências reguladoras de​
​DNA e sequências com funções ainda desconhecidas. A maioria das regiões não​
​conservadas reflete DNA cuja sequência é menos crítica para a função.​
​●​ ​A comparação genômica de um grande número de espécies (incluindo ratos, galinhas,​
​peixes, cachorros, chimpanzés e humanos) revelou que cerca de​​5% do genoma​
​humano consiste em "sequências conservadas em multiespécies"​​.​​Destas, apenas​
​cerca de um terço codifica proteínas. O restante consiste em regiões de sítios de​
​ligação a proteínas envolvidas na regulação gênica e moléculas de RNA não traduzidas​
​com outras finalidades. A função da maioria dessas sequências altamente conservadas​
​permanece sem explicação, indicando que ainda há muito a aprender sobre a biologia​
​celular de vertebrados.​
​●​ ​As alterações no genoma são causadas por​​falhas nos​​mecanismos normais de​
​cópia e correção do DNA​​(erros na replicação, recombinação​​ou reparo) e pelo​
​movimento de​​elementos de DNA transponíveis​​. Os mecanismos​​de manutenção do​
​DNA são extremamente precisos, mas não perfeitos.​
​●​ ​Erros podem levar a​​mutações pontuais​​(substituição​​de um par de bases) ou a​
​rearranjos genômicos de larga escala​​(deleções, duplicações,​​inversões e​
​translocações de DNA entre cromossomos).​
​●​ ​Os​​elementos móveis de DNA (transpósons)​​são uma fonte​​importante de alterações​
​genômicas, pois são sequências parasitas de DNA capazes de se disseminar pelos​
​genomas, frequentemente interrompendo a função ou alterando a regulação de genes​
​existentes, e às vezes criando novos genes por fusões. Quase metade do DNA do​
​genoma humano consiste em vestígios de eventos de transposição passados.​
​●​ ​As diferenças entre os genomas de espécies vivas hoje são o resultado de mais de 3​
​bilhões de anos de acúmulo de alterações. As​​árvores​​filogenéticas​​, baseadas na​
​comparação de sequências de genes e proteínas, descrevem a divergência evolutiva​
​entre as espécies. A grande similaridade entre os genes humanos e de chimpanzés, por​
​exemplo, é principalmente devido ao curto período de tempo para o acúmulo de​
​mutações.​
​●​ ​As alterações nas sequências de genes ou proteínas tendem a ocorrer a uma taxa​
​praticamente constante, fornecendo um​​relógio molecular​​para a evolução​​. Este​
​relógio anda mais rapidamente em sequências não sujeitas à​​seleção de purificação​
​(seleção que elimina mutações prejudiciais), como porções de íntrons não processadas,​
​a terceira posição de códons sinônimos, e pseudogenes (genes inativados por​
​mutações). Anda mais lentamente para sequências sob fortes restrições funcionais,​
​como as sequências de aminoácidos de proteínas que interagem com muitas outras, ou​
​sequências de RNA ribossômico.​
​●​ ​Em animais, o​​DNA mitocondrial​​tem um relógio molecular​​muito mais rápido do que o​
​13​

​ NA nuclear devido a uma taxa de mutação excepcionalmente alta. Categorias de DNA​


