python nii格式 unint转化为为int

### 将NIfTI (nii) 文件中的 uint 数据类型转换为 int 类型 为了处理 NIfTI (.nii) 文件并将其数据类型的 unsigned integer (uint) 转换为 signed integer (int)，可以使用 `nibabel` 库来加载 nii 文件，并利用 NumPy 进行数据类型转换。 #### 安装所需库 如果尚未安装所需的 Python 包，则可以通过 pip 来安装： ```bash pip install nibabel numpy ``` #### 加载和转换数据类型 下面是一个完整的例子，展示如何读取 .nii 文件并将其中的数据从无符号整数（例如 uint8 或 uint16）转换成有符号整数（例如 int16 或 int32），这取决于原始图像的具体情况以及目标应用的需求[^1]。 ```python import nibabel as nib import numpy as np def convert_uint_to_int(nifti_file_path, output_dtype=np.int16): """ 该函数用于将给定路径下的 NIfTI 图像文件由其当前的 uint 格式转换为目标 dtype 的 int 格式. 参数: nifti_file_path (str): 输入 NIfTI 文件的位置 output_dtype (numpy.dtype): 输出数组的目标数据类型，默认为np.int16 返回: converted_img_data (numpy.ndarray): 已经被转换过数据类型的三维或四维影像数据 """ # 使用 nibabel 加载 nii 文件 img = nib.load(nifti_file_path) # 获取原始图像数据及其头信息 original_img_data = img.get_fdata() header_info = img.header.copy() # 执行数据类型转换操作前先检查原图像是不是已经是指定的dtype if original_img_data.dtype != output_dtype: # 对于负值溢出的情况做特殊处理；这里假设输入的是正数范围内的像素值 min_val_possible_for_output_type = np.iinfo(output_dtype).min max_val_possible_for_input_type = np.iinfo(original_img_data.dtype).max # 如果最大可能值超出了新类型的表示能力则进行缩放调整 scale_factor = float(min_val_possible_for_output_type + max_val_possible_for_input_type) / \ float(max_val_possible_for_input_type * 2) scaled_image_data = ((original_img_data.astype(float)) - max_val_possible_for_input_type/2.) * scale_factor +\ (min_val_possible_for_output_type + max_val_possible_for_input_type)/2. # 更新header以反映新的数据类型 header_info.set_data_dtype(output_dtype) # 创建一个新的Nibabel Image对象保存修改后的数据 new_nifti_obj = nib.Nifti1Image(scaled_image_data.astype(output_dtype), affine=img.affine, header=header_info) return new_nifti_obj else: print("The input image is already of the desired data type.") return None # 示例调用此方法 converted_image = convert_uint_to_int('path/to/input.nii', np.int16) if isinstance(converted_image, nib.nifti1.Nifti1Image): # 可选：保存更改到磁盘上的另一个文件 nib.save(converted_image, 'path/to/output_converted.nii') else: print("No conversion was performed because the source and target dtypes were identical.") ```