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plot_precision_recall_curve

时间: 2023-05-31 14:19:41 浏览: 322
### 回答1: plot_precision_recall_curve是一个Python函数,用于绘制精确度-召回率曲线。该曲线是评估分类模型性能的一种常用方法,可以帮助我们了解模型在不同阈值下的表现,并选择最佳的阈值来平衡精确度和召回率。在绘制曲线时,我们需要提供模型的预测结果和真实标签,函数会自动计算出不同阈值下的精确度和召回率,并将结果绘制成曲线。 ### 回答2: plot_precision_recall_curve是一个Python库函数,用于绘制精确度-召回率曲线。精确度-召回率曲线是评估分类算法性能的一种方法,它可以帮助我们了解分类算法在预测中的表现。 精确度(precision)和召回率(recall)是用于评估分类算法性能的两种指标: - 精确度是指被正确分类的正例数目占被分类为正例的总数的比例。即:precision = TP / (TP + FP),其中TP表示真正例,FP表示假正例。 - 召回率是指被正确分类的正例数目占实际正例总数的比例。即:recall = TP / (TP + FN),其中TP表示真正例,FN表示假反例。 在分类问题中,我们希望同时最大化精确度和召回率,因为这两个指标的平衡是分类算法的重要性能指标之一。精确度-召回率曲线可以帮助我们确定分类算法在不同阈值下的表现,并帮助我们选择最佳阈值。 在使用plot_precision_recall_curve函数之前,我们需要准备好分类器、测试数据和标签。函数接受以下参数: - estimator:已训练的分类器。 - X:测试数据。 - y:实际标签。 - name:曲线名称。 - ax:可选,matplotlib绘图坐标轴对象。 函数会返回一个matplotlib的AxesSubplot对象,可以用它来进一步修改曲线的样式和标签。 总之,plot_precision_recall_curve可以帮助我们更好地了解分类算法在不同阈值下的表现,帮助我们选择最佳阈值,提高分类模型的性能。 ### 回答3: plot_precision_recall_curve是一种用于评估分类模型性能的常见函数。该函数旨在帮助了解模型在预测过程中精确率和召回率的平衡。 plot_precision_recall_curve通常用于二元分类问题,即将样本分为两个类别,例如:“是”或“否”,“真”或“假”。在这种情况下,函数绘制的曲线显示了分类器根据不同的阈值(可能的预测概率某个类别的阈值)的预测能力。曲线上的每个点对应于一个阈值,其X轴值是召回率,即所有正例中正确分类的比率,其Y轴值是精确率,即被分类为正例中实际为正例的比率。因此,这个函数的一个重要实际应用是帮助确定一个阈值,该阈值可以达到一个良好的预测精度下,采取分类器的某种预测策略。 当绘制的曲线更加靠近左上角时,我们可以认为分类器的性能更优(因为在更多的召回率和精确率情况下,分类器实现了更高的精度)。此外,该函数还提供了平均精确率( Average Precision)的计算,这个指标考察分类器在不同阈值下的精确率,并将这些值取平均数得出。这个值越高,表示分类器的性能越好。 总之,plot_precision_recall_curve函数是一个有用的分类器性能分析工具,它可以帮助我们评估二元分类模型的精确度和召回率,并支持在不同的阈值下比较不同的模型,从而帮助我们选择最佳的预测策略。
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def ap_per_class(tp, conf, pred_cls, target_cls, plot=False, save_dir='.', names=()): """ Compute the average precision, given the recall and precision curves. Source: https://github.com/rafaelpadilla/Object-Detection-Metrics. # Arguments tp: True positives (nparray, nx1 or nx10). conf: Objectness value from 0-1 (nparray). pred_cls: Predicted object classes (nparray). target_cls: True object classes (nparray). plot: Plot precision-recall curve at [email protected] save_dir: Plot save directory # Returns The average precision as computed in py-faster-rcnn. """ # Sort by objectness i = np.argsort(-conf) tp, conf, pred_cls = tp[i], conf[i], pred_cls[i] # Find unique classes unique_classes = np.unique(target_cls) nc = unique_classes.shape[0] # number of classes, number of detections # Create Precision-Recall curve and compute AP for each class px, py = np.linspace(0, 1, 1000), [] # for plotting ap, p, r = np.zeros((nc, tp.shape[1])), np.zeros((nc, 1000)), np.zeros((nc, 1000)) for ci, c in enumerate(unique_classes): i = pred_cls == c n_l = (target_cls == c).sum() # number of labels n_p = i.sum() # number of predictions if n_p == 0 or n_l == 0: continue else: # Accumulate FPs and TPs fpc = (1 - tp[i]).cumsum(0) tpc = tp[i].cumsum(0) # Recall recall = tpc / (n_l + 1e-16) # recall curve r[ci] = np.interp(-px, -conf[i], recall[:, 0], left=0) # negative x, xp because xp decreases # Precision precision = tpc / (tpc + fpc) # precision curve p[ci] = np.interp(-px, -conf[i], precision[:, 0], left=1) # p at pr_score # AP from recall-precision curve for j in range(tp.shape[1]): ap[ci, j], mpre, mrec = compute_ap(recall[:, j], precision[:, j]) if plot and j == 0: py.append(np.interp(px, mrec, mpre)) # precision at [email protected] # Compute F1 (harmonic mean of precision and recall) f1 = 2 * p * r / (p + r + 1e-16) if plot: plot_pr_curve(px, py, ap, Path(save_dir) / 'PR_curve.png', names) plot_mc_curve(px, f1, Path(save_dir) / 'F1_curve.png', names, ylabel='F1') plot_mc_curve(px, p, Path(save_dir) / 'P_curve.png', names, ylabel='Precision') plot_mc_curve(px, r, Path(save_dir) / 'R_curve.png', names, ylabel='Recall') i = f1.mean(0).argmax() # max F1 index return p[:, i], r[:, i], ap, f1[:, i], unique_classes.astype('int32')

