首页编写一个python脚本，输入三个txt文件，将第一列的rna_name提取出来作韦恩图，输出该韦恩图以及交集的txt文件

编写一个python脚本，输入三个txt文件，将第一列的rna_name提取出来作韦恩图，输出该韦恩图以及交集的txt文件

时间: 2023-11-28 20:47:35 浏览: 108

以下是一个基于Python的脚本，可以实现提取三个txt文件中第一列的rna_name，并将其可视化为韦恩图，并输出交集的txt文件。 ```python import matplotlib.pyplot as plt from matplotlib_venn import venn3 import os # 读取三个txt文件 file1 = open('file1.txt','r') file2 = open('file2.txt','r') file3 = open('file3.txt','r') # 提取rna_name rna_name1 = set([line.split()[0] for line in file1]) rna_name2 = set([line.split()[0] for line in file2]) rna_name3 = set([line.split()[0] for line in file3]) # 生成韦恩图 venn3([rna_name1, rna_name2, rna_name3], ('file1', 'file2', 'file3')) plt.title('RNA Venn Diagram') # 输出交集的txt文件 intersection = rna_name1 & rna_name2 & rna_name3 output_file = open('intersection.txt', 'w') for name in intersection: output_file.write(name + '\n') output_file.close() # 显示韦恩图 plt.show() ``` 在该脚本中，我们首先使用Python的文件读取方法，读取三个txt文件。然后，我们使用列表解析式和split()方法提取每个文件中所有行的第一列rna_name，并将其存储在三个集合中。接下来，我们使用matplotlib_venn库的venn3()函数创建韦恩图，并将三个集合作为参数传递。我们还使用plt.title()方法添加图表标题。最后，我们使用Python的集合交集运算符&获取三个集合之间的交集，并将其写入一个新的txt文件intersection.txt中。该脚本可以通过以下方式运行： ```bash python venn_diagram.py ``` 其中，file1.txt、file2.txt和file3.txt是输入的三个txt文件，intersection.txt是输出的txt文件，venn_diagram.py是脚本的文件名。

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