D
​com relógios mais rápidos são mais informativas para eventos evolutivos recentes (ex:​
​divergência entre Neandertais e Homo sapiens), enquanto as mais lentas são usadas​
​para eventos mais primitivos (ex: divergência entre bactérias, arqueias e eucariotos,​
​usando sequências de RNA ribossômico).​
​●​ ​Os relógios moleculares, quando bem escolhidos, oferecem uma definição temporal​
​mais específica e um guia mais confiável para as árvores filogenéticas do que os​
​métodos clássicos baseados em semelhanças anatômicas e de desenvolvimento.​
​●​ ​A comparação entre cromossomos humanos e de camundongos revela como a​
​estrutura dos genomas diverge. Embora os genomas tenham tamanhos e conjuntos de​
​genes semelhantes, a organização diverge significativamente, com cerca de 180​
​eventos de quebra e religação nas duas linhagens. No entanto, grandes blocos de DNA​
​mantêm a mesma ordem de genes, chamados​​regiões de​​sintenia​​.​
​●​ ​Pequenos blocos de sequência de DNA são removidos e adicionados aos genomas em​
​uma velocidade alta. Comparando genomas, camundongos perderam​
​aproximadamente 45% do genoma ancestral, enquanto humanos perderam 25%, mas a​
​aquisição de sequências por duplicações cromossômicas e transpósons compensou​
​essas perdas.​
​●​ ​A​​adição de DNA​​nos genomas ocorre pela​​duplicação​​espontânea de segmentos​
​cromossômicos​​(normalmente de dezenas de milhares​​de pares de nucleotídeos) e​
​pela​​inserção de novas cópias de transpósons ativos​​.​​Muitos eventos de​
​transposição são duplicativos, com o transpóson original permanecendo e uma cópia se​
​inserindo em um novo sítio.​
​●​ ​O​​tamanho do genoma de um vertebrado reflete as taxas​​relativas de adição e​
​perda de DNA​​em uma linhagem. O peixe-baiacu,​​Fugu​​rubripes​​, tem um genoma​
​mínimo para um vertebrado (0,4 bilhão de pares de nucleotídeos) devido ao pequeno​
​tamanho de seus íntrons e à ausência de DNA repetitivo em segmentos não​
​codificadores. Apesar disso, as posições dos íntrons em​​Fugu​​são quase as mesmas​
​encontradas em genomas de mamíferos. Acredita-se que o genoma reduzido do​​Fugu​
​seja resultado de uma taxa de adição de DNA muito reduzida ao longo de milhares de​
​anos, levando a uma "limpeza" do genoma, mantendo as sequências funcionalmente​
​importantes por seleção de purificação.​
​●​ ​Genomas ancestrais muito antigos não podem ser diretamente observados devido à​
​degradação do DNA. No entanto, é possível obter informações de sequências de DNA​
​de amostras ancestrais menos primitivas, como a reconstrução do genoma do homem​
​de Neandertal a partir de fragmentos ósseos de mais de 100 mil anos.​
​●​ ​Para ancestrais mais antigos, as sequências genômicas podem ser deduzidas​
​comparando simultaneamente sequências de DNA de diversas espécies modernas. Por​
​exemplo, as sequências de dezenas de mamíferos placentários podem ser usadas para​
​deduzir muito da sequência genômica do ancestral comum de 100 milhões de anos.​
​●​ ​Comparações multiespécies identificam​​sequências de​​DNA conservadas com​
​função desconhecida​​. Uma quantidade surpreendente​​de sequências de DNA não​
​codificadoras foi conservada durante a evolução dos mamíferos, a maioria delas curtas​
​(50 a 200 pares de nucleotídeos). As​​"sequências não​​codificadoras​
​ultraconservadas"​​são segmentos com mais de 100 nucleotídeos​​que são exatamente​
​os mesmos em humanos, camundongos e ratos, muitos deles inalterados desde a​
​divergência de aves e mamíferos há 300 milhões de anos. Essa rigorosa conservação​
​sugere uma função importante mantida pela seleção de purificação, mas a natureza​
​14​