from sklearn.metrics import classification_report, confusion_matrix, roc_curve, auc import numpy as np import matplotlib.pyplot as plt import seaborn as sns # 预测概率 y_pred_logits = bert_model.predict(test_ds).logits y_pred_prob = tf.nn.sigmoid(y_pred_logits).numpy().reshape(-1) y_pred = (y_pred_prob > 0.5).astype(int) # 提取真实标签 y_true = np.concatenate([y for _, y in test_ds], axis=0) # 计算F1分数、精确率和召回率 report = classification_report(y_true, y_pred, target_names=['类别0', '类别1']) print("\n分类报告:") print(report) # 计算混淆矩阵 cm = confusion_matrix(y_true, y_pred) print("\n混淆矩阵:") print(cm) # 绘制混淆矩阵热图 plt.figure(figsize=(8, 6)) sns.heatmap(cm, annot=True, fmt='d', cmap='Blues', xticklabels=['预测负例', '预测正例'], yticklabels=['实际负例', '实际正例']) plt.title('混淆矩阵') plt.xlabel('预测标签') plt.ylabel('实际标签') plt.show() # 绘制ROC曲线 fpr, tpr, thresholds = roc_curve(y_true, y_pred_prob) roc_auc = auc(fpr, tpr) plt.figure(figsize=(8, 6)) plt.plot(fpr, tpr, color='darkorange', lw=2, label=f'ROC曲线 (AUC = {roc_auc:.2f})') plt.plot([0, 1], [0, 1], color='navy', lw=2, linestyle='--') plt.xlim([0.0, 1.0]) plt.ylim([0.0, 1.05]) plt.xlabel('假正例率 (FPR)') plt.ylabel('真正例率 (TPR)') plt.title('ROC曲线') plt.legend(loc="lower right") plt.show() # 绘制PR曲线 from sklearn.metrics import precision_recall_curve, average_precision_score precision, recall, _ = precision_recall_curve(y_true, y_pred_prob) average_precision = average_precision_score(y_true, y_pred_prob) plt.figure(figsize=(8, 6)) plt.plot(recall, precision, color='blue', lw=2, label=f'PR曲线 (AP = {average_precision:.2f})') plt.xlim([0.0, 1.0]) plt.ylim([0.0, 1.05]) plt.xlabel('召回率') plt.ylabel('精确率') plt.title('精确率-召回率曲线') plt.legend(loc="upper right") plt.show()这个代码报错AttributeError: 'Tokenizer' object has no attribute 'vocab_size'

from sklearn.datasets import load_iris from sklearn. model_selection import train_test_split from sklearn.metrics import classification_report from sklearn. neighbors import KNeighborsClassifier from sklearn. metrics import roc_curve, auc import matplotlib.pyplot as plt from sklearn. metrics import confusion_matrix import seaborn as sns import scikitplot as skplt #加载数据集 iris = load_iris() data = iris['data'] label = iris['target'] #数据集的划分 x_train,x_test,y_train,y_test = train_test_split(data,label,test_size=0.3) print(x_train) #模型构建 model = KNeighborsClassifier(n_neighbors=5) model.fit(x_train,y_train) #模型评估 #(1)精确率,召回率,F1分数,准确率(宏平均和微平均) predict = model. predict(x_test) result = classification_report(y_test,predict) print(result) # (2) 混淆矩阵 confusion_matrix = confusion_matrix(y_test, predict) print('混淆矩阵:', confusion_matrix) sns.set(font_scale=1) sns.heatmap(confusion_matrix, annot=True, annot_kws={"size", 16}, cmap=plt.cm.Blues) plt.title('Confusion Matrix') plt.ylabel('True label' ) plt.xlabel('Predicted label') plt.savefig('Confusion matrix. pdf') plt.show() #(3)ROC曲线 Y_pred_prob = model. predict_proba(x_test) plt.figure(figsize= (7,7)) ax= plt. subplot() skplt.metrics.plot_roc_curve(y_test,Y_pred_prob,ax= ax) ax.set_xlabel('False Positive Rate', fontsize = 20) ax.set_ylabel('True Positive Rate ',fontsize = 20) ax.set_title('ROC Areas ',fontsize = 20) plt.xlim((0, 1)) plt.ylim((0, 1)) plt.xticks(fontsize = 18) plt.yticks(fontsize = 18) plt.legend(fontsize =18) plt.savefig(' ROC.pdf') plt.show( ) #(4)P_R曲线 from sklearn.metrics import precision_recall_curve precision, recall, _ =precision_recall_curve(y_test) plt.fill_between(recall, precision,color='b') plt.xlabel('Recall') plt.ylabel('Precision') plt.ylim([0.0, 1.0]) plt.xlim([0.0, 1.0]) plt.plot(recall, precision) plt.title("Precision-Recall") plt.show()

