def evaluate(model, loader, criterion): model.eval() total_loss = 0 all_labels, all_probs = [], [] with torch.no_grad(): for x, y in loader: x, y = x.to(device), y.to(device) outputs = model(x) loss = criterion(outputs, y) total_loss += loss.item() # 获取概率 probs = torch.softmax(outputs, dim=1) all_probs.extend(probs.cpu().numpy()) all_labels.extend(y.cpu().numpy()) all_labels = np.array(all_labels) all_probs = np.array(all_probs) n_classes = all_probs.shape[1] # 计算 AUROC if n_classes == 2: auroc = roc_auc_score(all_labels, all_probs[:, 1]) else: auroc = roc_auc_score( all_labels, all_probs, multi_class='ovr', average='weighted' ) # 计算 AUPRC if n_classes == 2: # 二分类:直接使用正类概率 auprc = average_precision_score(all_labels, all_probs[:, 1]) else: # 多分类:对每个类别计算 PR 曲线面积,再加权平均 from sklearn.preprocessing import label_binarize y_true_bin = label_binarize(all_labels, classes=np.arange(n_classes)) auprc_list = [] for i in range(n_classes): precision, recall, _ = precision_recall_curve( y_true_bin[:, i], all_probs[:, i] ) auprc_i = auc(recall, precision) # 注意顺序:recall在前,precision在后 auprc_list.append(auprc_i) # 按类别样本数加权平均 class_counts = np.sum(y_true_bin, axis=0) auprc = np.average(auprc_list, weights=class_counts) # 其他指标 all_preds = np.argmax(all_probs, axis=1) metrics = { 'accuracy': accuracy_score(all_labels, all_preds), 'f1': f1_score(all_labels, all_preds, average='weighted'), 'auroc': auroc, 'auprc': auprc } return total_loss / len(loader), metrics修改为将预测的结果输出到一个文件夹里
时间: 2025-04-07 20:04:58 浏览: 40
<think>好的,我现在需要帮助用户修改他们的Python代码,将模型评估时的预测结果输出到一个文件夹里。用户给出的原始函数是`evaluate`,它计算损失和多个指标,包括准确率、F1分数、AUROC和AUPRC。现在需要将预测结果保存到文件夹中。
首先,我需要明确用户的需求。用户希望将预测结果输出到文件夹,可能包括模型的预测概率、真实标签以及其他相关信息。可能需要保存为文件,比如CSV或NPZ格式。
接下来,我需要考虑如何修改现有的函数。原始函数中已经有了`all_labels`和`all_probs`,这两个变量分别存储了真实标签和预测的概率。此外,`all_preds`是通过取`all_probs`的argmax得到的预测类别。因此,保存这些数据应该足够。
可能的步骤包括:
1. 在函数参数中添加一个输出路径的参数,比如`output_dir`,默认为None。如果提供了路径,就保存文件。
2. 在函数结束时,检查`output_dir`是否存在,如果不存在则创建。
3. 将`all_labels`、`all_probs`、`all_preds`保存到文件中。常见的格式有CSV,方便查看,或者NPZ/NPY,方便后续加载处理。
4. 使用Pandas将数据保存为CSV可能更直观,因为可以包含列名,比如各类的概率、真实标签、预测类别。
需要考虑的问题:
- 如何处理多分类情况下的概率列名?例如,如果有n_classes个类别,可能需要生成对应的列名,如prob_0, prob_1等。
- 是否需要将tensor转换为numpy数组?在原始代码中,`all_probs`和`all_labels`已经是numpy数组,所以可以直接使用。
- 如果输出路径不存在,是否需要自动创建?是的,可以使用`os.makedirs(output_dir, exist_ok=True)`来创建目录。
- 保存的文件名应该明确,比如predictions.csv。
修改后的函数应该在返回之前将数据保存到指定目录。此外,需要确保当`output_dir`为None时,不执行保存操作,以保持向后兼容性。
现在,具体的代码修改可能如下:
1. 在函数定义中添加`output_dir=None`参数。
2. 在计算完`all_preds`之后,检查`output_dir`是否存在,如果存在,则创建DataFrame并保存。
3. 创建DataFrame时,包括真实标签、预测标签以及每个类别的概率。
4. 使用Pandas的to_csv方法保存,设置index=False以避免额外的索引列。
例如:
if output_dir is not None:
import os
import pandas as pd
os.makedirs(output_dir, exist_ok=True)
df = pd.DataFrame({
'true_label': all_labels,
'predicted_label': all_preds
})
# 添加每个类别的概率列
for i in range(n_classes):
df[f'prob_class_{i}'] = all_probs[:, i]
df.to_csv(os.path.join(output_dir, 'predictions.csv'), index=False)
这样修改后,当调用evaluate函数时,如果指定了output_dir,就会生成CSV文件。需要确保导入所需的库,如os和pandas,但用户可能需要安装pandas,如果之前没有安装的话,可能需要提示用户。
另外,需要测试多分类和二分类情况下的列名是否正确。例如,二分类时,prob_class_0和prob_class_1都会被保存,但用户可能只需要其中一个,不过保留所有类别概率更为通用。
最后,确保在函数中处理了所有必要的异常情况,比如路径权限问题,但通常这些需要用户自行处理,代码中不做额外处理。</think>要将预测结果输出到文件夹,需要修改`evaluate`函数以增加保存预测结果的功能。以下是修改后的代码:
```python
import os
import pandas as pd
import numpy as np
def evaluate(model, loader, criterion, output_dir=None):
model.eval()
total_loss = 0
all_labels, all_probs = [], []
with torch.no_grad():
for x, y in loader:
x, y = x.to(device), y.to(device)
outputs = model(x)
loss = criterion(outputs, y)
total_loss += loss.item()
probs = torch.softmax(outputs, dim=1)
all_probs.extend(probs.cpu().numpy())
all_labels.extend(y.cpu().numpy())
all_labels = np.array(all_labels)
all_probs = np.array(all_probs)
n_classes = all_probs.shape[1]
all_preds = np.argmax(all_probs, axis=1)
# 保存预测结果
if output_dir is not None:
os.makedirs(output_dir, exist_ok=True)
# 创建包含预测结果的DataFrame
df = pd.DataFrame({
'true_label': all_labels,
'predicted_label': all_preds
})
# 添加每个类别的概率列
for i in range(n_classes):
df[f'prob_class_{i}'] = all_probs[:, i]
# 保存到CSV文件
output_path = os.path.join(output_dir, 'predictions.csv')
df.to_csv(output_path, index=False)
print(f"预测结果已保存至 {output_path}")
# 后续的指标计算保持不变...
# [原有计算AUROC/AUPRC和其他指标的代码]
return total_loss / len(loader), metrics
```
**修改说明**:
1. 新增`output_dir`参数控制输出目录
2. 使用`pd.DataFrame`整合以下内容:
- 真实标签 (`true_label`)
- 预测标签 (`predicted_label`)
- 每个类别的预测概率 (`prob_class_0`, `prob_class_1`...)
3. 自动创建输出目录 (`os.makedirs`)
4. 保存为CSV格式,保留完整概率信息
5. 保持原有指标计算逻辑不变
**调用示例**:
```python
loss, metrics = evaluate(
model=your_model,
loader=test_loader,
criterion=nn.CrossEntropyLoss(),
output_dir="./predictions" # 指定输出目录
)
```
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