​ xata dessas funções é desconhecida.​


e
​●​ ​Muitas das sequências conservadas não codificadoras produzem​​moléculas de RNA​
​não traduzido​​, como os milhares de​​RNAs não codificadores​​longos (lncRNAs)​​, que​
​parecem desempenhar funções importantes na regulação da expressão gênica. Outras​
​são pequenas regiões de DNA que direcionam a ligação de proteínas envolvidas na​
​regulação gênica. No entanto, a função da maioria desse DNA conservado permanece​
​sem explicação, destacando a necessidade de mais pesquisas.​
​●​ ​Alterações em sequências previamente conservadas podem ajudar a decifrar etapas​
​críticas na evolução. A busca por alterações aceleradas em sequências conservadas​
​entre humanos e chimpanzés identificou​​Regiões Aceleradas​​Humanas (HARs)​​, que​
​são sequências de DNA que acumularam alterações nucleotídicas excepcionalmente​
​rápido durante os 6 milhões de anos de evolução humana. Essas HARs podem refletir​
​funções vantajosas que nos diferenciam. Um quarto das HARs identificadas estão​
​próximas a genes associados ao desenvolvimento neural. A HAR1F, um RNA não​
​codificador de 118 nucleotídeos, é expressa no córtex cerebral humano durante um​
​período decisivo do desenvolvimento cerebral.​
​●​ ​Deleções de sequências conservadas em outras espécies, mas ausentes em humanos,​
​também foram estudadas. Muitas dessas deleções afetam regiões que regulam a​
​expressão de genes próximos, frequentemente associados à função neural ou​
​sinalização por esteroides, sugerindo sua importância na evolução humana.​
​●​ ​Mutações nas sequências de DNA que controlam a expressão gênica​
​impulsionaram muitas das alterações evolutivas em vertebrados​​. Novas​
​sequências reguladoras de DNA que surgiram na evolução dos vertebrados estão​
​associadas a genes que codificam proteínas reguladoras de transcrição, proteínas​
​envolvidas na organização do desenvolvimento embrionário, receptores de sinalização​
​extracelular e proteínas que atuam na modificação pós-traducional. Isso sugere que a​
​lógica da rede de regulação gênica em vertebrados foi estabelecida precocemente, com​
​alterações evolutivas mais recentes focando no aprimoramento de parâmetros​
​quantitativos.​
​●​ ​A​​duplicação gênica também fornece uma fonte importante​​de novidades​
​genéticas​​durante a evolução, criando novos genes​​e modificando os existentes.​
​Genes foram repetidamente duplicados, e as cópias divergiram para atuar em novas​
​funções, criando famílias de genes.​
​●​ ​A duplicação gênica ocorre em altas taxas em todas as linhagens evolutivas,​
​contribuindo para a adição de DNA. Duplicações de segmentos (50 mil a 250 mil pares​
​de nucleotídeos) são comuns e parecem resultar de erros na replicação do DNA ou​
​reparo inexato de quebras cromossômicas. Eventos de duplicação criaram mais​
​diferenças entre humanos e chimpanzés do que as substituições de nucleotídeos.​
​●​ ​Os destinos dos genes recém-duplicados são:​
​○​ ​Perda de função​​: Na maioria dos casos, uma cópia pode​​ser inativada por​
​mutações, tornando-se um​​pseudogene​​. A similaridade​​de sequência entre o​
​pseudogene e o gene funcional diminui com o tempo devido ao acúmulo de​
​mutações.​
​○​ ​Duplicação e divergência​​: Ambas as cópias permanecem​​funcionais, mas​
​divergem na sequência e no padrão de expressão, assumindo funções​
​diferentes. Esse processo explica a presença de grandes famílias de genes​
​relacionados em organismos complexos e é importante para o aumento da​
​complexidade biológica.​
​15​

​●​ A ​ ​​duplicação de genomas inteiros​​é um exemplo crítico de duplicação e divergência,​