data = pd.read_excel('C:/lydata/test4.xlsx') X = data.drop('HER2_G', axis=1) y = data['HER2_G'] X_train, X_test, y_train, y_test = train_test_split(X, y, test_size=0.3, stratify=y, random_state=42) kf = KFold(n_splits=5, shuffle=True, random_state=42) accuracy_scores = [] precision_scores = [] recall_scores = [] f1_scores = [] auc_scores = [] total_confusion_matrix = np.zeros((len(np.unique(y_train)), len(np.unique(y_train))), dtype=int) pipeline = Pipeline([ ('smote', SMOTE(k_neighbors=3, sampling_strategy=0.8, random_state=42)), ('scaler', RobustScaler()), ('gb', GradientBoostingClassifier( learning_rate=0.04, n_estimators=829, subsample=0.79, min_samples_split=2, min_samples_leaf=1, max_depth=4, random_state=42, warm_start=True, tol=0.0001, ccp_alpha=0, max_features=10, )) ]) # 存储每个折的 FPR、TPR 和 AUC fprs = [] tprs = [] aucs = [] for train_index, val_index in kf.split(X_train): X_train_fold, X_val = X.iloc[train_index], X.iloc[val_index] y_train_fold, y_val = y.iloc[train_index], y.iloc[val_index] pipeline.fit(X_train_fold, y_train_fold) y_pred = pipeline.predict(X_val) y_proba = pipeline.predict_proba(X_val)[:, 1] accuracy_scores.append(accuracy_score(y_val, y_pred)) precision_scores.append(precision_score(y_val, y_pred)) recall_scores.append(recall_score(y_val, y_pred)) f1_scores.append(f1_score(y_val, y_pred)) auc_scores.append(roc_auc_score(y_val, y_proba)) cm = confusion_matrix(y_val, y_pred) total_confusion_matrix += cm # 计算 ROC 曲线所需指标 fpr, tpr, _ = roc_curve(y_val, y_proba) fprs.append(fpr) tprs.append(tpr) aucs.append(roc_auc_score(y_val, y_proba)) accuracy = np.mean(accuracy_scores) precision = np.mean(precision_scores) recall = np.mean(recall_scores) f1 = np.mean(f1_scores) auc = np.mean(auc_scores) print("Gradient Boosting 参数:") print(pipeline.named_steps['gb'].get_params()) print(f"Gradient Boosting 平均 accuracy: {accuracy:.2f}") print(f"Gradient Boosting 平均 precision: {precision:.2f}") print(f"Gradient Boosting 平均 recall: {recall:.2f}") print(f"Gradient Boosting 平均 F1 score: {f1:.2f}") print(f"Gradient Boosting 平均 AUC score: {auc:.2f}") print("综合混淆矩阵:") print(total_confusion_matrix) pipeline.fit(X_train, y_train) y_test_pred = pipeline.predict(X_test) y_test_proba = pipeline.predict_proba(X_test)[:, 1] accuracy_test = accuracy_score(y_test, y_test_pred) precision_test = precision_score(y_test, y_test_pred) recall_test = recall_score(y_test, y_test_pred) f1_test = f1_score(y_test, y_test_pred) auc_test = roc_auc_score(y_test, y_test_proba) print(f"测试集 accuracy: {accuracy_test:.2f}") print(f"测试集 precision: {precision_test:.2f}") print(f"测试集 recall: {recall_test:.2f}") print(f"测试集 F1 score: {f1_test:.2f}") print(f"测试集 AUC score: {auc_test:.2f}") cm_test = confusion_matrix(y_test, y_test_pred) print("测试集混淆矩阵:") print(cm_test) # 绘制各个折的 ROC 曲线 plt.figure(figsize=(10, 8)) for i in range(len(fprs)): plt.plot(fprs[i], tprs[i], label=f'Fold {i + 1} (AUC = {aucs[i]:.2f})') plt.plot([0, 1], [0, 1], color='navy', linestyle='--') plt.xlim([0.0, 1.0]) plt.ylim([0.0, 1.05]) plt.xlabel('False Positive Rate') plt.ylabel('True Positive Rate') plt.title('ROC Curve for Each Fold in 5-Fold Cross-validation') plt.legend(loc="lower right") plt.show() 这个代码我要画出五折交叉验证循环中的各个roc曲线,为什么有四折都是一

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