​comum em fungos e plantas. Em mamíferos, é incerto se houve duplicação total do​
​genoma ou uma série de duplicações de segmentos.​
​●​ ​Estudos no genoma do peixe-zebra, que teve pelo menos uma duplicação de genoma​
​inteiro, revelaram que 30% a 50% das cópias duplicadas de genes divergiram​
​funcionalmente e permaneceram ativas. Muitas vezes, a diferença funcional mais óbvia​
​é a expressão em diferentes tecidos ou estágios de desenvolvimento. Uma teoria​
​sugere que mutações levemente deletérias em ambas as cópias as protegem da perda,​
​e elas então adquirem características novas e especializadas.​
​●​ ​A​​evolução da família de genes da globina​​exemplifica​​como a duplicação produz​
​proteínas novas. As globinas derivam de um gene ancestral comum. A hemoglobina,​
​que transporta oxigênio, evoluiu de uma cadeia polipeptídica de globina simples para​
​uma molécula de quatro cadeias (duas alfa e duas beta), permitindo um transporte de​
​oxigênio mais eficiente por meio de interações alostéricas cooperativas.​
​●​ ​No genoma humano, os genes da b-globina estão dispostos em um cromossomo, e os​
​da a-globina em outro, resultado de uma translocação na linhagem de aves e​
​mamíferos há cerca de 300 milhões de anos.​
​●​ ​Existem​​pseudogenes de globina​​nos blocos de genes,​​que são sequências​
​duplicadas, mas inativadas por mutações que impedem sua expressão como proteínas​
​funcionais.​
​●​ ​Genes que codificam novas proteínas podem ser criados pela recombinação de​
​éxons​​. Cada éxon geralmente codifica um domínio proteico.​​A organização em éxons​
​separados por íntrons longos facilitou a evolução de novas proteínas, permitindo​
​duplicações por quebra e religação em múltiplos sítios dentro dos íntrons, sem perturbar​
​o domínio.​
​●​ ​As sequências genômicas mostram que éxons e elementos reguladores funcionaram​
​como elementos modulares, que foram duplicados e se moveram pelo genoma, criando​
​a diversidade da vida.​
​●​ ​Mutações neutras​​(nem prejudiciais nem benéficas)​​também se difundem e são fixadas​
​na população, contribuindo significativamente para as alterações evolutivas dos​
​genomas. A probabilidade de fixação de uma nova mutação neutra em uma população​
​diploide de tamanho constante N é de aproximadamente 1/(2N).​
​●​ ​A variação entre humanos:​
​○​ ​Duas pessoas aleatoriamente escolhidas tipicamente diferem em cerca de​​0,1%​
​de suas sequências de DNA​​.​
​○​ ​Variações no número de cópias (CNVs - copy number variations)​​:​
​Diferenças envolvendo perda ou ganho de longos blocos de DNA, totalizando​
​cerca de 3 milhões de pares de nucleotídeos por indivíduo, muitas vezes​
​contendo genes conhecidos. CNVs estão associadas a traços humanos como​
​daltonismo, infertilidade, hipertensão e suscetibilidades a doenças.​
​○​ ​Polimorfismos de um único nucleotídeo (SNPs - single-nucleotide​
​polymorphisms)​​: Mutações pontuais na sequência genômica​​onde uma grande​
​proporção da população humana possui um nucleotídeo, e outra parte​
​substancial possui outro. Dois genomas humanos escolhidos aleatoriamente​
​diferirão em aproximadamente 2,5 milhões de SNPs (1 a cada 1.300 pares de​
​nucleotídeos). A maioria dos SNPs tem pouco ou nenhum efeito na aptidão​
​humana.​
​○​ ​Repetições CA (microssatélites)​​: Sequências com o​​motivo (CA)n que se​
​16​

r​ eplicam com baixa fidelidade devido a deslizamentos durante a replicação,​


​resultando em grande variabilidade no número de repetições (n) entre genomas,​
​sendo marcadores genéticos ideais.​
​ ​ ​Um desafio crucial da genética humana é reconhecer as poucas variações​

​funcionalmente importantes em meio a uma enorme quantidade de variações neutras e​
​sem consequências. As variações podem modificar proteínas, alterar a dosagem de​
​genes e ter efeitos drásticos no desenvolvimento, saúde, fisiologia, comportamento e​
​físico humanos.​

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